CD47表达分析
验证CD47在EC组织和细胞中的表达水平。
使用GEPIA2和UALCAN数据库进行生物信息学分析,TCGA数据DEGs分析,IHC检测53例EC和20例正常内膜组织,qRT-PCR检测EC细胞系和正常内膜上皮细胞。
Multimodal near-infrared molecular imaging of ex vivo endometrial carcinoma via CD47-based targeted tracer.
研究包含生物信息学、IHC、qRT-PCR、流式、免疫荧光、体外NIR-PIT、巨噬细胞吞噬、动物模型及离体人子宫标本成像等多个独立证据层级,且包含功能与机制验证。
子宫内膜癌细胞系(KLE、HEC-1-A、Ishikawa) 人正常子宫内膜上皮细胞 小鼠皮下移植瘤模型(NU/NU裸鼠) 离体人子宫内膜癌全子宫标本
CD47在EC组织和细胞系中的过表达 CD47抗体与EC细胞的特异性结合 NIR-PIT的光剂量依赖性细胞毒性 CD47抗体介导的巨噬细胞吞噬增强 离体人子宫标本中CD47-AF790的肿瘤特异性荧光信号和TBR
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CD47在EC组织和细胞中的表达水平。
使用GEPIA2和UALCAN数据库进行生物信息学分析,TCGA数据DEGs分析,IHC检测53例EC和20例正常内膜组织,qRT-PCR检测EC细胞系和正常内膜上皮细胞。
评估CD47抗体与EC细胞的特异性结合能力。
流式细胞术检测CD47-FITC与EC细胞和正常细胞的结合,免疫荧光观察CD47在细胞膜上的分布。
评估CD47靶向NIR-PIT对EC细胞的直接杀伤作用。
EC细胞与CD47-AF790孵育后接受不同剂量NIR光照射,通过流式细胞术检测细胞死亡比例。
验证CD47抗体对巨噬细胞吞噬EC细胞的影响。
EC细胞与CD47抗体孵育后与RAW264.7巨噬细胞共培养,通过激光共聚焦显微镜观察吞噬;CCK8实验检测NIR-PIT下的细胞活力。
评估CD47靶向OMI引导下的肿瘤切除及NIR-PIT对肿瘤复发的影响。
建立KLE细胞皮下移植瘤模型,进行部分或完全切除,分为A组(免疫治疗)、B组(完全切除)、C组(NIR-PIT),评估复发率;复发肿瘤维持治疗比较NIR-PIT与对照。
比较肿瘤组织与周围正常组织的荧光信号强度。
从动物模型离体获取肿瘤及肌肉、脂肪、皮肤组织,使用近红外成像系统测量MFI。
验证CD47-AF790在离体人EC子宫标本中的肿瘤特异性成像能力。
16例EC患者全子宫标本,经CD47-AF790孵育后成像,评估荧光信号和TBR,并与病理结果对照。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 小鼠抗人CD47单克隆抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-12730 |
| HRP标记IgG | Shanghai Gene Tech | -- | |
| 细胞培养 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | 逆转录试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| SYBR Green预混液 | ABclonal Technology | -- | |
| LightCycler480II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 流式细胞术 | CD47-FITC | -- | -- |
| IgG1-FITC | -- | -- | |
| FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 体外NIR-PIT | CD47-Alexa Fluor 790 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 近红外发光二极管 | Shanghai WinWorld Trading | SMO760 | |
| 细胞吞噬实验 | RAW264.7巨噬细胞 | -- | -- |
| CCK8试剂盒 | -- | -- | |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| 异氟烷 | RWD Life Science | -- | |
| 微型CT扫描仪 | Bruker | -- | |
| 离体成像 | 可见光与近红外荧光分离组合成像系统 | SES Co. | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | Boster | -- |
| Mantra半自动定量病理成像系统 | Akoya Biosciences | -- | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
| 流式数据分析 | FlowJo软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CD47表达验证 | TCGA数据来源、GEPIA2和UALCAN数据库的使用;IHC的样本量(53 EC和20正常)、抗体稀释度、染色和定量方法;qRT-PCR的细胞系和引物序列 阅读提示:Methods 2.1, 2.2, 2.4; Figure 1 |
| 细胞结合实验 | CD47-FITC和IgG1-FITC的浓度、孵育时间和温度;阻断实验中CD47抗体的浓度和预处理时间 阅读提示:Methods 2.5; Figure 2A, 2B |
| 体外NIR-PIT | CD47-AF790的浓度、孵育时间;NIR光的波长、功率密度、光能量剂量范围;细胞死亡检测方法 阅读提示:Methods 2.7; Figure 3A, 3B |
| 吞噬实验 | CD47抗体处理浓度、共培养时间;NIR光剂量(5 J/cm²);CCK8测定条件 阅读提示:Methods 2.8; Figure 3C, 3D |
| 体内动物模型 | 细胞接种数量、Matrigel浓度;肿瘤切除标准(500 mm³)、分组(A、B、C)及各组处理;NIR光剂量(100 J/cm²)和时间点 阅读提示:Methods 2.9, 2.10; Figure 4, 5 |
| 离体人标本成像 | 患者纳入标准、CD47-AF790稀释比例和孵育时间、成像系统参数、TBR计算方法 阅读提示:Methods 2.12; Table 2; Figure 8 |