临床样本检测
观察骨髓炎患者骨组织中USP14和SIRT1的表达变化。
收集10例骨髓炎骨折患者和10例健康骨折患者的骨组织样本,通过RT-qPCR和Western blot检测USP14和SIRT1的表达。
Insights into the potential role of BMSCs-exo delivered USP14 on SIRT1 deubiquitination in Staphylococcus aureus-induced model of osteomyelitis.
包含细胞模型、功能验证(CCK-8、ALP染色)和机制验证(CO-IP、MG132处理),但缺乏动物模型和体内验证。
MC3T3-E1细胞与金黄色葡萄球菌共培养的骨髓炎细胞模型 健康对照和骨髓炎骨折患者骨组织样本
MC3T3-E1细胞与金黄色葡萄球菌的共培养体系,感染复数(MOI)为100,处理时间21天 BMSCs-exo浓度20 µg/mL si-USP14转染序列及浓度(50 nM) MG132处理浓度(10 µM) 样本量:10例骨髓炎骨折患者和10例健康骨折患者
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察骨髓炎患者骨组织中USP14和SIRT1的表达变化。
收集10例骨髓炎骨折患者和10例健康骨折患者的骨组织样本,通过RT-qPCR和Western blot检测USP14和SIRT1的表达。
验证BMSCs的干性及多向分化潜能。
培养BMSCs,通过光学显微镜观察形态,使用成骨和成脂诱导分化培养基进行诱导,并通过茜素红S染色和油红O染色评估分化能力。
分离并确认BMSCs来源的外泌体。
收集BMSCs培养上清,通过超速离心和ExoQuick-TC沉淀外泌体,使用TEM观察形态,并用Western blot检测外泌体标志物CD9、CD63、TSG101及Calnexin。
构建骨髓炎细胞模型,并评估BMSCs-exo及其携带USP14变化的影响。
用金黄色葡萄球菌感染MC3T3-E1细胞建立骨髓炎模型,并用BMSCs-exo或来自转染OE-USP14/si-USP14的BMSCs的外泌体处理。设置Control、S. aureus、Exo、S. aureus+Exo、S. aureus+USP14 Exo、S. aureus+si-USP14 Exo组。
评估BMSCs-exo对细胞活力、炎症和成骨分化能力的影响。
使用CCK-8检测细胞活力;ELISA检测IL-6和TNF-α水平;ALP染色评估成骨分化能力;Western blot检测RUNX2和OCN表达。
揭示USP14调控SIRT1蛋白表达的分子机制。
在MC3T3-E1细胞中敲低或过表达USP14,并用MG132处理,通过RT-qPCR检测mRNA,Western blot检测蛋白,CO-IP检测SIRT1泛素化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 430-2100 |
| α-MEM培养基 | Gibco | 12571063 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 26140095 | |
| 青霉素-链霉素双抗 | Gibco | 15140122 | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma Aldrich | G7513 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Gibco | 18912014 | |
| 细菌感染 | BBL胰蛋白胨大豆肉汤 | BD Biosciences | -- |
| 溶葡萄球菌素 | Sigma | L7386 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-019 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985070 | |
| 药物处理 | MG132蛋白酶体抑制剂 | Sigma-Aldrich | M7449 |
| 外泌体分离 | ExoQuick-TC外泌体提取试剂盒 | System Biosciences Inc. | -- |
| TEM分析 | 磷钨酸 | Sigma-Aldrich | HT152 |
| JEM-F200透射电子显微镜 | -- | -- | |
| 茜素红S染色 | 茜素红S | MP Biomedicals | 02100375 |
| 奥林巴斯BX53显微镜 | Olympus | -- | |
| 油红O染色 | 异丙醇 | Sigma-Aldrich | -- |
| 油红O | Sigma | -- | |
| 奥林巴斯BX53显微镜 | Olympus | -- | |
| CCK-8检测 | CCK-8检测试剂 | DOJINDO | CK-04 |
| Multiskan FC酶标仪 | ThermoFisher | -- | |
| ALP染色 | BCIP/NBT底物溶液 | Sigma | B5655 |
| 奥林巴斯BX53显微镜 | Olympus | -- | |
| ELISA检测 | IL-6酶联免疫试剂盒 | Beyotime | PI330 |
| TNF-α酶联免疫试剂盒 | Beyotime | PT518 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| SeraMir外泌体RNA提取试剂盒 | System Biosciences | -- | |
| NanoDrop ND-100分光光度计 | Thermo | -- | |
| 逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | 9806 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Millipore Sigma | 5892791001 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| USP14抗体 | Abcam | ab192618 | |
| SIRT1抗体 | Abcam | ab189494 | |
| RUNX2抗体 | Abcam | ab236639 | |
| OCN抗体 | Abcam | ab93876 | |
| CD9抗体 | Abcam | ab307085 | |
| CD63抗体 | Abcam | ab315108 | |
| TSG101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| Calnexin抗体 | Abcam | ab22595 | |
| β-actin抗体 | Abcam | ab5694 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Abcam | ab6721 | |
| Amersham Imager 600成像仪 | GE Healthcare | -- | |
| 免疫共沉淀 | 免疫沉淀试剂盒 | Proteintech | PK10008 |
| SIRT1抗体(用于免疫沉淀) | Proteintech | 13161-1-AP | |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | EMD Millipore | 16-266 | |
| 抗泛素抗体 | Abcam | ab134953 | |
| 细胞培养 | BMSC成骨分化试剂盒 | Shanghai Linmeng Biotechnology | CHEM-200004/5/6 |
| 成脂分化培养基 | -- | -- | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| IBMX | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 吲哚美辛 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| MC3T3-E1细胞 | ATCC | -- | |
| 小鼠骨髓间充质干细胞 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | CP-M131 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | 骨髓炎骨折患者和健康骨折患者的骨组织样本(各10例);检测USP14和SIRT1的mRNA及蛋白表达。 阅读提示:Materials and methods: Clinical samples; Figure 1 legend |
| 细胞培养和感染 | MC3T3-E1细胞代数(12-15代);S. aureus感染复数MOI=100;感染后孵育时间21天;溶葡萄球菌素浓度20 mg/mL处理30分钟。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and S. aureus infection |
| 外泌体分离和鉴定 | BMSCs上清收集量(20 mL);超速离心参数(350 g 10 min,2000 g 30 min,1500×g 30 min);ExoQuick-TC沉淀比例1:5;4°C孵育12小时。 阅读提示:Materials and methods: Isolation and identification of BMSCs-exo |
| 细胞转染 | OE-USP14质粒浓度2 µg;si-USP14浓度50 nM和序列;Lipofectamine 2000使用;转染时间48小时。 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 细胞分组和处理 | BMSCs-exo浓度固定20 µg/mL;分组设置:Control, S. aureus, Exo, S. aureus+Exo, S. aureus+USP14 Exo, S. aureus+si-USP14 Exo。 阅读提示:Materials and methods: Cell grouping, Table 1 |
| 功能检测 | CCK-8:细胞密度2×10^3/孔,加液后孵育2小时;ELISA:细胞密度2×10^5/孔,处理48小时;ALP染色:诱导7天。 阅读提示:Materials and methods: Cell counting Kit-8 (CCK-8) assay, Enzyme-linked immunosorbent assay, ALP staining |
| 机制验证 | si-USP14转染浓度50 nM;MG132浓度10 µM;处理时间;CO-IP抗体:SIRT1(1:200),Ub(1:5000)。 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection, Cell grouping, Co-Immunoprecipitation (Co-IP) assay |