患者样本中肥大细胞浸润与炎症相关性分析
评估幽门螺杆菌感染患者胃黏膜中肥大细胞数量及其与炎症严重程度的关系
收集116例患者胃活检标本,通过IHC检测Tryptase阳性肥大细胞,根据炎症评分分级,并分析肥大细胞浸润与炎症程度的相关性。
HIF-1α-Induced GPR171 Expression Mediates CCL2 Secretion by Mast Cells to Promote Gastric Inflammation During Helicobacter pylori Infection.
包含患者样本(IHC/IF)、体外细胞实验(RNA-seq、RT-qPCR、WB、ChIP、双荧光素酶、敲低和ELISA)以及小鼠体内模型(GPR171拮抗剂),并进行了功能验证和机制验证。
RBL-2H3肥大细胞系 HMC-1肥大细胞系 C57BL/6J小鼠幽门螺杆菌感染模型 幽门螺杆菌感染患者胃黏膜组织
GPR171在幽门螺杆菌感染肥大细胞中的表达上调 HIF-1α与GPR171启动子HRE2区域的直接结合 GPR171敲低对CCL2分泌的部分抑制作用 ERK1/2抑制剂U0126对CCL2表达的影响 GPR171拮抗剂MS21570在小鼠体内对CCL2和炎症的缓解作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估幽门螺杆菌感染患者胃黏膜中肥大细胞数量及其与炎症严重程度的关系
收集116例患者胃活检标本,通过IHC检测Tryptase阳性肥大细胞,根据炎症评分分级,并分析肥大细胞浸润与炎症程度的相关性。
确定幽门螺杆菌是否激活肥大细胞以及GPR171表达变化
将RBL-2H3和HMC-1细胞与H. pylori共培养,检测脱颗粒(β-己糖胺酶释放)、RNA-seq分析差异基因、RT-qPCR和Western blot验证GPR171表达。
验证HIF-1α是否直接结合GPR171启动子并调控其转录
使用CoCl2诱导HIF-1α,检测GPR171表达;使用HIF-1α抑制剂PX-478处理;通过ChIP和双荧光素酶报告基因分析验证HIF-1α与GPR171启动子HRE的结合。
确定GPR171是否介导H. pylori诱导的CCL2分泌及信号通路
通过慢病毒shRNA敲低RBL-2H3细胞中的GPR171,检测脱颗粒、细胞因子mRNA和CCL2蛋白水平;使用ERK1/2抑制剂U0126和GPR171拮抗剂MS21570验证信号通路。
评估GPR171拮抗剂在H. pylori感染小鼠中对CCL2和炎症的作用
使用C57BL/6J小鼠,PMSS1菌株灌胃感染,腹腔注射MS21570或溶剂对照,4周后检测CCL2表达和组织病理学评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| 细菌培养 | 脑心浸液平板 | -- | -- |
| 脱颗粒实验 | 化合物48/80 | -- | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | -- | -- |
| LightCycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K138-F |
| 酶标仪 | Tecan | Spark | |
| ELISA | CCL2 ELISA试剂盒 | MULTI SCIENCES BIOTECH | EK387 |
| CCL2 ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech | 1117392 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | Merck Millipore | IPVH00010 | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 化学发光底物 | Invitrogen | 34577 | |
| 成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 双荧光素酶报告基因 | GV238载体 | GeneChem | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 | |
| IHC | DAB显色试剂盒 | -- | -- |
| IF | DAPI染色剂 | -- | -- |
| 激光扫描共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 基因敲低 | 慢病毒载体 | GenePharma | -- |
| 嘌呤霉素 | MCE | -- | |
| 动物实验 | MS21570(GPR171拮抗剂) | -- | -- |
| TIANamp细菌DNA提取试剂盒 | TIANGEN | DP302 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | H. pylori感染状态判定方法(C-14呼气试验和血清抗体分型)、胃黏膜组织样本的炎症分级标准 阅读提示:Materials and Methods 2.1节 |
| 体外肥大细胞感染 | H. pylori菌株(11637)、MOI=100、共培养时间6小时、细胞系(RBL-2H3和HMC-1) 阅读提示:Materials and Methods 2.5节 |
| HIF-1α调控实验 | CoCl2浓度200μM、PX-478浓度25μM、预处理时间2小时、ChIP实验HMC-1细胞数量约30 million 阅读提示:Materials and Methods 2.12节、2.13节 |
| GPR171功能实验 | GPR171 shRNA慢病毒转染MOI=50、嘌呤霉素筛选浓度1μg/mL、U0126浓度5μM、MS21570浓度0-20μM 阅读提示:Materials and Methods 2.16节、Figure 5图注 |
| 动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6J雌性,6-8周龄)、H. pylori菌株PMSS1(3×10^8 CFU)、灌胃天数(3天)、MS21570剂量(5mg/kg i.p.)、感染周期(4周) 阅读提示:Materials and Methods 2.2节 |