吴茱萸次碱衍生物的合成
设计并合成基于吴茱萸次碱骨架重排的新型衍生物,以探索具有抗炎活性的新化合物。
以靛红酸酐和苄胺衍生物或苯肼衍生物为起始原料,经三步反应合成目标化合物5Aa-5Fb,包括中间体3的合成、喹唑啉酮4的合成以及最终目标化合物5的合成。
Rutaecarpine derivatives synthesized via skeletal reorganization alleviate inflammation-associated oxidative damage by inhibiting the MAPK/NF-κB signaling pathway.
包含有明确的化合物合成、细胞活力检测、NO抑制实验、Western blot、qPCR、ROS检测和分子对接等实验环节,但未涉及动物模型或患者样本,功能验证和机制验证较完整。
RAW 264.7小鼠巨噬细胞系 HK2蛋白靶点(分子对接模型)
LPS诱导RAW 264.7细胞炎症模型,LPS浓度1 μg/mL 化合物5Ci预处理浓度12.5、25、50 μM,预处理1小时 细胞活力检测使用MTT法,处理浓度100 μM,处理时间48小时 NO抑制实验使用Griess试剂,检测波长540 nm
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
设计并合成基于吴茱萸次碱骨架重排的新型衍生物,以探索具有抗炎活性的新化合物。
以靛红酸酐和苄胺衍生物或苯肼衍生物为起始原料,经三步反应合成目标化合物5Aa-5Fb,包括中间体3的合成、喹唑啉酮4的合成以及最终目标化合物5的合成。
评估所有衍生物对RAW 264.7细胞活力的影响,排除具有严重细胞毒性的化合物。
采用MTT法检测100 μM浓度下化合物处理48小时后的细胞活力,以65%作为筛选阈值,选出细胞存活率较高的化合物进行后续实验。
筛选具有抗炎潜力的衍生物,通过检测对LPS诱导的NO产生的抑制作用。
将筛选出的化合物在50 μM浓度下预处理RAW 264.7细胞1小时,然后用LPS(1 μg/mL)刺激24小时,使用Griess试剂检测细胞上清液中NO的浓度,并与阳性药吲哚美辛和母体吴茱萸次碱比较。
验证5Ci对LPS诱导的炎症介质产生和相关蛋白表达的抑制作用。
检测5Ci不同浓度(12.5、25、50 μM)对NO和PGE2释放的影响,并通过Western blot检测iNOS和COX-2的表达水平。
探究5Ci是否抑制LPS诱导的MAPK信号通路激活。
通过Western blot检测5Ci处理后LPS诱导的ERK、JNK、p38磷酸化水平的变化。
评估5Ci对下游NF-κB信号通路激活的抑制作用。
通过Western blot检测5Ci处理后LPS诱导的IκB和p65磷酸化水平的变化。
验证5Ci对炎症因子IL-1β、IL-6、TNF-α转录水平的抑制作用。
经5Ci预处理和LPS刺激后,提取细胞总RNA,通过qPCR检测IL-1β、IL-6、TNF-α的mRNA水平。
验证5Ci对LPS诱导的ROS积累和DNA损伤的缓解作用。
使用DCFH-DA荧光探针检测细胞内ROS水平,并通过Western blot检测γ-H2AX表达来评估DNA损伤。
预测5Ci的潜在抗炎靶点并研究其与靶点的结合模式。
使用PharmMapper数据库预测5Ci的靶点,发现HK2为可能的靶点。进一步通过分子对接(CDOCKER协议)研究5Ci与HK2的结合模式。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| MTT实验 | MTT试剂 | Solarbio | IM0280 |
| NO检测 | Griess试剂 | Beyotime | S0023 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| GAPDH抗体 | Affinity | AF7021 | |
| γ-H2AX抗体 | Beyotime | AF5836 | |
| p-ERK抗体 | Affinity | AF1015 | |
| ERK抗体 | Abcam | ab184699 | |
| p-JNK抗体 | Abcam | ab124956 | |
| JNK抗体 | Abcam | ab199380 | |
| p-p38抗体 | Abcam | ab195049 | |
| p38抗体 | Abcam | ab170099 | |
| p-IκB抗体 | Abcam | ab133462 | |
| p-p65抗体 | Abcam | ab76302 | |
| p65抗体 | Abcam | ab32536 | |
| COX-2抗体 | Abcam | ab179800 | |
| iNOS抗体 | Abcam | ab178945 | |
| ECL化学发光检测系统 | Tanon | 5200 | |
| qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| MonScript™ RTlll All-in-One 反转录混合液 | Monnad | MR05101M | |
| MonAmp™ SYBR® Green qPCR混合液 | Monnad | MQ10201S | |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | -- | -- |
| 分子对接 | Discovery Studio软件 | BIOVIA | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | RAW 264.7细胞系来源:Procell Life Science & Technology Co., Ltd., China;培养基:DMEM含10% FBS、100 U/mL青霉素、100 μg/mL链霉素;培养条件:37°C、5% CO2 阅读提示:见4.3.1 Cell culture |
| 细胞活力筛选 | 细胞接种密度:2.0×10^4 cells/well;化合物浓度:100 μM;处理时间:48小时;MTT试剂:Solarbio IM0280;检测波长:570 nm 阅读提示:见4.3.2 MTT assay、表1及图1 |
| NO抑制实验 | 细胞接种密度:2×10^4 cells/well;化合物预处理时间:1小时;LPS浓度:1 μg/mL;LPS刺激时间:24小时;Griess试剂:Beyotime S0023;检测波长:540 nm 阅读提示:见4.3.3 Measurement of NO production、表2 |
| Western blot | 细胞接种密度:3×10^5 cells/well;5Ci预处理浓度:12.5、25、50 μM,预处理1小时;LPS浓度:1 μg/mL,刺激24小时;RIPA裂解液、离心条件:12000 rpm 4°C 15分钟;PVDF膜:Millipore IPVH00010;一抗稀释比例:见4.3.4 阅读提示:见4.3.4 Western blot analysis |
| qPCR | 5Ci预处理浓度:12.5、25、50 μM,预处理1小时;LPS浓度:1 μg/mL,刺激24小时;RNA提取:Trizol法(Invitrogen 15596026);cDNA合成:MonScript™ RTlll All-in-One Mix(Monnad MR05101M);qPCR试剂:MonAmp™ SYBR® Green qPCR Mix(Monnad MQ10201S);引物序列见4.3.5 阅读提示:见4.3.5 RNA extraction and qPCR |
| ROS检测 | 细胞接种密度:3×10^5 cells/well;5Ci与LPS共处理时间:1小时;LPS浓度:1 μg/mL;DCFH-DA染色;成像:Bio-Tek Cytation5成像仪,20×物镜 阅读提示:见4.3.6 Measurement of ROS generation |
| 分子对接 | 靶点预测:PharmMapper数据库;分子对接:Discovery Studio 2017R2,CDOCKER协议;HK2结构:PDB 5HG1;力场:CHARMm 阅读提示:见4.3.7 Network pharmacology analysis |