临床样本炎症特征分析
探究PD患者外周血中的系统性炎症改变。
分离5例PD患者和5例年龄性别匹配的正常对照的PBMCs进行RNA测序,并在31例PD患者和18例正常对照的血清中通过ELISA验证IL-1β和TNF-α水平。
Dual-pathway targeted therapy for Parkinson's disease: Biomimetic nanosomes inhibit ferroptosis and pyroptosis through NLRP3 inflammasome regulation.
包含临床样本转录组与ELISA、体外细胞模型(SH-SY5Y、BV2)功能验证、分子机制(Western blot、RNA-seq)及MPTP小鼠体内行为学和组织学验证,多层证据支持。
SH-SY5Y细胞系 BV2小胶质细胞系 MPTP诱导的C57BL/6小鼠PD模型 PD患者外周血样本
BM@GA-Se纳米体的制备条件:GA与Na2SeO3浓度、AA浓度及反应时间(见2.3节) 体外实验中MPP+处理浓度(4 mM)及BM@GA-Se纳米体处理浓度(1 μg/mL和5 μg/mL) 体内实验中MPTP剂量(30 mg/kg,腹腔注射,连续7天)及BM@GA-Se纳米体剂量(高剂量10 mg/kg,低剂量1 mg/kg,每两天一次) 行为学测试方案:开放场、转棒、爬杆的具体参数及间隔(见2.16节和3.10节)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究PD患者外周血中的系统性炎症改变。
分离5例PD患者和5例年龄性别匹配的正常对照的PBMCs进行RNA测序,并在31例PD患者和18例正常对照的血清中通过ELISA验证IL-1β和TNF-α水平。
合成并表征具有多酶活性和自由基清除能力的仿生纳米体。
通过GA与亚硒酸钠反应合成GA-Se NPs,再挤出包被BV2细胞膜得到BM@GA-Se纳米体。通过TEM、DLS、Zeta电位、蛋白电泳、XRD、XPS、FT-IR、TGA等表征其理化性质。
验证BM@GA-Se纳米体的抗氧化能力。
通过ABTS、DPPH、PTIO、SOD、CAT、GPX活性检测试剂盒评估纳米体的自由基清除和酶模拟活性。
评估BM@GA-Se纳米体穿过血脑屏障的能力。
使用bEnd.3细胞和SH-SY5Y细胞构建体外BBB模型,加入Cy5.5标记的纳米体,通过CLSM观察荧光强度。
验证BM@GA-Se纳米体对MPP+诱导的神经元损伤的保护作用。
使用CCK8和活/死染色评估细胞活力;使用DCFH-DA检测ROS;使用JC-1检测线粒体膜电位;通过Western blot和免疫荧光检测GPX4、ACSL4表达及MDA水平。
预测没食子酸与HSP90的相互作用。
利用数据库筛选靶点,进行GO/KEGG富集、PPI分析、分子对接,并通过SPR验证GA与HSP90的结合。
探究BM@GA-Se纳米体处理对PD模型细胞炎症通路的影响。
对BM@GA-Se处理的PD模型BV2细胞进行RNA测序,鉴定DEGs并进行富集分析,ELISA验证细胞因子。
验证BM@GA-Se纳米体对HSP90/NLRP3/Caspase-1轴的抑制作用。
通过免疫荧光和Western blot检测HSP90、NLRP3、cleaved-caspase-1、cleaved-Gasdermin D、IL-1β、IL-18的表达,并与CY-09抑制剂组比较。
评估BM@GA-Se纳米体在小鼠体内的分布和生物安全性。
通过IVIS成像观察纳米体在体内的分布;通过血液学和血清生化分析及主要器官H&E染色评估14天内的安全性。
评估BM@GA-Se纳米体对MPTP诱导的PD小鼠运动功能和组织病理的改善作用。
建立MPTP诱导PD模型,给予不同剂量BM@GA-Se纳米体,进行行为学测试(开放场、转棒、爬杆),并通过免疫组化检测TH和GPX4表达。
验证BM@GA-Se纳米体在体内抑制焦亡的效果。
通过免疫荧光检测黑质中HSP90、NLRP3、Cl-Gasdermin D、IL-1β的表达,并检测血清细胞因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米体合成 | 没食子酸 | -- | -- |
| 抗坏血酸 | -- | -- | |
| 实验标记 | Cy5.5 NHS酯 | -- | 1469277-96-0 |
| 纳米体合成 | 1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐 | -- | 25952-53-8 |
| 动物模型诱导 | 1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶 | -- | 23007-85-4 |
| 体外细胞损伤诱导 | 1-甲基-4-苯基吡啶碘化物 | GlpBio | GC18188 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | GlpBio | GK10001 |
| 细胞培养 | SH-SY5Y细胞系 | Procell | CL-0208 |
| SH-SY5Y专用培养基 | Procell | CM-0208 | |
| BV2细胞系 | Procell | CL-0493 | |
| BV2专用培养基 | Procell | CM-0493A | |
| 铁死亡抑制对照 | Ferrostatin-1 | MedChemExpress | HY-100579 |
| 焦亡抑制对照 | CY-09 | MedChemExpress | HY-103666 |
| 细胞因子检测 | 人IL-1β ELISA试剂盒 | Beyotime | PI305 |
| 人TNF-α ELISA试剂盒 | Beyotime | PT518 | |
| 酶活检测 | 总超氧化物歧化酶检测试剂盒(WST-8法) | Beyotime | S0101S |
| 总谷胱甘肽过氧化物酶检测试剂盒(NADPH法) | Beyotime | S0058 | |
| 过氧化氢酶检测试剂盒 | Beyotime | S0051 | |
| 脂质过氧化检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| PBMC分离 | 人外周血淋巴细胞分离液 | Beyotime | C0025 |
| 免疫荧光 | 免疫染色固定液 | Beyotime | P0098 |
