细胞活力评估与药物浓度筛选
确定DFOG对正常肺上皮细胞和NSCLC细胞活力的影响,并筛选非细胞毒性浓度用于后续实验。
使用CCK-8法检测BEP2D、H460和A549细胞经DFOG处理后的活力,计算IC50并确定非毒性浓度。
7‑Difluoromethoxyl‑5,4'‑di‑n‑octylygenistein targets the STAT3 pathway by upregulating microRNA‑152‑3p expression to inhibit self‑renewal and tumor growth in non‑small cell lung carcinoma.
研究包含体外细胞模型、体内异种移植瘤模型,并进行了功能验证(成球、克隆形成)和机制验证(miRNA调控、靶基因验证、STAT3干预),证据层级独立且完整。
H460人非小细胞肺癌细胞系及其来源的成球细胞 A549人非小细胞肺癌细胞系及其来源的成球细胞 BEP2D人支气管上皮细胞系 H460来源的SFC异种移植裸鼠模型
DFOG处理浓度和对应细胞活力影响 miR-152-3p、STAT3 mRNA和p-STAT3蛋白表达水平 SFCs的成球和克隆形成能力 体内异种移植瘤模型中DFOG的给药剂量和肿瘤体积变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DFOG对正常肺上皮细胞和NSCLC细胞活力的影响,并筛选非细胞毒性浓度用于后续实验。
使用CCK-8法检测BEP2D、H460和A549细胞经DFOG处理后的活力,计算IC50并确定非毒性浓度。
筛选DFOG处理后NSCLC细胞中表达变化的肿瘤抑制性miRNA。
通过RT-qPCR检测DFOG处理H460和A549细胞后miR-671-5p、miR-148a-3p、miR-340-5p、miR-342-3p、miR-34a-5p和miR-152-3p的表达水平。
评估DFOG对NSCLC来源的SFCs自我更新能力的影响。
使用成球实验和克隆形成实验检测DFOG处理后的SFCs的成球率和克隆形成率,并通过western blot检测干性标志物CD133、CD44、Oct4和Sox2的表达。
评估DFOG在体内的抗肿瘤效果,并验证其对miR-152-3p和p-STAT3表达的影响。
将H460来源的SFCs皮下注射至裸鼠,待肿瘤体积约100 mm3后口服给予DFOG,定期测量肿瘤体积,实验结束后取瘤组织进行H&E染色、免疫组化和RT-qPCR分析。
验证DFOG调控miR-152-3p和STAT3的上下游关系及直接靶向作用。
通过miR-152-3p mimic/inhibitor转染、STAT3过表达、STAT3抑制剂处理SFCs,检测miR-152-3p、STAT3 mRNA和p-STAT3蛋白水平及自我更新能力;通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-152-3p与STAT3 3'-UTR的直接结合。
验证DFOG的抗肿瘤作用在不同NSCLC细胞系中的一致性。
在A549来源的SFCs中重复miRNA表达、STAT3表达及自我更新相关功能实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细胞成球培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| B27添加剂 | -- | -- | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | -- | -- | |
| 表皮生长因子 | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Laboratories, Inc. | -- |
| 基因表达分析 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Superscript IV逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| SYBR Green荧光染料 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| All-in-One miRNA qRT-PCR检测试剂盒 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| TaqMan MicroRNA检测 | GeneCopoeia, Inc. | -- | |
| 蛋白质表达分析 | RIPA蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 抗α-tubulin抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 2125 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 12640 | |
| 抗p-STAT3抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 9145 | |
| 抗CD133抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 64326 | |
| 抗CD44抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 37259 | |
| 抗Oct4抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 2890 | |
| 抗Sox2抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 3579 | |
| 辣根过氧化物酶标记IgG二抗 | Proteintech Group, Inc. | RGAR011 | |
| ECL化学发光底物 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 克隆形成实验 | 琼脂糖 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| miRNA转染 | MicrON miR-152-3p模拟物 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- |
| micrOFF miR-152-3p抑制剂 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| miR-152-3p模拟物阴性对照 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| miR-152-3p抑制剂阴性对照 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| iboFECT CP转染试剂 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pGL3荧光素酶载体 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- |
| 荧光素酶检测试剂盒 | Promega Corporation | -- | |
| 质粒转染 | pcDNA3.1-Control质粒 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| pcDNA3.1-STAT3质粒 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| Opti-MEM培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 动物实验 | S3I 201 | Abcam | ab146606 |
| Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 山羊血清 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | DFOG浓度范围及细胞处理时间,确保在非细胞毒性浓度下进行后续实验 阅读提示:Materials and methods: Cells and sphere cultures; Cell viability assessment; Figure 1A |
| miRNA表达检测 | DFOG处理浓度和时间,以及用于RT-qPCR的内参基因选择 阅读提示:Materials and methods: Reverse transcription-quantitative PCR; Figure 1B and C |
| 自我更新能力评估 | 成球实验和克隆形成实验的细胞接种密度、DFOG处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Cells and sphere cultures; Clonogenic assay; Figure 2D and E |
| 体内异种移植瘤实验 | 裸鼠品系、细胞接种数量、DFOG给药剂量和频率、肿瘤体积测量时间点 阅读提示:Materials and methods: In vivo therapeutic effects in nude mice; Figure 2H |
| 分子机制验证 | miR-152-3p mimic/inhibitor转染浓度、STAT3抑制剂浓度和处理时间、质粒转染量 阅读提示:Materials and methods: miRNA transfection; Plasmid transfection; Luciferase reporter assay; Figures 3-7 |