KPNA2通过调控YBX1介导的DDX3X可变剪接促进骨肉瘤进展

骨肉瘤（OS）是一种快速进展的原发性恶性骨肿瘤，发生于15至19岁的儿童和青少年以及60岁以上的成人。由于异常剪接因子引起的可变剪接（AS）改变有助于肿瘤进展，因此对44例骨肉瘤患者进行了基因表达和AS分析，以构建RNA结合蛋白（RBPs）、AS事件和AS基因的全基因组共表达网络。建立了功能获得或丧失的骨肉瘤细胞模型，并进行了交互网络分析和富集分析。Karyopherin Subunit Alpha 2（KPNA2）与患者生存期负相关。KPNA2将剪接因子Y-box结合蛋白1（YBX1）转运至细胞核，YBX1通过无义介导的mRNA降解（NMD）途径加速ATP依赖性RNA解旋酶DDX3X（DDX3X）的降解，从而促进DDX3X基因的内含子保留，进而降低DDX3X蛋白水平。KPNA2/YBX1轴调控DDX3X mRNA的稳定性和细胞周期进程。KPNA2/YBX1/DDX3X轴可能是抑制疾病进展和改善OS患者生存的潜在靶点。该研究将DDX3X的AS调控整合到OS的进展中，并代表了OS治疗的潜在预后生物标志物和治疗靶点。