免疫与文库构建
获取针对BoNT/AHCC的特异性VHH抗体文库
使用BoNT/AHCC免疫双峰驼L9,五次免疫加一次天然毒素加强,血清效价达1:8000。提取RNA,反转录,PCR扩增VHH,克隆入pComb3XTT载体,电转化TG1,构建噬菌体文库,库容6×10^9 phagemids。
A novel single-domain antibody obtained from immune Bactrian camels against botulinum toxin type A using SPR-based screening method.
包含噬菌体文库构建、SPR筛选、计算机建模、细胞结合实验和小鼠体内保护实验等多层级验证,且明确验证了机制和功能。
BoNT/AHCC免疫双峰驼 Neuro-2a细胞 CD-1小鼠中毒模型
Bactrian camel L9 immunization schedule with BoNT/AHCC and booster with natural toxin Phage library capacity and screening rounds (four rounds for direct, three for indirect) Antibody concentrations and toxin doses (e.g., HM 0.05-5 mg/kg, 10 mg/kg vs 20 LD50, 200 LD50) Cell line (Neuro-2a) and staining conditions (e.g., AHCC-Alexa Flour 488 10 μg/mL, HM 10-100 μg/mL) SPR assay conditions (e.g., AHCC concentrations, chip types, immobilized ligands)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取针对BoNT/AHCC的特异性VHH抗体文库
使用BoNT/AHCC免疫双峰驼L9,五次免疫加一次天然毒素加强,血清效价达1:8000。提取RNA,反转录,PCR扩增VHH,克隆入pComb3XTT载体,电转化TG1,构建噬菌体文库,库容6×10^9 phagemids。
通过直接包被抗原筛选特异性结合的VHH,并评估其体内中和活性
采用ELISA直接筛选,经四轮淘选后挑选高OD克隆,获得优势抗体A1。SPR测定A1亲和力为3.624E-10 M。但A1在体内不能保护小鼠免于LD100 BoNT/A致死。
利用A1作为支架捕获AHCC,暴露活性位点,筛选功能性中和抗体
将A1包被于免疫管,捕获AHCC,加入噬菌体库进行三轮淘选,之后使用SPR筛选高Ru值克隆,得到8个候选,经293T表达和SPR验证,克隆7(HM)具有高结合和慢解离,亲和力1.08E-11 M。
预测HM和A1与AHCC的结合位点及与SV2C的竞争关系
利用同源建模和分子对接构建AHCC与SV2C、HM、A1的复合物结构,确定HM结合AHCC的1155Y、1160FI1161、1184V、1188NKE1190残基,与SV2C结合位点重叠;A1结合远离SV2C的位点。
验证HM能否阻断AHCC与SV2C的结合以及其在细胞水平抑制毒素结合
SPR竞争实验显示HM剂量依赖性降低Ru值。细胞实验使用Alexa Fluor 488标记的AHCC与Neuro-2a细胞孵育,加入HM后荧光强度剂量依赖性下降。
评估HM在动物模型中的中和保护效果
将HM与BoNT/A混合室温孵育30 min后腹腔注射CD-1雌性小鼠,观察存活情况。结果显示HM(0.05-5 mg/kg)保护小鼠免受2 LD50;10 mg/kg完全保护20 LD50,对200 LD50保护30%并延长生存时间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物免疫 | GERBU佐剂LQ 3000 | GERBU Biotechnik | 30000025 |
| 细胞培养 | MEM培养基 | Gibco/Thermo Fisher Scientific | C11095500CP |
| 胎牛血清 | Gibco/Thermo Fisher Scientific | 16000-044 | |
| ExpiCHO™表达培养基 | -- | -- | |
| 细胞染色 | DAPI | BioLegend | 422801 |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus-transfection | 101000046 |
| 质粒提取 | 无内毒素质粒大提试剂盒 | Tiangen Biotech (Beijing) Co. | DP117 |
| Western blot | HRP标记的兔抗骆驼IgG Fc二抗 | Solarbio | SE283 |
| SPR实验 | GST-SV2C重组蛋白 | list labs | 690 |
| 文库构建 | pComb3XTT载体 | Addgene | -- |
| 蛋白纯化 | HiTrap MabSelect Sure蛋白A柱 | GE Healthcare Life Sciences | -- |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SPR分析 | BIAcore | -- | -- |
| CM5传感芯片 | Cytiva | -- | |
| 蛋白A芯片 | -- | -- | |
| 分子克隆 | M13K07辅助噬菌体 | New England Biolabs | -- |
| 蛋白纯化 | Äkta纯化系统 | GE Healthcare Life Sciences | -- |
| 数据分析 | Prism软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物免疫 | 免疫动物种类(Bactrian camel)、免疫原(BoNT/AHCC)、佐剂(GERBU)、免疫次数和间隔、血清效价(1:8000) 阅读提示:Materials and methods 4.3 和 Figure 1 |
| 噬菌体文库构建 | 载体(pComb3XTT)、宿主菌(E. coli TG1)、文库容量(6×10^9)、准确性(>80%) 阅读提示:Materials and methods 4.4 和 Figure S1 |
| 筛选方法 | 直接筛选:包被抗原、淘选轮数(4轮)、ELISA;间接筛选:A1包被、淘选轮数(3轮)、SPR初筛 阅读提示:Materials and methods 4.5.1 和 4.5.2 |
| SPR亲和力测定 | 芯片类型(CM5或Protein A)、抗原浓度范围、固定化配体(SV2C或抗体)、分析物(AHCC或抗体) 阅读提示:Materials and methods 4.7 和 Figure 3、4 |
| 细胞实验 | 细胞系(Neuro-2a)、培养基(MEM)、培养条件、AHCC-Alexa Fluor 488浓度(10 μg/mL)、HM浓度(10-100 μg/mL)、染色步骤 阅读提示:Materials and methods 4.8 和 Figure 6 |
| 小鼠保护实验 | 小鼠品系(CD-1雌性)、体重(15-18 g)、毒素剂量(LD50)、抗体剂量(0.05-5 mg/kg, 10 mg/kg)、孵育时间(30 min)、给药途径(腹腔注射)、观察时间(96 h) 阅读提示:Materials and methods 4.10 和 Figure 7 |