IGF2BP3表达分析
验证IGF2BP3在NSCLC及转移中的表达及其临床相关性
使用TCGA和GEPIA数据库分析IGF2BP3表达及生存率;免疫组化检测患者组织;qRT-PCR和Western blot检测小鼠及细胞中IGF2BP3水平;建立OST耐药LLC-OR细胞系。
Inhalable liposomal delivery of osimertinib and DNA for treating primary and metastasis lung cancer.
包含体外细胞实验、体内原位和脑转移模型、转录组分析及免疫微环境检测等多层级验证,并进行了功能与机制研究。
Lewis肺癌(LLC)细胞 LLC-Luc原位肺癌小鼠模型 LLC-Luc脑转移小鼠模型 患者肺癌组织样本
LLC细胞中IGF2BP3敲低效率(siRNA序列及转染条件) MPDOLs粒径、zeta电位、包封率及雾化后稳定性 体内给药剂量(OST 5 mg/kg,吸入或灌胃)及给药方案 脑转移模型建立(4×10⁴ LLC-Luc颅内注射) RVG-EXOs(si)的体外BBB穿透能力(TEER > 200 Ω·cm²)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IGF2BP3在NSCLC及转移中的表达及其临床相关性
使用TCGA和GEPIA数据库分析IGF2BP3表达及生存率;免疫组化检测患者组织;qRT-PCR和Western blot检测小鼠及细胞中IGF2BP3水平;建立OST耐药LLC-OR细胞系。
制备并表征共递送OST和DNA质粒的仿生纳米脂质体
合成PβAE并与DNA形成PD核;薄膜分散法制备OST脂质体;融合SP-B过表达MSC膜;评估粒径、电位、形态、包封率、释放曲线、血清稳定性及雾化稳定性。
评估MPDOLs在LLC细胞中的摄取、内体逃逸、IGF2BP3敲低及细胞毒性
用C6标记MPDOLs,流式及共聚焦检测摄取;使用内吞抑制剂确定途径;LysoTracker和吖啶橙染色评估内体逃逸;qRT-PCR和Western blot检测IGF2BP3表达;CCK-8和流式凋亡分析。
验证DNA质粒转染触发外泌体产生并负载siRNA,且RVG介导脑靶向
从转染MPDOLs的LLC细胞培养上清和吸入MPDOLs的小鼠血浆中分离外泌体;NTA、TEM、Western blot表征;PCR检测siRNA;用bEnd.3细胞构建BBB模型评估穿透;DiD标记外泌体进行体内分布。
评估吸入MPDOLs对原位和脑转移肿瘤的抑制效果及安全性
构建原位和脑转移模型,分组给予MPDOLs、PDOLs、PDs、OLs、PBS吸入或OST灌胃;监测体重、生存期、生物发光成像、micro-CT、HE染色、免疫组化。
评估MPDOLs治疗对肿瘤免疫微环境的影响
流式细胞术分析肿瘤组织中CD8+T细胞、Treg、NK细胞、M1/M2巨噬细胞比例;ELISA检测血清细胞因子水平。
探究MPDOLs治疗后的分子机制,特别是对Myc及Warburg效应的影响
RNA-seq分析差异表达基因;GO/KEGG富集、PPI网络识别hub基因;Western blot检测Myc;检测葡萄糖摄取、乳酸产生和NAD+水平;免疫荧光检测GLUT1和HK2。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | VivaCell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | -- | |
| 药物处理 | 奥希替尼 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞转染 | 聚(β-氨基酯) | -- | -- |
| jetPRIME转染试剂 | Polyplus-transfection | -- | |
| Western blot | 抗IGF2BP3抗体 | Santa Cruz | sc-390639 |
| 抗SP-B抗体 | Santa Cruz | sc-133143 | |
| 抗c-Myc抗体 | Abcam | ab32072 | |
| 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab115730 | |
| 抗HK2抗体 | Abcam | ab209847 | |
| 抗ALIX抗体 | Abcam | ab275377 | |
| 抗HSP70抗体 | Abcam | ab181606 | |
| 抗磷酸化EGFR抗体 | Abcam | ab40815 | |
| 抗EGFR抗体 | Proteintech | 18986-1-AP | |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | APExBIO | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Vazyme Biotech | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green PCR预混液 | Yeasen Biotechnology | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- | |
| miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- | |
