转录组测序鉴定 KIF20A 的免疫原性
评估 KIF20A 蛋白处理是否激活肿瘤免疫反应,确定其作为 HCC 疫苗抗原的潜力。
对 Hepa1-6 荷瘤小鼠进行 KIF20A 蛋白皮下注射(5 μg),3 天后取肿瘤进行 mRNA 测序,并进行 GO、KEGG、GSEA 和 ssGSEA 分析。
A KIF20A-based thermosensitive hydrogel vaccine effectively potentiates immune checkpoint blockade therapy for hepatocellular carcinoma.
包含体外 BMDC 和 T 细胞功能验证、CDX 和免疫人源化 PDX 模型体内验证,以及转录组测序分析,多个独立证据层级且包含功能与机制验证。
Hepa1-6 细胞系 原位和皮下 Hepa1-6 CDX 模型 免疫人源化 PDX 模型 小鼠 BMDC 和脾脏 T 细胞
KIF20A 蛋白和 R848 共包封于阳离子脂质体(K/RLip),EE 分别为 86.75% 和 68.92% K/RLip@Gel 的凝胶化温度为 36.17°C,37°C 下 5 分钟成胶 小鼠肿瘤模型中 K/RLip@Gel 剂量为 5 mg/kg,PD-L1 抗体剂量为 10 mg/kg 免疫人源化 PDX 模型中 PBMC 注射量为 5×10^8 细胞/只,hCD45+ 细胞比例超过 25% 视为模型成功 体外 BMDC 实验用 100 μL 固化凝胶孵育 24 小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估 KIF20A 蛋白处理是否激活肿瘤免疫反应,确定其作为 HCC 疫苗抗原的潜力。
对 Hepa1-6 荷瘤小鼠进行 KIF20A 蛋白皮下注射(5 μg),3 天后取肿瘤进行 mRNA 测序,并进行 GO、KEGG、GSEA 和 ssGSEA 分析。
优化 KIF20A 和 R848 的共递送,验证脂质体的理化性质和药物释放特性。
采用薄膜水化法制备 K/RLip,通过 TEM、DLS、Zeta 电位和药物释放实验进行表征,计算包封率和载药量。
制备具有温敏性和持续释放性能的水凝胶疫苗制剂。
合成 PLGA-PEG-PLGA 三嵌段共聚物,加入 K/RLip 形成水凝胶,通过流变学、ESEM、NIR-II 成像等表征其凝胶化、结构和体内滞留特性。
验证 K/RLip@Gel 是否能促进树突状细胞成熟和 T 细胞增殖及肿瘤浸润。
将 BMDC 与不同凝胶制剂共培养,通过流式细胞术检测 CD80+CD86+、MHC-I+、MHC-II+ 比例;将疫苗脉冲的 BMDC 与 CFDA-SE 标记的脾细胞共培养检测 T 细胞增殖;并观察 CD8+ T 细胞对 Hepa1-6 肿瘤球的浸润。
验证疫苗对 HCC 肿瘤生长的预防和治疗效果。
通过皮下和原位 Hepa1-6 肿瘤模型,给予不同制剂(RLip@Gel、KLip@Gel、K/RLip@Gel)治疗,监测肿瘤生长;通过预防性接种实验评估疫苗的预防效果。
验证疫苗联合 PD-L1 阻断是否增强抗肿瘤效果。
在皮下和原位 CDX 模型中,小鼠分为 PBS、aPD-L1、K/RLip@Gel、aPD-L1+K/RLip@Gel 四组,监测肿瘤生长和体重,通过流式检测 DC 和 T 细胞免疫反应。
在更接近人体的模型中验证疫苗联合治疗的疗效和免疫激活。
建立免疫人源化 PDX 模型,给予不同治疗,监测肿瘤体积和体重,流式检测 cDC 和 CD8+ T 细胞功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| MEM 培养基 | -- | -- | |
| 转录组测序 | Trizol 试剂 | Invitrogen | -- |
| NEBNext Ultra RNA 文库制备试剂盒 (Illumina) | NEB | 7530 | |
| NovaSeq6000 测序系统 | Illumina | -- | |
| Agilent 2100 生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 脂质体制备 | DOTAP | Aladdin Scientific | -- |
| 胆固醇 | Aladdin Scientific | -- | |
| DSPE-PEG2000 | Aladdin Scientific | -- | |
| R848 | Aladdin Scientific | -- | |
| KIF20A 蛋白 | Abmart | -- | |
| 迷你挤出器 | Avanti | -- | |
| 聚碳酸酯膜 | Millipore | -- | |
| 脂质体表征 | 透射电子显微镜 | FEI | -- |
| Zetasizer 粒度仪 | Malvern Panalytical | -- | |
| 荧光分光光度计 | Agilent | -- | |
| 超微量分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| 水凝胶制备 | 核磁共振氢谱 | Bruker | -- |
| 水凝胶表征 | 流变仪 | Anton Paar | -- |
| 细胞实验 | ACK 缓冲液 | Elabscience | -- |
| RPMI1640 培养基 | Gibco | -- | |
| β-巯基乙醇 | Procell | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-4 | MedChemExpress | -- | |
| CFDA-SE | MedChemExpress | -- | |
