PTTG1表达分析
分析PTTG1在甲状腺癌组织和细胞中的表达及其与预后的关系
利用GEPIA数据库分析PTTG1在甲状腺癌中的表达和生存关联;收取甲状腺癌患者肿瘤及癌旁组织,提取RNA和蛋白,通过qPCR和Western blot验证PTTG1表达;同时检测甲状腺癌细胞系(BCPAP、TPC-1)和正常细胞Nthy-ori 3.1中PTTG1的表达。
The regulatory role of PTTG1 in proliferation and migration of thyroid cancer.
研究包含数据库分析(GEPIA)、组织样本验证、细胞系体外功能实验(CCK-8、克隆形成、划痕、Transwell)和体内动物实验(皮下瘤及肺转移模型),并进行了机制验证(p53通路)。
人甲状腺癌细胞系BCPAP和TPC-1 正常甲状腺细胞系Nthy-ori 3.1 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 BALB/c裸鼠尾静脉注射肺转移模型
PTTG1敲低效率(shPTTG1#1和#2) PTTG1表达在甲状腺癌组织和细胞中的上调 CCK-8、克隆形成、划痕愈合和Transwell实验条件 体内肿瘤生长和肺转移情况 p53、p21、p27、CDK1的表达变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析PTTG1在甲状腺癌组织和细胞中的表达及其与预后的关系
利用GEPIA数据库分析PTTG1在甲状腺癌中的表达和生存关联;收取甲状腺癌患者肿瘤及癌旁组织,提取RNA和蛋白,通过qPCR和Western blot验证PTTG1表达;同时检测甲状腺癌细胞系(BCPAP、TPC-1)和正常细胞Nthy-ori 3.1中PTTG1的表达。
建立PTTG1稳定敲低的甲状腺癌细胞系
使用靶向PTTG1的shRNA(sh#1、sh#2)构建慢病毒,感染BCPAP和TPC-1细胞,经嘌呤霉素筛选后验证PTTG1敲低效率。
验证PTTG1对甲状腺癌细胞增殖能力的影响
通过CCK-8实验、克隆形成实验检测敲低PTTG1后细胞增殖能力的变化。
验证PTTG1对甲状腺癌细胞迁移能力的影响
通过划痕愈合实验和Transwell实验评估敲低PTTG1后细胞迁移能力的变化。
验证PTTG1在体内对肿瘤生长的影响
将敲低PTTG1的BCPAP细胞皮下注射到BALB/c裸鼠双侧腋下,观察24天后处死,测量肿瘤体积和重量。
验证PTTG1在体内对肿瘤转移的影响
通过尾静脉注射shPTTG1#1 BCPAP细胞建立转移模型,观察肺转移灶形成。
探究PTTG1对p53相关信号通路的影响
在敲低PTTG1的细胞中检测p53、p21、p27、CDK1的mRNA和蛋白表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Nthy-ori 3.1 | Pricella | CL-0817 |
| BCPAP | Pricella | CL-0575 | |
| TPC-1 | Pricella | CL-0643 | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 载体构建和病毒感染 | shRNA载体 | Nangjing Hongde Biotech | -- |
| pMDG包装质粒 | -- | -- | |
| 8.9包装质粒 | -- | -- | |
| 慢病毒筛选 | 嘌呤霉素 | Millipore | -- |
| RNA提取和qPCR | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 逆转录 | HiScript逆转录酶 | Vazyme | -- |
| qPCR | ABI-Q5实时荧光定量PCR仪 | -- | -- |
| SYBR Green实时荧光定量PCR预混液 | Vazyme | -- | |
| Western blotting | PTTG1抗体 | Affinity | AF0354 |
| p27抗体 | Affinity | AF6324 | |
| p21抗体 | Affinity | AF6290 | |
| CDK1抗体 | Affinity | DF6024 | |
| p53抗体 | CST | 9282 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| CCK-8 assay | CCK-8试剂 | -- | -- |
| H&E染色 | 伊红 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:BCPAP、TPC-1、Nthy-ori 3.1,培养基(DMEM或RPMI-1640)和FBS浓度(10%) 阅读提示:Materials and methods: Cell line |
| PTTG1表达分析 | GEPIA数据库参数(|Log2 FC| cutoff 1,p=0.01),肿瘤和正常样本数(512和337),生存分析组别划分(50%截断),组织样本量和检测方法(qPCR、Western blot) 阅读提示:Methods: GEPIA database analysis,Results 第一部分,Fig.1 |
| 敲低细胞构建 | shRNA靶序列、慢病毒包装系统(pMDG和8.9)、感染参数(时间、MOI)、嘌呤霉素筛选浓度和时间 阅读提示:Methods: Plasmids and stable cell constructions,Fig.2A-B |
| 增殖实验 | CCK-8实验的细胞数、时间点、试剂稀释比例和孵育时间;克隆形成实验的细胞数、培养时长和换液频率 阅读提示:Methods: CCK8 assay,Colony formation assay,Fig.2C-F |
| 迁移实验 | 划痕愈合实验的具体划痕方式和成像时间;Transwell实验的细胞数、基质胶、孵育时间等 阅读提示:Methods: scratch wound healing,Transwell,Fig.3 |
| 体内实验 | 小鼠品系、数量、性别、体重,细胞注射数量、部位、时间(24天),肿瘤体积测量方法,最大允许体积(100 mm3) 阅读提示:Methods: Subcutaneous tumor formation assays,尾静脉注射转移模型,Fig.2G-I,Fig.3E-F |
| 机制实验 | 检测的分子标志物(p53、p21、p27、CDK1),检测方法(qPCR、Western blot)及抗体信息 阅读提示:Methods: qRT-PCR,Western blotting,Fig.4 |