分析PKM2在ALI肝脏中的表达
明确PKM2在ALI过程中的表达变化及细胞定位。
通过生物信息学分析人数据集(GSE255777)和免疫组化、免疫荧光检测小鼠ALI肝脏中PKM2的表达。
Macrophage PKM2 depletion ameliorates hepatic inflammation and acute liver injury in mice.
包含人数据集分析、两种小鼠ALI模型、巨噬细胞特异性敲除、体外BMDM及THP-1细胞实验、共培养、RNA-seq和机制验证,并评估PKM2拮抗剂治疗效果。
APAP诱导的急性肝损伤小鼠模型 LPS/D-GalN诱导的急性肝损伤小鼠模型 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) THP-1和HepaRG共培养体系
APAP剂量300 mg/kg,腹腔注射,24小时检测;致死剂量750 mg/kg用于生存分析 LPS剂量50 μg/kg和D-GalN剂量700 mg/kg,腹腔注射,5小时检测 PKM2拮抗剂ML265剂量30 mg/kg,预处理后诱导ALI BMDM分化使用10 ng/mL M-CSF培养7天;极化使用LPS(10 ng/mL)和IFN-γ(25 ng/mL)处理16小时 2-DG浓度为10 mM,预处理1小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确PKM2在ALI过程中的表达变化及细胞定位。
通过生物信息学分析人数据集(GSE255777)和免疫组化、免疫荧光检测小鼠ALI肝脏中PKM2的表达。
验证巨噬细胞PKM2缺失是否减轻APAP和LPS/D-GalN诱导的肝损伤。
PKM2ΔMAC和PKM2FL/FL小鼠分别接受APAP或LPS/D-GalN攻击,检测血清ALT、肝组织形态和坏死区域。
确定PKM2缺失是否减轻肝脏炎症和肝细胞凋亡。
通过TUNEL染色、cleaved caspase-3免疫组化检测肝细胞凋亡;通过CD11b和F4/80免疫组化评估巨噬细胞浸润;检测促炎基因和细胞因子表达。
探究PKM2缺失是否将巨噬细胞从M1重编程为M2表型。
通过免疫荧光染色iNOS和CD206、Western blot检测STAT1和STAT6磷酸化、流式细胞术分析BMDM中M1/M2标志物。
通过共培养实验验证巨噬细胞PKM2缺失对肝细胞损伤的影响。
将BMDMs(来自PKM2ΔMAC和PKM2FL/FL小鼠)与野生型原代肝细胞共培养,在LPS/IFN-γ刺激下检测肝细胞炎症因子和损伤标志物;在THP-1-HepaRG共培养体系中敲低PKM2验证。
阐明PKM2通过HIF-1α信号促进巨噬细胞M1极化的机制。
对PKM2ΔMAC和PKM2FL/FL小鼠BMDMs进行RNA-seq,检测HIF-1α蛋白、糖酵解相关基因表达,并使用2-DG抑制糖酵解验证。
验证药理学抑制PKM2是否能减轻ALI并提高存活率。
C57BL/6J小鼠给予ML265预处理,然后接受APAP诱导,检测肝损伤标志物、巨噬细胞极化和存活率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 对乙酰氨基酚 | Sangon Biotech | -- |
| 脂多糖 | Aladdin | -- | |
| D-半乳糖胺 | Aladdin | -- | |
| ML265 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| RPMI培养基 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 佛波醇酯 | -- | -- | |
| 2-脱氧葡萄糖 | Selleckchem | S4701 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- | |
| RNA干扰 | 小干扰RNA | Genscript | -- |
| 免疫组织化学/免疫荧光 | DAPI | ThermoFisher Scientific | -- |
| TUNEL | TUNEL试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Roche | 3010040001 |
| ECL化学发光试剂盒 | Bio-Rad | 170-5061 | |
| 生化分析 | 谷丙转氨酶活性检测试剂盒 | Solarbio | BC1555 |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | Proteintech | -- |
| HMGB1 ELISA试剂盒 | G-CLONE | -- | |
| 代谢检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 乳酸检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 免疫组化 | PKM1抗体 | CST | 7067 |
| 免疫组化/免疫荧光/Western blot | PKM2抗体 | CST | 4053 |
| 免疫组化/免疫荧光 | HNF-4α抗体 | CST | 3113 |
| F4/80抗体 | CST | 70076 | |
| CD11b抗体 | Boster | BM3925 | |
| cleaved caspase-3抗体 | CST | 9664 | |
| 免疫荧光 | iNOS抗体 | Selleck | F01770 |
| CD206抗体 | CST | 24595 | |
| Western blot | p-STAT1抗体 | CST | 9167 |
| STAT1抗体 | CST | 14994 | |
| p-STAT6抗体 | CST | 56554 | |
| STAT6抗体 | CST | 5397 | |
| HIF-1α抗体 | Proteintech | 20960 | |
| β-actin抗体 | Servicebio | GB15003 | |
| 流式细胞术 | PE标记抗小鼠F4/80抗体 | BD Biosciences | 565410 |
| FITC标记抗小鼠CD11b抗体 | BD Biosciences | 557396 | |
| BV421标记抗小鼠CD86抗体 | BD Biosciences | 564198 | |
| Alexa Fluor 647标记抗小鼠CD206抗体 | BD Biosciences | 565250 | |
| 显微成像 | 奥林巴斯BX51荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 徕卡SP8 3X STED激光共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Western blot | ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与分组 | 小鼠品系、性别、年龄、APAP剂量(300 mg/kg和750 mg/kg)、LPS剂量(50 μg/kg)、D-GalN剂量(700 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、检测时间点(24小时和5小时) 阅读提示:见Methods 2.2 Mice and treatment;图2的图注 |
| 巨噬细胞特异性PKM2敲除小鼠 | PKM2ΔMAC (PKM2FL/FLLysM-Cre) 和对照PKM2FL/FL小鼠的生成和验证方式 阅读提示:见Methods 2.2 Mice and treatment;参考文献(Qu et al., 2024) |
| BMDM培养与极化 | M-CSF浓度(10 ng/mL)和培养天数(7天);LPS/IFN-γ浓度(LPS 10 ng/mL,IFN-γ 25 ng/mL)和处理时间(16小时);IL-4浓度(20 ng/mL)和处理时间(24小时) 阅读提示:见Methods 2.6 Primary cell isolation and cell culture;图4图注 |
| 细胞系处理 | THP-1细胞PMA浓度(20 ng/mL)和处理时间(48小时);LPS浓度(1 μg/mL)和处理时间(24小时);shPKM2和siHIF1A转染方法(Lipofectamine 3000)及效率 阅读提示:见Methods 2.6、2.5;补充图S2和S3 |
| 共培养实验 | BMDM与肝细胞的比例、培养条件、LPS/IFN-γ刺激浓度和时间 阅读提示:见Methods 2.6;图4E |
| PKM2拮抗剂治疗 | ML265剂量(30 mg/kg)、给药方式(单次腹腔注射)、预处理时间;APAP剂量(300 mg/kg或750 mg/kg) 阅读提示:见Methods 2.2;图6A |
| 糖酵解抑制 | 2-DG浓度(10 mM)和处理时间(1小时) 阅读提示:见Methods 2.6;图5F |
| 统计方法 | 统计检验方法(t检验或单因素方差分析)、显著性水平(P≤0.05)、样本量(n=5-7) 阅读提示:见Methods 2.12 Statistical analyses |