外泌体分离与鉴定
从CT-26结肠癌细胞及MCEC正常结肠上皮细胞中分离外泌体,并验证其基本特征(形态、大小、标志物)。
使用超速离心和Exoquick-TC沉淀法分离外泌体,通过电镜、粒径分析和Western blot检测外泌体标志物Tsg101和CD63。
Colon cancer exosome-associated HSP90B1 initiates pre-metastatic niche formation in the liver by polarizing M1 macrophage into M2 phenotype.
包含体外细胞实验(M1巨噬细胞极化、CD8+T细胞共培养)、体内动物模型(BALB/c小鼠肝转移模型)、患者样本分析(外泌体HSP90B1与预后关联),并进行了功能验证(HSP90B1沉默)和机制验证(质谱、Western blot)。
CT-26小鼠结肠癌细胞系 BALB/c小鼠肝转移模型 患者外周血外泌体样本
外泌体处理浓度:20 μg/次,尾静脉注射每3天一次,持续3周 体内肿瘤细胞注射:荧光素酶标记的CT-26细胞(1×10^6)经尾静脉注射 M1巨噬细胞诱导条件:LPS(50 μg/L)和IFN-γ(20 μg/L)处理 CD8+T细胞共培养比例:M1巨噬细胞与CD8+T细胞均为1×10^6 HSP90B1沉默:使用shRNA(#1: TAATAGTGAGGAACGTAGGCT; #2: AAATAAAAATCTTGAAAAGAA)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从CT-26结肠癌细胞及MCEC正常结肠上皮细胞中分离外泌体,并验证其基本特征(形态、大小、标志物)。
使用超速离心和Exoquick-TC沉淀法分离外泌体,通过电镜、粒径分析和Western blot检测外泌体标志物Tsg101和CD63。
检测CT-26外泌体是否将M1巨噬细胞极化为M2表型,并影响细胞因子分泌和CD8+T细胞活性。
从BALB/c小鼠骨髓分离BMDMs,经LPS和IFN-γ诱导为M1巨噬细胞,然后与CT-26或MCEC外泌体共培养,通过qPCR、Western blot、流式检测CD206、CD11b等标记,ELISA检测细胞因子,并共培养CD8+T细胞检测活性。
鉴定CT-26外泌体中高表达的HSP90B1,并通过沉默HSP90B1验证其在外泌体介导的巨噬细胞极化和免疫抑制中的作用。
通过质谱和Western blot比较CT-26和MCEC外泌体中HSP90B1的表达。构建稳定表达shHSP90B1的CT-26细胞,收集其外泌体处理M1巨噬细胞,检测极化标记、细胞因子和CD8+T细胞活性。
验证CT-26外泌体在体内是否通过形成免疫抑制性PMN促进肝转移,并检验HSP90B1沉默的影响。
BALB/c小鼠经尾静脉注射外泌体(CT-26/exo、MCEC/exo或对照),持续3周,然后注射荧光素酶标记的CT-26细胞建立肝转移模型,通过活体成像、HE染色和免疫荧光检测转移和免疫细胞浸润。
评估外周血外泌体中HSP90B1水平与结直肠癌进展及预后的关联。
收集结直肠癌患者和健康个体的外周血,分离外泌体,通过质谱和Western blot检测HSP90B1表达,并分析其与淋巴结转移、肝转移及总生存期的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | GIBCO | -- |
| DMEM培养基 | GIBCO | -- | |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | GIBCO | -- | |
| 质粒转染和慢病毒感染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668 |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗CD11b抗体 | Abcam | ab184308 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗CD63抗体 | Abcam | ab217345 | |
| 抗CD206抗体 | Abcam | ab64693 | |
| 抗TSG101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| RNA提取和qPCR | RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| M-MLV第一链合成试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| qPCR | SoFast EvaGreen超混液 | Bio-Rad | -- |
| 外泌体分离 | Exoquick-TC外泌体沉淀液 | System Biosciences | -- |
| 患者样本外泌体分离 | Umibio外泌体分离试剂盒 | Umibio | UR52136 |
| M1巨噬细胞诱导 | 巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- |
| 脂多糖 | -- | -- | |
| 干扰素-γ | -- | -- | |
| 流式细胞术 | FITC偶联抗小鼠CD8抗体 | -- | -- |
| 质谱分析 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| 三乙基碳酸氢铵缓冲液 | -- | -- | |
| EASY-nLC 1200超高效液相色谱系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Orbitrap Exploris 480质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| ELISA | 用于IL-6、TGF-β、TNF-α、IL-12、CCL-1、IFN-γ的ELISA试剂盒 | BioLegend | -- |
| SpectraMax Gemini EM酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| 流式细胞术 | FACSCanto流式细胞仪 | BD | -- |
| 动物实验 | IVIS Lumina LT系列III活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8.0软件 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与外泌体获取 | CT-26和MCEC细胞培养条件(培养基、血清、抗生素)、外泌体分离方法(Exoquick-TC沉淀)、外泌体处理浓度和时间 阅读提示:见 Materials and methods 中 Cell culture 和 Isolation of cell-derived exosomes 小节,及图1图例 |
| 体外巨噬细胞极化实验 | BMDMs诱导M1的细胞因子浓度(LPS 50 μg/L,IFN-γ 20 μg/L)、处理时间(48小时)、外泌体剂量(20 μg)、共培养比例(1:1) 阅读提示:见 Methods 中 Induction of mouse M1 macrophages 和 Flow cytometry 小节,及图2图例 |
| HSP90B1沉默 | shRNA靶序列、转染试剂(Lipofectamine 2000)、慢病毒包装系统(pMD2.G, psPAX2)、HSP90B1沉默效率验证方法 阅读提示:见 Methods 中 Plasmid transfection and lentiviral infection 小节,及图3D-F |
| 体内外泌体注射与肝转移模型 | BALB/c小鼠品系、性别(雌性)、年龄(5周龄)、外泌体剂量(20 μg)、注射频率(每3天一次)、持续时间(3周)、肿瘤细胞注射方式(尾静脉)、肿瘤细胞数量(1×10^6)、评估时间点(第21天) 阅读提示:见 Methods 中 Animal models 小节,及图1G-Q和图4图例 |
| 患者样本分析 | 患者入组标准、样本量(健康n=10,患者n=10;淋巴结阴性n=5,阳性n=5,肝转移n=5)、外泌体分离方法(Umibio试剂盒)、HSP90B1检测方法(质谱/Western blot)、预后指标(总生存期) 阅读提示:见 Methods 中 Collection of patient samples 小节,及图5图例 |