| CellTracker 深红色染料 | MKBio | -- | |
| CD8a+ T 细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 动物实验 | D-荧光素钾盐 | GlpBio | -- |
| 抗小鼠 PD-L1 抗体 | Bio X Cell | Clone: | |
| 抗人 PD-L1 抗体 | Bio X Cell | Clone: | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠 CD16/32 抗体 | Biolegend | -- |
| APC 偶联抗小鼠 CD11c 抗体 | Elabscience | -- | |
| FITC 偶联抗小鼠 CD80 抗体 | Elabscience | -- | |
| PE 偶联抗小鼠 CD86 抗体 | Elabscience | -- | |
| APC 偶联抗小鼠 CD3 抗体 | Elabscience | -- | |
| PerCP 偶联抗小鼠 CD45 抗体 | Elabscience | -- | |
| PE 偶联抗小鼠 CD4 抗体 | Elabscience | -- | |
| FITC 偶联抗小鼠 CD8a 抗体 | Elabscience | -- | |
| FcR 阻断溶液 | Biolegend | -- | |
| PerCP 偶联抗人 CD45 抗体 | Elabscience | -- | |
| FITC 偶联抗人 Lineage Cocktail-1 抗体 | Biolegend | -- | |
| APC 偶联抗人 HLA-DR 抗体 | Elabscience | -- | |
| PE 偶联抗人 CD11c 抗体 | Elabscience | -- | |
| APC 偶联抗人 CD3 抗体 | Elabscience | -- | |
| FITC 偶联抗人 CD8a 抗体 | Elabscience | -- | |
| PE/Cyanine7 偶联抗人 IFN-γ 抗体 | Biolegend | -- | |
| PE 偶联抗人颗粒酶 B 抗体 | AntibodySystem | -- | |
| FIX & PERM™ 细胞透化试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 细胞毒性实验 | CCK-8 细胞计数试剂盒 | -- | -- |
| PDX 模型建立 | PBMC 分离管 | Stemcell Technology | -- |
| Histopaque®-1077 分离液 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 转录组测序分析 | KIF20A 蛋白处理剂量(5 μg)和注射途径(皮下);处理时间(3 天);每组样本量(n=4)。 阅读提示:Methods: Transcriptomic mRNA sequencing analysis |
| K/RLip 脂质体制备 | DOTAP、胆固醇、DSPE-PEG2000 的用量(28 mg, 1.3 mg, 11.2 mg);KIF20A 蛋白和 R848 的用量(0.5 mg, 2 mg);挤出膜孔径和次数(200 nm 和 100 nm 各 11 次);透析 MWCO(200 kDa)和时间(12 h)。 阅读提示:Methods: Preparation of KIF20A and R848 co-encapsulating liposome (K/RLip) |
| 水凝胶制备 | PLGA-PEG-PLGA 浓度(15% w/v);K/RLip 浓度(1 mg/mL);混合时间和温度(4°C, 1 h)。 阅读提示:Methods: Preparation of thermosensitive hydrogel vaccine (K/RLip@Gel) and its characterization |
| 体外 DC 和 T 细胞实验 | BMDC 与凝胶孵育时间(24 h);T 细胞增殖共培养时间(3 天);CD8+ T 细胞浓度(1×10^5 cells/mL)和孵育时间(24 h)。 阅读提示:Methods: Flow Cytometry of BMDCs, T cell proliferation rate, T cell infiltration |
| CDX 模型体内治疗 | 小鼠品系、性别和年龄(8 周龄雄性 C57BL/6J);肿瘤细胞接种剂量(1×10^6 细胞);疫苗剂量(5 mg/kg)和给药途径(皮下);aPD-L1 剂量(10 mg/kg)和给药途径(腹腔);治疗时间点和监测时长(原位 13 天,皮下 16 天);每组样本量(原位 n=4,皮下 n=5)。 阅读提示:Methods: Establishment of Hepa1-6 tumor models, In vivo K/RLip@Gel and PD-L1 blockade therapy on Hepa1-6 tumor model |
| 免疫人源化 PDX 模型 | PBMC 来源和分离方法;PBMC 注射剂量(5×10^8 细胞/只);模型建立标准(肿瘤体积约 100 mm³,hCD45+ 细胞比例 >25%);疫苗剂量(5 mg/kg)和 aPD-L1 剂量(10 mg/kg);每组样本量(n=3)。 阅读提示:Methods: Establishment of immune-humanized PDX model, In vivo K/RLip@Gel and PD-L1 blockade therapy on PDX model |