AuNPs和FAM-Sub@AuNPs的合成与表征
验证DNA功能化金纳米颗粒的成功制备,为DNA步行器提供轨道单元。
采用传统柠檬酸钠还原法合成13 nm AuNPs,并通过polyA冷冻标记法制备FAM-Sub@AuNPs;使用光谱、动态光散射、zeta电位和TEM表征。
A novel method for screening antihyperuricemic drugs by combining aptamer sensor array, exonuclease III-DNA walker and linear discriminant analysis.
包含体外传感器构建与优化、细胞水平URAT1抑制活性验证、与14C金标准方法对比、体内动物模型验证及分子对接分析等多个独立证据层级。
hURAT1-HEK293细胞 HEK293细胞 小鼠肾小管上皮细胞(mTECs) 高尿酸血症小鼠模型
检测体系:ASA–Exo III-DW,包含三种适体(Apt1-3)及Exo III浓度(0.5 U/mL)、反应时间(40 min)等 细胞模型:hURAT1-HEK293细胞和HEK293细胞,用于URAT1抑制活性评估 药物处理:lesinurad(1-20 μM)和benzbromarone(0.1-10 μM)处理 UA摄取实验:50 μM UA摄取,0.1 M NaOH裂解细胞 体内实验:KM小鼠,钾氧嗪酸诱导高尿酸血症,山奈酚5和10 mg/kg给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DNA功能化金纳米颗粒的成功制备,为DNA步行器提供轨道单元。
采用传统柠檬酸钠还原法合成13 nm AuNPs,并通过polyA冷冻标记法制备FAM-Sub@AuNPs;使用光谱、动态光散射、zeta电位和TEM表征。
确定最佳实验条件以实现高灵敏度检测。
优化polyA长度、polyA与AuNPs摩尔比、FAM-Sub@AuNPs浓度、Exo III浓度和切割时间。
验证传感器阵列的重复性、稳定性和特异性。
对30 pM UA进行重复检测,评估日内和日间变异;检测UA、Xan及干扰物质的荧光响应。
验证通过LDA能否从UA和Xan的混合信号中区分并定量UA。
使用不同浓度的UA和Xan(30-1800 pM)及不同摩尔比的混合物,通过LDA生成二维得分图。
建立UA定量模型并验证其预测准确性。
扩展训练数据集,包含6种总浓度和7种比率,绘制LDA得分图;使用9个测试样本进行回收率实验。
验证该方法用于体外筛选URAT1抑制剂的可行性。
用已知抑制剂lesinurad和benzbromarone处理hURAT1-HEK293细胞,检测细胞裂解液中UA水平,计算IC50并与14C方法比较。
评估该方法对大量化合物筛选的适用性,并验证山奈酚的URAT1抑制活性。
筛选17种植物化合物及阳性对照,评估URAT1抑制效果;对山奈酚进行浓度反应曲线分析。
评估山奈酚对mTECs的毒性。
将mTECs与山奈酚、lesinurad和benzbromarone孵育48小时,通过CCK8测定细胞活力。
验证山奈酚在高尿酸血症小鼠中的降尿酸效果。
使用KM小鼠,通过钾氧嗪酸诱导高尿酸血症,给予不同剂量的山奈酚,检测血清尿酸水平。
分析山奈酚与URAT1的相互作用模式。
使用分子对接软件预测山奈酚与URAT1结合构象,分析氢键和疏水相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 寡核苷酸合成 | 所有寡核苷酸 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- |
| AuNPs合成 | 四氯金酸 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | -- |
| 柠檬酸钠 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | -- | |
| 标准品 | 尿酸 | Aladdin Co., Ltd. | -- |
| 黄嘌呤 | Aladdin Co., Ltd. | -- | |
| 阳性药物 | 苯溴马隆 | Aladdin Co., Ltd. | -- |
| 雷西纳德 | TargetMol Company | -- | |
| 酶 | 核酸外切酶III | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 缓冲液组分 | 氯化钠 | Macklin Biochemical Co., Ltd. | -- |
| 氯化镁 | Macklin Biochemical Co., Ltd. | -- | |
| 放射性标记 | 14C-尿酸 | American Radiolabeled Chemicals, Inc. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | ProCell Co., Ltd. | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Company | -- | |
| 细胞活力测定 | CCK-8试剂盒 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | C0038 |
| 动物实验 | 氧嗪酸钾 | Solarbio Biotech Co., Ltd. | -- |
| 水纯化 | Milli-Q超纯水系统 | Millipore | -- |
| 表征 | Zetasizer Nano ZS粒度仪 | Malvern | -- |
| Nanodrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 透射电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| 荧光检测 | SPARK®多功能酶标仪 | Tecan | -- |
| 离心 | TGL-16 G离心机 | Feige | -- |
| 放射性检测 | 液体闪烁计数器 | PerkinElmer | -- |
| 血清UA测定 | 生化分析仪(BS-330E) | Mindray | -- |
| 干扰物质 | 人血清白蛋白 | Sichuan Weiqi Biological Technology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 传感器构建 | AuNPs粒径(13 nm)、polyA长度(20 nt)、polyA与AuNPs摩尔比(200:1)、FAM-Sub@AuNPs浓度(0.25 nM)、Exo III浓度(0.5 U/mL)、反应时间(40 min) 阅读提示:见2.3节和3.3节及图S3-S8 |
| 细胞培养 | 细胞系(hURAT1-HEK293、HEK293)、培养条件(DMEM、胎牛血清)、细胞数量(约10000 cells/孔) 阅读提示:见2.1节和3.8节 |
| 药物处理 | 药物浓度(lesinurad 1-20 μM,benzbromarone 0.1-10 μM)、孵育时间(文中未明确说明)、UA浓度(50 μM) 阅读提示:见3.8节及图3G和H |
| 细胞裂解与UA检测 | 裂解液体积(约200 μL)、裂解方法(0.1 M NaOH)、检测体系(ASA–Exo III-DW–LDA)、荧光测量(激发470 nm,发射520 nm) 阅读提示:见2.4节和3.8节 |
| 体内实验 | 动物品系(KM小鼠)、高尿酸血症诱导方法(钾氧嗪酸)、给药剂量(5和10 mg/kg)、给药方式(文中未明确说明)、血清UA测定方法(生化分析仪) 阅读提示:见2.1节和3.9节及图4D和E |