验证ZNF169在THCA组织和细胞中的表达
检测ZNF169在THCA组织和细胞系中的表达水平,以确定其异常表达。
使用IHC检测25例THCA组织和匹配的癌旁组织中ZNF169表达;使用RT-qPCR和western blot检测THCA细胞系(TPC1、BCPAP、K1)和正常甲状腺上皮细胞Nthy-ori 3-1中ZNF169的mRNA和蛋白水平。
ZNF169 promotes thyroid cancer progression via upregulating FBXW10.
包含体外细胞实验(CCK-8、集落形成、Transwell、流式凋亡/周期)、机制研究(荧光素酶、ChIP-qPCR)和动物体内移植瘤模型,并有功能验证和恢复实验。
人甲状腺癌细胞系TPC1、BCPAP、K1 正常甲状腺滤泡上皮细胞Nthy-ori 3-1 THCA患者组织样本(25例) 裸鼠皮下移植瘤模型
ZNF169在THCA组织和细胞系中高表达(IHC、RT-qPCR、western blot)。 敲低ZNF169抑制增殖和迁移,过表达促进(CCK-8、集落形成、Transwell)。 ZNF169调控凋亡和细胞周期(流式细胞术)。 ZNF169直接结合FBXW10启动子并增强其转录(荧光素酶、ChIP-qPCR)。 FBXW10敲低逆转ZNF169过表达诱导的增殖和肿瘤生长(体外和体内恢复实验)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测ZNF169在THCA组织和细胞系中的表达水平,以确定其异常表达。
使用IHC检测25例THCA组织和匹配的癌旁组织中ZNF169表达;使用RT-qPCR和western blot检测THCA细胞系(TPC1、BCPAP、K1)和正常甲状腺上皮细胞Nthy-ori 3-1中ZNF169的mRNA和蛋白水平。
探究敲低ZNF169对THCA细胞增殖、迁移、凋亡和细胞周期的影响。
使用shRNA(shZNF169#1、shZNF169#2)转染TPC1和BCPAP细胞,通过CCK-8、集落形成、Transwell实验检测增殖和迁移,流式细胞术检测凋亡和细胞周期。
验证ZNF169过表达是否增强THCA细胞的增殖、迁移能力。
使用ZNF169过表达质粒转染K1细胞,通过RT-qPCR和western blot验证过表达,通过CCK-8、集落形成、Transwell实验检测增殖和迁移,流式细胞术检测凋亡和细胞周期。
探究ZNF169是否调控FBXW10的表达及其潜在的结合机制。
通过RT-qPCR和western blot检测ZNF169敲低或过表达后FBXW10的表达变化;使用双荧光素酶报告实验检测ZNF169对FBXW10启动子活性的影响;使用ChIP-qPCR和琼脂糖凝胶电泳验证ZNF169与FBXW10启动子的结合。
评估FBXW10敲低对THCA细胞增殖和集落形成的影响。
使用shFBXW10(#1、#2)转染TPC1和BCPAP细胞,通过CCK-8和集落形成实验检测细胞增殖和集落形成能力。
证实FBXW10敲低能够逆转ZNF169过表达对细胞增殖和肿瘤生长的影响。
体外:在TPC1细胞中共转染shZNF169和FBXW10过表达质粒,或在K1细胞中共转染ZNF169过表达质粒和shFBXW10,检测细胞活力和集落形成。体内:将K1细胞(对照、ZNF169过表达、ZNF169过表达+shFBXW10)皮下注射裸鼠,测量肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗ZNF169抗体 | Abcam | ab225924 |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | ab6721 | |
| Vulcan Fast Red显色试剂盒 | BIOCARE MEDICAL | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Procell | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 逆转录 | M-MLV逆转录酶 | Promega | -- |
| RT-qPCR | SYBR Master Mixture | Takara Bio | -- |
| Agilent MX3000p实时荧光定量PCR系统 | Agilent | -- | |
| 凋亡检测 | eBioscience Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞周期分析 | FxCycle PI/RNase染色液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Guava easyCyte HT系统 | MilliporeSigma | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Bradford试剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗FBXW10抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-43814 | |
| 抗GAPDH抗体 | ProteinTech Group | 60004-1-Ig | |
| Transwell迁移实验 | FluoroBlok细胞培养 inserts | Corning | -- |
| 荧光素酶实验 | psiCheck 2载体 | Promega | -- |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling | 9005s |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing Vital River Laboratory Animal Technology | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集 | 患者样本:25例THCA患者,性别比例、年龄范围、匹配癌旁组织 阅读提示:Methods中Patient samples部分 |
| 细胞培养 | 细胞系来源:TPC1(BCRJ)、BCPAP(Cell Bank of CAS)、K1(Cellverse)、Nthy-ori 3-1(PROCELL);培养基:DMEM/F-12、RPMI-1640;添加物:2 mM谷氨酰胺、10%FBS、100 U/ml青霉素/链霉素 阅读提示:Methods中Cell culture and transfection部分 |
| 基因敲低和过表达 | shRNA序列(shZNF169#1、#2,shFBXW10#1、#2);转染试剂:Lipofectamine RNAiMAX(shRNA)、Lipofectamine 3000(质粒);稳定筛选:嘌呤霉素(2 μg/ml);过表达质粒:pCDH-CMV-ZNF169 阅读提示:Methods中Cell culture and transfection部分 |
| 细胞增殖和迁移检测 | CCK-8:2000细胞/孔,96孔板,检测24、48、72h;集落形成:1000细胞/孔,6孔板,14天;Transwell:3×10^4细胞/孔,24孔板 阅读提示:Methods中CCK-8 assay、Colony formation、Transwell assay部分 |
| 凋亡和细胞周期检测 | 凋亡:Annexin V-FITC和PI染色;细胞周期:FxCycle PI/RNase染色,488-nm激发,585/42 nm带通滤光片,Guava easyCyte HT系统 阅读提示:Methods中Apoptosis analysis、Cell cycle analysis部分 |
| 机制验证 | 双荧光素酶报告实验:psiCheck 2载体,Rluc和Luc序列;ChIP-qPCR:Cell Signaling试剂盒#9005s,anti-ZNF169抗体,qPCR引物序列 阅读提示:Methods中Luciferase assay、ChIP-qPCR部分 |
| 动物实验 | 小鼠:BALB/c nu,4-6周龄,每组5只;细胞注射量:10^7细胞/200μl PBS,皮下注射;肿瘤体积公式:1/2 × L × W²;25天后处死 阅读提示:Methods中Animal experiments部分 |