外泌体提取与鉴定
获取并验证血浆和细胞上清中的外泌体。
从AIONFH患者和健康对照血浆中提取外泌体,以及从酒精刺激的AML-12细胞上清中提取外泌体,通过TEM、NTA和Western Blot鉴定外泌体形态、粒径和标志物。
MicroRNA Expression Profile in the Patient's Plasma Exosomes of Alcohol-Induced Osteonecrosis of Femoral Head: Potential Vascular Regulation Mechanism.
研究包含患者样本外泌体测序、细胞功能实验(迁移、增殖、凋亡)及双荧光素酶机制验证,但缺乏动物模型或在体验证。
人血浆外泌体(AIONFH患者及健康对照) 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 小鼠肝细胞系AML-12
外泌体提取方法(血浆使用Umibio试剂,细胞上清使用SBI试剂) miR-155-5p在AI-Exos和AML-Exos中的表达水平 酒精处理AML-12的浓度(400 mM) 外泌体处理HUVECs的浓度(100 μg/mL)及时间(24小时) HIF-1α作为miR-155-5p靶基因的双荧光素酶验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并验证血浆和细胞上清中的外泌体。
从AIONFH患者和健康对照血浆中提取外泌体,以及从酒精刺激的AML-12细胞上清中提取外泌体,通过TEM、NTA和Western Blot鉴定外泌体形态、粒径和标志物。
筛选AI-Exos中差异表达的miRNA,并预测其功能通路。
提取血浆外泌体总RNA,进行Illumina NextSeq 500测序,通过edgeR筛选差异miRNA,并进行GO和KEGG富集分析。
验证测序结果并确认miR-155-5p的靶基因。
通过RT-PCR验证多个差异miRNA的表达,使用TargetScan预测miR-155-5p靶基因,并通过双荧光素酶报告实验验证HIF-1α为直接靶基因。
验证酒精刺激的肝细胞外泌体中miR-155-5p是否上调。
用不同浓度酒精处理AML-12细胞,选择维持正常形态的最大浓度(400 mM)提取外泌体,检测miR-155-5p表达。
评估AI-Exos和AML-Exos对血管内皮细胞功能的影响。
将AI-Exos或AML-Exos(100 μg/mL)处理HUVECs 24小时,检测迁移、增殖、凋亡以及HIF-1α/VEGFA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 外泌体提取 | 血液外泌体沉淀试剂 | Umibio | UR52136 |
| 外泌体纯化过滤器 | -- | -- | |
| 外泌体沉淀试剂 | SBI | EXOTCxxA-1 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | NCM Biotech | WB6501 |
| 外泌体表征 | 纳米颗粒跟踪分析仪 | Malvern Instruments | -- |
| Western blot | 外泌体裂解液 | Umibio | UR33101 |
| ECL检测试剂 | BioSharp | -- | |
| 抗HIF-1α抗体 | Abcam | ab308433 | |
| 抗VEGFA抗体 | Abcam | ab229377 | |
| RNA提取 | RNA提取试剂 | AccurateBiology | AG21102 |
| RNA纯化试剂盒 | Norgen | 35300 | |
| RNA质量检测 | 安捷伦2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| RT-PCR | 逆转录试剂盒 | AccurateBiology | AG11717 |
| 逆转录试剂盒 | AccurateBiology | AG11707 | |
| SYBR Green染料 | Accurate Biology | AG11719 | |
| 测序 | Illumina NextSeq 500测序仪 | Illumina | -- |
| 双荧光素酶实验 | psiCHECK-2载体 | HonorGene | -- |
| 双荧光素酶报告检测试剂盒 | Promega | E1910 | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外泌体提取 | 血浆外泌体提取使用Umibio试剂,4°C 2小时,10000g离心1小时;细胞上清使用SBI试剂,4°C 12小时,1500g离心30分钟。 阅读提示:见Materials and Methods 2.2 |
| miRNA测序 | 10例AIONFH患者和10例健康对照;差异筛选标准|log2Foldchange|>2, p<0.01。 阅读提示:见Materials and Methods 2.1, 2.6 |
| 细胞培养与外泌体处理 | HUVECs培养于含10% FBS的DMEM/F12;AML-12培养于含10% FBS、10 μg/mL胰岛素、5.5 μg/mL转铁蛋白、5 ng/mL硒、40 ng/mL地塞米松的无外泌体DMEM/F12;酒精处理浓度400 mM处理24小时;外泌体处理HUVECs浓度100 μg/mL,处理24小时。 阅读提示:见Materials and Methods 2.8 |
| 靶基因验证 | psiCHECK-2载体构建,共转染293T细胞,36小时后检测。 阅读提示:见Materials and Methods 2.7 |
| 功能实验 | 划痕愈合实验在0、8、24小时拍照;CCK-8检测各时间点;流式凋亡使用Annexin V-FITC/PI染色。 阅读提示:见Materials and Methods 2.8和Results 3.4, 3.5 |