生物信息学分析FOXP2表达
分析FOXP2在子宫内膜癌组织中的表达水平及其与正常组织的差异。
利用TIMER2.0和GEPIA2数据库分析FOXP2在EC和正常组织中的表达差异,并通过人类蛋白质图谱数据库的免疫组化图像验证。
Effect of forkhead box protein P2-mediated activation of myosin light-chain kinase on the invasion and migration of endometrial cancer cells.
包含细胞水平功能实验(CCK-8、EdU、集落形成、伤口愈合、Transwell)和机制验证(Western blot、qRT-PCR、抑制剂回复),但缺少体内实验。
Ishikawa子宫内膜癌细胞系 HEC-1-A和HEC-1-B子宫内膜癌细胞系 人子宫内膜 stromal 细胞
FOXP2过表达载体(oeFOXP2)及阴性对照(NC)转染Ishikawa细胞 MYLK特异性抑制剂ML-7处理浓度40 μM及处理时间24 h 细胞增殖、迁移和侵袭的检测终点(CCK-8:48 h;伤口愈合:0、12、24 h;Transwell:48 h) 统计学显著性水平P < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析FOXP2在子宫内膜癌组织中的表达水平及其与正常组织的差异。
利用TIMER2.0和GEPIA2数据库分析FOXP2在EC和正常组织中的表达差异,并通过人类蛋白质图谱数据库的免疫组化图像验证。
在EC细胞系中建立FOXP2过表达模型,验证转染效率。
培养EC细胞系(HEC-1-A、HEC-1-B、Ishikawa)和正常子宫内膜基质细胞,使用oeFOXP2载体进行转染,通过Western blot和qRT-PCR验证转染效率。
评估FOXP2过表达对EC细胞增殖和凋亡的影响。
使用CCK-8、EdU、集落形成实验检测细胞增殖,使用caspase-3/8/9活性检测细胞凋亡。
评估FOXP2过表达对EC细胞迁移和侵袭能力的影响。
使用伤口愈合实验检测细胞迁移,Transwell实验检测细胞侵袭。
验证FOXP2过表达对EMT标志物表达的影响。
使用Western blot和qRT-PCR检测E-cadherin、N-cadherin、vimentin的表达水平。
通过生物信息学分析FOXP2与MYLK的相关性,并在细胞水平验证。
使用cBioPortal分析FOXP2和MYLK共表达,GEPIA2分析MYLK在EC中的表达,并通过Western blot和qRT-PCR检测oeFOXP2组细胞MYLK的表达。
验证MYLK在FOXP2调控EC细胞恶性表型中的作用。
用MYLK特异性抑制剂ML-7处理oeFOXP2组细胞,然后检测增殖、凋亡、迁移和侵袭能力及EMT标志物的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco BRL | A4192001 |
| 胎牛血清 | Gibco BRL | A5670701 | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Aldrich | V900929 | |
| 胰蛋白酶 | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000试剂 | Invitrogen | 18324010 |
| 细胞处理 | ML-7 | MedChemExpress | HY-119038 |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | C0038 |
| EdU-555细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | C0075L | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Biosharp Life Science | BS097 | |
| 细胞凋亡检测 | caspase-3活性检测试剂盒 | Beyotime | C1115 |
| caspase-8活性检测试剂盒 | Beyotime | C1151 | |
| caspase-9活性检测试剂盒 | Beyotime | C1157 | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Beyotime | C0121 |
| Transwell实验 | 基质胶 | Corning | 354234 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 |
| PVDF膜 | Merck Millipore | IPVH00010 | |
| 增强化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific | 34577 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 抗FOXP2抗体 | Abcam | ab1307 | |
| 抗E-cadherin抗体 | Abcam | ab238099 | |
| 抗Vimentin抗体 | Abcam | ab92547 | |
| 抗N-cadherin抗体 | Abcam | ab245117 | |
| 抗MYLK抗体 | Abcam | ab1307 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L(HRP) | Abcam | ab205719 | |
| 山羊抗兔IgG H&L(HRP) | Abcam | ab205718 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | RR037A | |
| SYBR Premix ExTaq试剂盒 | TaKaRa | 639503 | |
| 细胞增殖检测 | 酶标仪 | Bio-Rad Laboratories | 1681130 |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Leica | DM3000 |
| 伤口愈合实验 | 倒置显微镜 | Zeiss | DMi8 |
| Western blot | ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| qRT-PCR | LightCycler 96热循环仪 | Roche | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系名称和来源、培养基、血清浓度、转染试剂和FOXP2过表达载体 阅读提示:Material and Methods 中 Cell culture、Cell grouping and intervention |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度、检测时间点(CCK-8:48 h)、EdU孵育时间、DAPI染色时间 阅读提示:Material and Methods 中 Cell proliferation assay |
| 细胞凋亡检测 | caspase活性检测试剂盒型号、检测波长 阅读提示:Material and Methods 中 Cysteinyl aspartate specific proteinase (caspase) activity |
| 细胞迁移和侵袭 | 伤口愈合实验划痕后观察时间点(0、12、24 h)、Transwell实验中细胞接种密度、Matrigel浓度、培养时间 阅读提示:Material and Methods 中 Wound healing assay、Transwell assay |
| MYLK抑制剂处理 | ML-7浓度(40 μM)和处理时间(24 h) 阅读提示:Material and Methods 中 Cell grouping and intervention |