| RNA提取 | RNA快速纯化试剂盒 | YiShan Biological Technology | -- |
| TRIzol试剂 | -- | -- | |
| DNA定量 | PicoGreen双链DNA定量检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | Absin | -- |
| 细胞因子检测 | IFN-γ、TGF-β、IL-10、IL-6 ELISA试剂盒 | BOSTER Biological Technology | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Lianke Bio | -- | |
| 流式细胞术 | 肺组织解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| Percoll分离液 | GE Health | -- | |
| 可固定活力染料700 | BD | -- | |
| 抗CD16/32抗体 | BioLegend | -- | |
| 电镜 | 透射电子显微镜 | JEOL | JEM |
| 粒径分析 | Zetasizer Nano ZS粒径分析仪 | Malvern | -- |
| 小动物成像 | IVIS Spectrum小动物成像系统 | PerkinElmer | -- |
| micro-CT | 微型CT(GX2) | PerkinElmer | -- |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜(LSM-980) | Zeiss | -- |
| 共聚焦显微镜(Dragonfly 200) | Andor Technology | -- | |
| 流式细胞仪 | 流式细胞仪(FACS Celesta) | BD Biosciences | -- |
| 流式细胞仪(Accuri C6 Plus) | BD Biosciences | -- | |
| qRT-PCR | LightCycler480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- |
| HPLC | 高效液相色谱系统 | SHIMADZU | -- |
| 外泌体分离 | 超速离心机(Optimal XPN-100) | Beckman | -- |
| EXODUS系统 | Huixinbio | -- | |
| 外泌体表征 | 纳米颗粒追踪分析仪(ZetaView) | Particle Metrix | -- |
| 蛋白印迹成像 | 数字凝胶成像分析系统 | Tanon | 4800 |
| 荧光显微镜 | 倒置显微镜(Ti2-U) | Nikon | -- |
| 微板读取器 | 酶标仪(Infinite F50) | Tecan | -- |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- |
| TruSeq PE簇生成试剂盒v3-cBot-HS | Illumina | -- | |
| Illumina Novaseq测序平台 | Illumina | -- | |
| 质粒构建 | Omega质粒DNA小提或大提试剂盒 | Omega | -- |
| 纳米药物制备 | 超滤离心管(50kDa截留分子量) | -- | -- |
| Pur-A-Lyzer小型透析管 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 基质胶 | -- | -- | |
| 细胞染色 | DAPI染料 | Solarbio | -- |
| 溶酶体示踪剂 | -- | -- | |
| 吖啶橙 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| IGF2BP3表达分析 | 患者组织样本数量与来源;OST处理浓度和时间;siRNA序列 阅读提示:Methods 中 'Analysis of IGF2PB3 expression in mice and patients' |
| MPDOLs制备表征 | PβAE与DNA重量比;OST与脂质比例;膜融合条件;包封率测定方法 阅读提示:Methods 中 'Preparation of MPDOLs' 和 'Characterization of MPDOLs' |
| 体外细胞实验 | 细胞系来源;处理浓度和时间;内吞抑制剂种类;凋亡检测试剂盒 阅读提示:Methods 中 'Cellular uptake and internalization' 和 'Cell cytotoxicity, proliferation, and apoptosis assay' |
| 外泌体产生与功能 | 质粒转染时间;外泌体分离方法;BBB模型构建细节(TEER值) 阅读提示:Methods 中 'Exosome isolation and characterization' 和 'The biological effect of RVG-EXOs(si)' |
| 体内疗效评估 | 小鼠品系、性别、年龄;肿瘤细胞接种数量;给药方案(剂量、频率、途径);实验终点 阅读提示:Methods 中 'Anti-tumor efficacy in NSCLC orthotopic tumor model and brain metastasis model' |