临床样本中SENP5表达分析
检测SENP5在EC组织和癌旁组织中的表达差异及其与预后的关系。
收集5对EC肿瘤组织和癌旁组织,通过IHC、RT-qPCR和Western blot检测SENP5表达,并利用GEPIA数据库分析SENP5表达与患者预后的关系。
SENP5 promotes endometrial cancer cell growth by regulating β-catenin deSUMOylation to enhance GPX4-resistance to ferroptosis.
研究包含临床样本检测、体外细胞功能实验及机制验证(CO-IP、SUMO化分析),但缺少动物体内实验,实验层级不够多。
子宫内膜癌组织与癌旁组织 HEC-1-B细胞系
SENP5表达水平:RT-qPCR、Western blot、IHC检测 SENP5敲低和过表达的转染效率:siRNA和过表达质粒 铁死亡抑制剂处理:Fer-1 (1 µmol/L)、Lip-1 (0.2 µmol/L) β-catenin敲低对SENP5过表达的影响 β-catenin SUMO化修饰分析:HA-β-catenin与Myc-SUMO共转染
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测SENP5在EC组织和癌旁组织中的表达差异及其与预后的关系。
收集5对EC肿瘤组织和癌旁组织,通过IHC、RT-qPCR和Western blot检测SENP5表达,并利用GEPIA数据库分析SENP5表达与患者预后的关系。
研究SENP5在EC细胞增殖和铁死亡中的作用。
在HEC-1-B细胞中敲低SENP5,分别用铁死亡抑制剂Fer-1和Lip-1、坏死性凋亡抑制剂Nec-1和凋亡抑制剂Z-VAD-FMK处理,通过CCK-8、EdU评估细胞活力和增殖。
探究SENP5调控铁死亡的分子机制。
敲低SENP5后,检测β-catenin和GPX4的mRNA和蛋白表达,并测定Fe2+含量、ROS水平和GSH/GSSG比值。
验证SENP5是否通过β-catenin调节GPX4表达。
将OE-SENP5和si-β-catenin转染至HEC-1-B细胞,检测SENP5、β-catenin和GPX4的表达。
验证SENP5通过β-catenin影响铁死亡和细胞增殖。
过表达SENP5并敲低β-catenin,检测细胞活力、增殖及铁死亡相关指标。
研究SENP5是否通过去SUMO化稳定β-catenin。
通过免疫荧光共定位和Co-IP验证SENP5与β-catenin的相互作用;利用SUMOplot预测SUMO化位点;共转染HA-β-catenin和Myc-SUMO1/2/3,检测SUMO化;使用SUMO化抑制剂ML-792观察β-catenin表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | 11668-030 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| EdU检测 | 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | Beyotime | C0071L |
| 免疫荧光 | SENP5抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-104468 |
| β-catenin抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-34961 | |
| 荧光标记二抗 | Beyotime | P0186 | |
| 免疫共沉淀 | SENP5抗体 | Proteintech | 19529-1-AP |
| β-catenin抗体 | Proteintech | 17565-1-AP | |
| SUMO化分析 | β-catenin抗体 | Abcam | ab32572 |
| SUMO2抗体 | Proteintech | 11251-1-AP | |
| 脂质ROS检测 | C11-BODIPY 581/591 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| GSH检测 | GSH比值检测试剂盒 | Abcam | ab138881 |
| Fe2+检测 | Fe2+检测试剂盒 | Abcam | ab83366 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | TaKaRa | T9108 |
| 逆转录PCR | 逆转录试剂盒 | Takara | RR036A |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Abcam | ab102536 |
| SENP5抗体 | Abcam | ab58420 | |
| β-catenin抗体 | Abcam | ab32572 | |
| GPX4抗体 | Abcam | ab41787 | |
| β-actin抗体 | Abcam | ab8227 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| HRP标记二抗 | Abcam | ab288151 | |
| 铁死亡抑制 | Ferrostatin-1 | -- | -- |
| Liproxstatin-1 | -- | -- | |
| 坏死性凋亡抑制 | Necrostatin-1 | -- | -- |
| 凋亡抑制 | Z-VAD-FMK | -- | -- |
| SUMO化抑制 | ML-792 | -- | -- |
| 质粒构建 | HA-β-catenin载体 | LMAI Bio | -- |
| Myc-SUMO1载体 | LMAI Bio | -- | |
| Myc-SUMO2载体 | LMAI Bio | -- | |
| Myc-SUMO3载体 | LMAI Bio | -- | |
| Flag-SENP5载体 | LMAI Bio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | 样本数量:5对;组织来源:子宫内膜癌组织和癌旁组织;患者入组标准;病理诊断方式。 阅读提示:详见Methods中的Clinical specimens部分 |
| 细胞培养和处理 | 细胞系:HEC-1-B;培养基:RPMI 1640,10% FBS,1×10^5 U/L青霉素和100 mg/L链霉素;培养条件:37°C,5% CO2。 阅读提示:详见Methods中的Cells culture部分 |
| 细胞转染 | 转染试剂:Lipofectamine 2000;siRNA和过表达质粒的序列和浓度;转染时间;分组设置。 阅读提示:详见Methods中的Cells transfection部分 |
| 铁死亡相关检测 | Fe2+浓度、ROS水平、GSH/GSSG比的检测方法;处理时间;检测试剂盒。 阅读提示:详见Methods中的Lipid ROS level assay和Glutathione (GSH) and Fe2+ assay部分 |
| 机制验证 | 免疫共沉淀和SUMO化分析的实验条件;抗体信息;SUMO化位点预测方法。 阅读提示:详见Methods中的Co-immunoprecipitation (CO-IP) assay和SUMOylation assay部分 |