体内代谢组学分析
揭示JEV感染引起的小鼠脑代谢谱变化,特别是谷氨酰胺-谷氨酸代谢
对JEV感染小鼠(早期和晚期脑炎)及对照脑组织进行非靶向代谢组学分析,包括LC-MS/MS、PCA、OPLS-DA、KEGG富集分析。
Glutamine-glutamate centered metabolism as the potential therapeutic target against Japanese encephalitis virus-induced encephalitis.
涉及体内小鼠模型和体外细胞模型,包括代谢组学、代谢通量分析、qRT-PCR、蛋白质印迹、RNA干扰及功能验证,并进行了体内治疗实验。
小鼠神经母细胞瘤细胞系Neuro2a C57BL/6小鼠感染模型 小鼠星形胶质细胞系C8-D1A BHK-21细胞(用于病毒滴度测定)
JEV感染剂量:MOI=0.1(Neuro2a细胞) JEV感染剂量:1×10^6 pfu(小鼠足垫注射) 谷氨酰胺补充剂量:250 mg/kg,腹腔注射,连续5天 外源添加谷氨酸浓度:250 µM 外源添加α-酮戊二酸浓度:1.75 mM, 3.5 mM, 7 mM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
揭示JEV感染引起的小鼠脑代谢谱变化,特别是谷氨酰胺-谷氨酸代谢
对JEV感染小鼠(早期和晚期脑炎)及对照脑组织进行非靶向代谢组学分析,包括LC-MS/MS、PCA、OPLS-DA、KEGG富集分析。
验证JEV感染对神经元谷氨酰胺代谢的影响
JEV感染Neuro2a细胞,进行代谢组学分析和[U-13C5]谷氨酰胺代谢通量分析。
分析JEV感染对谷氨酰胺转运和代谢酶表达的影响
通过qRT-PCR和Western blot检测谷氨酰胺转运体(如ASCT2)和代谢酶(如GLS、GLUD1、OGDH)的表达。
探究谷氨酸-α-酮戊二酸轴对JEV复制的影响
在JEV感染的Neuro2a细胞中添加谷氨酸、α-酮戊二酸或GABA,或使用siRNA敲低GLUD1和OGDH,然后检测病毒复制水平。
评估谷氨酰胺补充对JEV感染小鼠的保护作用
JEV感染小鼠后,每日腹腔注射谷氨酰胺或PBS,连续5天,监测存活率,并检测病毒载量和脑部病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Procell | PM150210 |
| 胎牛血清 | Gibco | 16140071 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Procell | PB180120 | |
| 最低必需培养基 | Procell | PM150410 | |
| 药物处理 | L-谷氨酰胺 | Procell Life Science & Technology | PB180420 |
| 谷氨酸 | Sigma-Aldrich | G1251 | |
| γ-氨基丁酸 | Topscience | T0508 | |
| 2-酮戊二酸二甲酯 | Sigma-Aldrich | 349631 | |
| 根皮素 | Topscience | T2924 | |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | Procell | PB180327 |
| 代谢通量分析 | [U-13C5]谷氨酰胺 | Cambridge Isotope Laboratories | 184161-19-1 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒1 | Omega Bio-Tek | R6834-02 |
| cDNA合成 | Hifair® II第一链cDNA合成预混液 | Yeasen | 11120ES60 |
| qRT-PCR | Hieff® qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen | 11201ES03 |
| Western blot | RIPA裂解液 | ThermoFisher | 89901 |
| 蛋白磷酸酶抑制剂 | Solarbio | P1260 | |
| 抗JEV NS3抗体 | GeneTex | GTX638821 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10068-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗GLS抗体 | Proteintech | 12855-1-AP | |
| 抗GLUD1抗体 | Proteintech | 14299-1-AP | |
| 抗OGDH抗体 | Proteintech | 15212-1-AP | |
| IRDye® 800CW山羊抗兔IgG | Abcam | ab216773 | |
| Alexa Fluor® 680驴抗小鼠IgG | Abcam | ab175774 | |
| 免疫组化 | 抗GABA抗体 | Sigma-Aldrich | A2052 |
| 抗L-谷氨酸抗体 | Abcam | ab9440 | |
| 免疫荧光 | Hoechst染料 | Sangon Biotech | E607302 |
| Cy3免疫荧光检测试剂盒 | Sangon Biotech | E670002 | |
| siRNA转染 | jetPRIME®转染试剂 | Polyplus | 101000046 |
| 酶活性检测 | 脱氢酶(α-KGDH)活性检测试剂盒 | Solarbio | BC0715 |
| 病毒滴度测定 | BHK-21细胞 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内代谢组学 | 小鼠品系、年龄、性别、JEV株、感染剂量和途径、取样时间点、样本量、排除标准。 阅读提示:Methods:Animal experiment 和 Sample preparation for metabolomics analysis |
| 体外细胞感染 | 细胞系、MOI、感染时间、培养基和血清浓度。 阅读提示:Methods:Cells and viruses 和 Viral infection and treatment with compounds |
| 药物处理 | 谷氨酰胺、谷氨酸、GABA、α-KG、phloretin的浓度、处理时间。 阅读提示:Methods:Compounds 和 Viral infection and treatment with compounds |
| 代谢通量分析 | 同位素标记谷氨酰胺浓度、标记时间点、细胞密度。 阅读提示:Methods:Metabolic flux analysis |
| siRNA转染 | siRNA序列、转染浓度、转染时间。 阅读提示:Methods:Small interfering RNA (si-RNA) transfection |