细胞增殖抑制实验
评估FX对PC细胞增殖的抑制作用。
使用MTT、RTCA和集落形成实验检测不同浓度FX处理后的细胞活力、增殖和集落形成能力。
Fucoxanthin suppresses pancreatic cancer progression by inducing bioenergetics metabolism crisis and promoting SLC31A1‑mediated sensitivity to DDP.
研究包含细胞活力、增殖、死亡、线粒体功能、糖酵解、代谢物、基因敲低及药物联合等多层次体外实验,并包含功能验证和机制验证。
胰腺癌细胞系PATU-8988T 胰腺癌细胞系PATU-8988S 胰腺癌细胞系PANC-1 293T细胞(用于慢病毒包装)
细胞系:PATU-8988T、PATU-8988S、PANC-1 FX浓度:0、5、10、20、40、80、160、320 µM(IC50)及0、25、50、100 µM(功能实验) 处理时间:MTT 72h,其他功能实验24h或48h DDP浓度:30 µM SLC31A1敲低验证及联合处理效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估FX对PC细胞增殖的抑制作用。
使用MTT、RTCA和集落形成实验检测不同浓度FX处理后的细胞活力、增殖和集落形成能力。
确定FX诱导的细胞死亡是否属于已知的程序性细胞死亡类型。
使用Annexin V-FITC/PI染色检测细胞死亡率,并联合多种细胞死亡抑制剂(ZVAD、Fer-1、DFO、NEC-1、NSA、TTM、3-MA、BafA1)处理,同时通过Western blot检测焦亡标志蛋白GSDME、GSDMD、GSDMC的切割。
评估FX对PC细胞线粒体功能、ROS产生和ATP水平的影响。
使用Seahorse XFe96分析仪测量OCR和ECAR,检测ROS和线粒体ROS,检测ATP水平,通过Western blot检测OPA1变化以及MitoTracker染色观察线粒体形态。
分析FX是否引起代谢从线粒体呼吸向有氧糖酵解的转变。
基于OCR和ECAR数据,分析ECAR/OCR比值,并通过Seahorse Glycolysis Stress Test评估糖酵解速率。
验证FX是否降低PC细胞在葡萄糖限制条件下的代谢灵活性并增加细胞死亡。
在低糖(1 mM葡萄糖)条件下,处理FX(25 µM)和/或GSH(7.5 mM),检测细胞活力、GSH/GSSG比值和细胞死亡率。
验证FX是否通过上调SLC31A1增强PC细胞对DDP的敏感性。
检测FX和DDP联合处理的细胞活力,通过Western blot检测SLC31A1表达,构建SLC31A1敲低细胞系并检测联合处理后的细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | BIOVISTECH | SE100-B | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 岩藻黄素 | Shanghai Macklin Biochemical Co., Ltd. | F861277 |
| 细胞活力检测 | MTT细胞增殖和细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0009S |
| 细胞死亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | KeyGEN Bio TECH | KGA108 |
| 蛋白质提取 | 裂解液 | Beyotime Institute of Biotechnology | P0013 |
| 蛋白质定量 | Pierce™ BCA蛋白检测试剂盒 | Pierce | -- |
| Western blot | 5X双色蛋白上样缓冲液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 一抗(GSDME, GSDMD, GSDMC, OPA1, SLC31A1和GLS) | -- | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔或抗鼠IgG(H+L) | -- | -- | |
| SuperSignal™ West Pico PLUS试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| UVP ChemStudio PLUS成像系统 | Jena GmbH | H116457 | |
| 线粒体功能检测 | Seahorse XF基础培养基 | Seahorse Bioscience | 102353-100 |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| FCCP | -- | -- | |
| XFe96细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | S7800B | |
| 糖酵解检测 | 2-脱氧-D-葡萄糖 | -- | -- |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0033 |
| MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | M36008 | |
| 流式细胞术 | BD FACSCanto™临床流式细胞仪 | BD Biosciences | BDCanto II |
| 细胞死亡抑制剂处理 | Z-VAD-FMK | -- | -- |
| Ferrostatin-1 | -- | -- | |
| 甲磺酸去铁胺 | -- | -- | |
| Necrostatin-1 | -- | -- | |
| Necrosulfonamide | -- | -- | |
| 四硫代钼酸铵 | -- | -- | |
| 3-甲基腺嘌呤 | -- | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | -- | -- | |
| 谷胱甘肽 | -- | -- | |
| 顺铂 | -- | -- | |
| 荧光显微镜观察 | ECLIPSE TS 100显微镜 | Nikon Corporation | -- |
| 基因敲低 | pPLK/GFP + Puro-SLC31A1 shRNA质粒 | PPL (Public Protein/Plasmid Library) | -- |
| psPAX2包装质粒 | -- | -- | |
| pMD2G包膜质粒 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(DMEM含10% FBS和青霉素-链霉素)、培养条件(5% CO2,37°C) 阅读提示:Materials and methods - Cell lines and culture |
| 细胞活力检测 | FX浓度梯度(0-320 µM)、处理时间(72h)、MTT试剂盒(Beyotime C0009S) 阅读提示:Materials and methods - Assessment of cell viability |
| 细胞死亡检测 | FX浓度(0、25、50、100 µM)、处理时间(48h)、Annexin V-FITC/PI染色时间(15 min)、流式细胞仪(BD FACSCanto II) 阅读提示:Materials and methods - FACS analysis of cell death rate |
| 线粒体功能检测 | 细胞密度(20,000细胞/孔)、FX浓度(0、25、50、100 µM)、处理时间(8h)、Seahorse XF Base Medium成分(25 mM葡萄糖、2 mM丙酮酸) 阅读提示:Materials and methods - Determination of oxygen consumption rate (OCR) |
| 糖酵解检测 | 细胞密度(20,000细胞/孔)、FX浓度(0、25、50、100 µM)、处理时间(8h)、Seahorse XF Base Medium含2.24 mM谷氨酰胺 阅读提示:Materials and methods - Measurement of extracellular acidification rate (ECAR) |
| GL条件下的联合处理 | 葡萄糖浓度(1 mM)、FX浓度(25 µM)、GSH浓度(7.5 mM)、处理时间(24h) 阅读提示:Materials and methods - Assessment of cell viability; Results - FX sensitizes PC cells to GL condition |
| DDP联合处理 | FX浓度(50 µM)、DDP浓度(30 µM)、处理时间(24h) 阅读提示:Materials and methods - Assessment of cell viability; Results - FX enhances PC cell sensitivity to DDP |