| 含Triton X-100的免疫染色透化液 | Beyotime | P0096 | |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1005 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1045 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0012 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| Western blot | SDS-PAGE上样缓冲液 | Beyotime | P0015 |
| 免疫荧光 | Cy3标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Beyotime | A0516 |
| Cy3标记的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Beyotime | A0521 | |
| FITC标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Beyotime | A0562 | |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片液 | Beyotime | P0131 | |
| Western blot | 抗cleaved Gasdermin D(Asp276)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 10137 |
| 抗IL-1β小鼠单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 12242 | |
| 抗IL-18兔多克隆抗体 | Zenbio | 516737 | |
| 抗caspase 1兔多克隆抗体 | Zenbio | 341030 | |
| 抗HSP90 alpha/beta兔单克隆抗体 | Zenbio | R24635 | |
| 抗NLRP3小鼠单克隆抗体 | Proteintech | 68102-1-Ig | |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 抗ACSL4抗体 | ABclonal | A14439 | |
| 抗ASC抗体 | Abcam | ab309497 | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab263899 | |
| 抗β-actin抗体 | Wuhan Sanying | 10094-1-ap | |
| 山羊抗兔二抗 | Beyotime | -- | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Beyotime | -- | |
| ROS检测 | 2',7'-二氯荧光素二乙酸酯 | Beyotime | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染料 | -- | -- |
| RNA提取 | SparkZol试剂 | -- | AC0101 |
| 细胞因子检测 | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Jianglai biology | JL18442 |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Jianglai biology | JL10484 | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Jianglai biology | JL20268 | |
| PBMC分离 | Ficoll-Paque密度梯度分离液 | Beyotime | -- |
| 纳米体表征 | 透射电子显微镜 | Talo L120C G2 | -- |
| X射线衍射 | Rigaku SmartLab SE | -- | |
| X射线光电子能谱 | Thermo Scientific K-Alpha | -- | |
| 傅里叶变换红外光谱 | Nexus 670 | -- | |
| 扫描电子显微镜结合能谱 | Zeiss Merlin Compact | -- | |
| Zeta电位和动态光散射 | Brookhaven instruments | -- | |
| 热重分析 | PerkinElmer STA 6000 | -- | |
| BBB体外模型 | Transwell小室 | -- | -- |
| 显微镜 | 共聚焦激光扫描显微镜 | Zeiss LSM980 | -- |
| 荧光显微镜 | Nikon ECLIPSE Ti2 | -- | |
| 活体成像 | 小动物活体成像系统 | -- | -- |
| 行为分析 | 动物行为分析系统 | Xinruan Corporation | -- |
| 免疫组化 | Olympus OX41显微镜 | Olympus | -- |
| Stereo Investigator软件 | -- | -- | |
| 统计分析 | SPSS软件 | IBM | 19.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | PD患者和正常对照的样本量(PBMCs测序:各5例;血清ELISA:31例PD,18例对照) 阅读提示:结果与讨论部分3.1节及图1 |
| 纳米体制备 | GA浓度、Na2SeO3浓度、AA浓度、反应时间、透析MWCO、挤出膜孔径 阅读提示:材料与方法2.3节 |
| 体外BBB模型 | bEnd.3和SH-SY5Y共培养时间、TEER值要求、纳米体浓度、孵育时间 阅读提示:材料与方法2.6节及图4 |
| 细胞保护实验 | MPP+浓度(4 mM)、BM@GA-Se浓度(1和5 μg/mL)、处理时间 阅读提示:材料与方法2.7-2.12节及图5、图6 |
| 分子机制验证 | Western blot一抗种类、稀释比例;免疫荧光染色的固定和透化条件 阅读提示:材料与方法2.9、2.14节及图8 |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、MPTP剂量和给药方案、BM@GA-Se剂量(10和1 mg/kg)和给药间隔、行为学测试具体参数 阅读提示:材料与方法2.16节及图9 |