网络药理学预测
筛选XFJNP治疗PD的活性成分、潜在靶点及富集通路,预测可能的分子机制。
从TCMSP、SYMmap、Herb等数据库获取活性成分,通过Swiss Target Prediction预测靶点,并与疾病数据库(GeneCards、DrugBank等)获取的PD相关靶点取交集,构建PPI网络并进行GO和KEGG富集分析。
Xifeng Jiannao pill mitigates MPTP-induced neuronal apoptosis by reducing inflammation and oxidative stress via MAPK signaling.
包含网络药理学预测、MPP+诱导的SH-SY5Y细胞模型和MPTP诱导的PD小鼠模型,进行了凋亡、氧化应激、炎症、MAPK通路检测及行为学测试,具备体外和体内功能与机制验证。
MPP+诱导的SH-SY5Y细胞模型 MPTP诱导的PD小鼠模型(C57BL/6小鼠)
MPP+浓度:1 mM,处理24小时(SH-SY5Y细胞) XFJNP含药血清浓度:10%,预处理1小时后与1 mM MPP+共处理24小时 XFJNP剂量:3.3 g/kg/day,口服,持续4周(小鼠) MPTP剂量:30 mg/kg,腹腔注射,连续5天 样本量:细胞实验n=3-6,行为学实验n=20/组 统计方法:单因素方差分析(One-Way ANOVA)后进行Tukey多重比较检验,显著性水平p < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选XFJNP治疗PD的活性成分、潜在靶点及富集通路,预测可能的分子机制。
从TCMSP、SYMmap、Herb等数据库获取活性成分,通过Swiss Target Prediction预测靶点,并与疾病数据库(GeneCards、DrugBank等)获取的PD相关靶点取交集,构建PPI网络并进行GO和KEGG富集分析。
评估XFJNP含药血清对MPP+诱导的SH-SY5Y细胞损伤的保护作用,并验证其抗凋亡、抗氧化应激、抗炎及对MAPK通路的调节作用。
SH-SY5Y细胞用XFJNPS预处理1小时,再与1 mM MPP+共处理24小时,采用CCK-8检测细胞活力、JC-1染色检测线粒体膜电位、流式细胞术检测凋亡和ROS水平、ELISA和免疫荧光检测炎症因子、Western blot检测相关蛋白表达。
评估XFJNP对MPTP诱导的PD小鼠的运动功能、多巴胺能神经元存活、氧化应激、炎症及MAPK通路的影响,验证其体内神经保护作用。
MPTP腹腔注射诱导PD小鼠模型,XFJNP口服给药4周,进行行为学测试(旷场、转棒、抓力、爬杆),然后通过免疫组化、免疫荧光、Nissl染色、TUNEL染色、ELISA、RT-PCR和Western blot检测相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Life Technologies/Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Life Technologies/Gibco | -- | |
| 青霉素 | Life Technologies/Gibco | -- | |
| 链霉素 | Life Technologies/Gibco | -- | |
| 细胞处理 | 1-甲基-4-苯基吡啶离子 | Shanghai Yuanye Bio-Technology | -- |
| 动物模型 | 1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Solarbio Life Sciences | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| 氧化应激检测 | MDA检测试剂盒 | Wuhan Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| SOD检测试剂盒 | Wuhan Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| GSH-Px检测试剂盒 | Wuhan Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | 文中未明确说明 | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Zeta Life | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| RT-PCR | RNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| TB Green Premix Ex Taq | Takara | -- | |
| PCR MasterMix | Solarbio Life Sciences | -- | |
| 流式细胞术 | ROS检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 尼氏染色 | 尼氏染色液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 仪器 | 分光光度计 | Bio-Rad | -- |
| 激光共聚焦显微镜 | Carl Zeiss AG | -- | |
| 流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 显微镜 | Olympus BX53 | -- | |
| 动物实验 | 旷场实验箱 | Beijing Zhishu Duobao Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 抓力计 | Beijing Zhishu Duobao Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 转棒仪 | Beijing Zhishu Duobao Biotechnology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞实验 | 细胞系:SH-SY5Y;种子密度:1.0×10^5 cells/mL;XFJNPS预处理浓度:10%,时间:1小时;MPP+浓度:1 mM,处理时间:24小时;培养条件:37°C,5% CO2;对照组设置。 阅读提示:见Materials and methods中的Cell culture、CCK-8 assay等部分及Figure 2图注。 |
| 体内动物模型 | 动物品系:雄性C57BL/6小鼠;体重24-27g,8周龄;MPTP给药剂量:30 mg/kg/day,腹腔注射,连续5天;XFJNP给药剂量:3.3 g/kg/day,口服,持续4周;实验分组:对照组、模型组、治疗组(n=20/组)。 阅读提示:见Materials and methods中的Animal models、Induction of PD animal model部分及Figure 5图注。 |
| 行为学测试 | 旷场实验:测试时间5分钟;转棒实验:转速5-40 rpm加速2分钟,测试总时长5分钟;抓力测试:重复3次;爬杆实验:训练3天,每天3次,间隔1小时。 阅读提示:见Materials and methods中的Behavioral tests部分。 |
| 分子机制检测 | Western blot检测MAPK通路蛋白(ERK, JNK, p38)及其磷酸化水平;检测凋亡相关蛋白(Bcl2, Bax, Cleaved-PARP1);样本来源为黑质或SH-SY5Y细胞。 阅读提示:见Materials and methods中的Western blotting部分及Figure 8图注。 |