检测S1R在DN中的表达和定位
评估S1R在DN患者、db/db小鼠和高糖处理的HK-2细胞中的表达水平及细胞定位,为后续功能研究提供基础。
通过免疫组化、免疫荧光、qRT-PCR和Western blot检测S1R的表达,并在患者和小鼠肾组织中确定其定位于肾小管上皮细胞。
S1R mediates NRF2 dependent ferroptosis of renal tubular epithelial cells to promote renal fibrosis in diabetic nephropathy.
包含患者样本、db/db小鼠模型及HK-2细胞体外实验,明确功能性验证(siRNA敲低)和机制验证(分子对接、Co-IP)等证据层级。
HK-2人肾近端小管上皮细胞 db/db小鼠糖尿病肾病模型 DN患者肾组织样本
S1R在DN患者、db/db小鼠和HG处理的HK-2细胞中的表达水平及定位 S1R敲低对HG诱导的HK-2细胞铁死亡和纤维化的影响 NRF2敲低对S1R敲低保护作用的逆转效应 S1R与NRF2的相互作用及对NRF2核转位的影响 铁死亡相关检测(ACSL4、GPX4、铁含量、GSH、MDA、BODIPY染色)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估S1R在DN患者、db/db小鼠和高糖处理的HK-2细胞中的表达水平及细胞定位,为后续功能研究提供基础。
通过免疫组化、免疫荧光、qRT-PCR和Western blot检测S1R的表达,并在患者和小鼠肾组织中确定其定位于肾小管上皮细胞。
确认DN状态下肾小管上皮细胞发生铁死亡并伴随纤维化,以支持S1R可能参与此过程。
在DN患者和db/db小鼠肾组织及HG处理的HK-2细胞中,检测铁死亡标志物(ACSL4、GPX4、4-HNE、BODIPY染色)和纤维化标志物(FN、α-SMA)。
通过S1R功能缺失实验,评估S1R在HG诱导的肾小管上皮细胞铁死亡和纤维化中的作用。
使用siRNA敲低HK-2细胞中S1R表达,检测铁死亡和纤维化相关蛋白表达、细胞活力、脂质过氧化水平。
确认S1R敲低对纤维化的改善作用依赖于抑制铁死亡,而非其他细胞死亡途径。
在HG+si-S1R基础上添加铁死亡诱导剂Erastin,观察对纤维化和铁死亡标志物的影响。
确定S1R的作用是否通过NRF2通路实现,以及NRF2是否介导S1R敲低对铁死亡的保护作用。
在HG条件下,si-S1R和si-NRF2单独或联合转染HK-2细胞,检测铁死亡、纤维化相关蛋白表达及铁、GSH、MDA水平、线粒体膜电位。
阐明S1R与NRF2的结合方式及其对NRF2亚细胞定位和磷酸化状态的影响,以确定S1R调控NRF2的具体机制。
通过分子对接预测S1R-NRF2结合,使用Co-IP验证物理相互作用,Western blot检测p-NRF2和核内NRF2水平,免疫荧光观察NRF2定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | HK-2细胞 | Procell Life Science&Technology Co.,Ltd. | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | -- | -- |
| Opti-MEM培养基 | -- | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| 紫外分光光度计 | -- | -- | |
| PCR | C1000 Touch热循环仪 CFX96实时荧光定量PCR系统 | -- | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜(PVDF膜) | -- | -- | |
| S1R抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-137075 | |
| α-SMA抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53142 | |
| 纤维连接蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8422 | |
| NRF2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365949 | |
| ACSL4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365240 | |
| GPX4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166570 | |
| KEAP1抗体 | Proteintech | 10503-2-AP | |
| GAPDH抗体 | Servicebio | GB11002 | |
| β-微管蛋白抗体 | Servicebio | GB11017 | |
| ECL成像系统 | -- | -- | |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| 免疫组化/免疫荧光 | DAPI染色液 | Wuhan bioqiandu technology CO., China | B0011 |
| 铁、GSH和MDA检测 | 铁检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 微量还原型谷胱甘肽(GSH)检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 微量丙二醛(MDA)检测试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 酶标仪 | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | 免疫沉淀裂解液 | -- | -- |
| Protein A磁珠 | -- | -- | |
| Protein G磁珠 | -- | -- | |
| 分子对接 | AutoDock工具 | -- | -- |
| PyMOL软件 | -- | -- | |
| Bodipy荧光染色 | BODIPY 581/591 C11荧光探针 | -- | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞计数试剂盒 | Abbkine | BMU106-CN |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8.0软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HK-2细胞来源、培养条件(DMEM、5.5 mmol/L葡萄糖、10%胎牛血清)、细胞饥饿时间(24小时)、HG浓度(30 mmol/L)、甘露醇浓度(24.5 mmol/L) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture |
| siRNA转染 | siRNA序列(S1R-si3、NRF2-si2)、转染试剂(Lipofectamine 2000用量)、siRNA浓度(20 μM)、转染时间(6小时) 阅读提示:Materials and Methods: SiRNA transfection; Table 1/2 |
| 铁死亡诱导剂处理 | Erastin浓度(10 μM)和处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture; Results Figure 5 |
| 分子检测 | 抗体信息(克隆号、品牌)、稀释比例(1:1000)、二抗稀释比例(1:5000)、孵育条件(4°C过夜) 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting analysis |
| 实验动物 | 小鼠品系(C57BL/6J、db/db)、周龄(未明确)、饲养条件、处理时间(8周) 阅读提示:Materials and Methods: Animals |