唾液酸转移酶相关基因作为宫颈癌治疗应答和预后的预测因子

背景：癌症相关的过度唾液酸化被认为与转移性细胞表型有关，抑制唾液酸转移酶（SiaTs）已被认为是一种有效的抗转移预防策略。本研究发现了宫颈癌（CC）中SiaTs相关基因。方法：应用癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合（GEO）数据库获取相关样本。使用mutect2软件处理突变数据集。通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）获得基因模块，并对模块内基因进行富集分析。应用Cox回归分析和“glmnet”R包建立相关风险模型。使用“MCPcounter”R包、ESTIMATE算法和TIMER在线工具描绘CC中的肿瘤免疫微环境。另外绘制了突变图谱，并比较了不同队列中对免疫治疗的反应。进一步进行逆转录定量PCR和Transwell实验，以验证筛选出的关键基因的表达和潜在功能。结果：在CC中观察到14个SiaTs的突变。随后，基于WGCNA的SiaTs相关基因模块的鉴定显著富集在代谢相关通路中。建立的风险评分模型表现出良好的预后分类效率。高风险患者可能预后较差，并发生免疫逃逸和免疫反应性降低，而低风险患者则显示出相对较高的免疫细胞评分。血管生成和MYC靶点V2可能是高风险患者中差异激活的通路，而低风险患者中的通路是KRAS信号转导下调和干扰素α应答。此外，大多数免疫检查点相关基因在低风险患者中表达较高，而高风险患者对化疗药物具有更高的敏感性。细胞实验显示，KCNK15、LIF、TCN2、SERPINF2和CXCL3在Hela细胞中高表达，而PIH1D2、DTX1和GCNT2低表达，并且沉默CXCL3减少了迁移和侵袭的Hela细胞数量。结论：在本研究中，我们系统地构建并验证了基于SiaTs相关基因的风险评分模型，该模型可以有效预测CC患者的预后以及对免疫治疗和化疗的潜在反应。这为实现个体化治疗提供了新的分子基础和临床参考。