细胞模型建立与转染
评估miRNA-136-5p对前列腺癌细胞功能的影响
将PC3和DU145细胞分为对照组、NC mimics组和miRNA-136-5p mimics组,转染浓度为0.1 µM,孵育48小时。
Relationship between circulating miRNA-222-3p and miRNA-136-5p and the efficacy of docetaxel chemotherapy in metastatic castration-resistant prostate cancer patients.
包含体外细胞实验(CCK-8、流式凋亡、Transwell迁移侵袭)和临床样本分析(循环miRNA检测、ROC预测、生存分析),但缺乏动物模型和机制验证。
PC3细胞和DU145细胞 多西他赛耐药PC3(DTX-R-PC3)和DU145(DTX-R-DU145)细胞 mCRPC患者外周血样本
miRNA-136-5p mimics处理浓度0.1 µM,处理时间48小时 PC3和DU145细胞培养条件(37°C、5% CO2、F-12K和MEM培养基) mCRPC患者接受多西他赛75mg/m2静脉输注每3周一次 化疗反应定义基于PSA变化(部分缓解:PSA降低≥50%,进展:PSA升高≥25%) RT-qPCR使用U6和Cel-miRNA-39作为内参
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估miRNA-136-5p对前列腺癌细胞功能的影响
将PC3和DU145细胞分为对照组、NC mimics组和miRNA-136-5p mimics组,转染浓度为0.1 µM,孵育48小时。
验证miRNA-136-5p对细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响
采用CCK-8检测细胞活力,流式细胞术检测凋亡,Transwell实验检测迁移和侵袭。
评估多西他赛耐药细胞中miRNA水平的变化
通过RT-qPCR检测DTX-R-PC3和DTX-R-DU145细胞中miRNA-136-5p和miRNA-222-3p的表达,与亲本细胞比较。
分析循环miRNA水平与多西他赛化疗反应及预后的关系
收集30例mCRPC患者外周血,RT-qPCR检测循环miRNA水平,根据PSA和影像学评估化疗反应,进行ROC分析和生存分析。
预测miRNA-136-5p的靶基因并分析其参与的信号通路
使用PITA、TargetScan和miRanda数据库预测靶基因,KEGG通路富集分析,Cytoscape构建网络,GEPIA分析差异表达,PROGgeneV2分析预后。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12K培养基 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd | -- |
| MEM培养基(含非必需氨基酸) | Procell Life Science & Technology Co., Ltd | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | miRNA-136-5p模拟物 | GenePharma | -- |
| miRNA阴性对照 | GenePharma | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| 流式细胞术 | 膜联蛋白V-PE | BD Biosciences | -- |
| 7-AAD | BD Biosciences | -- | |
| 结合缓冲液 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| SYBR Premix Ex Taq | Thermo Fisher Scientific Inc | -- | |
| ABI QuantStudio 6 Flex RT-PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 5 | -- | -- |
| IBM SPSS软件(版本26.0) | IBM | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源和培养条件(培养基、血清浓度、抗生素浓度);转染浓度和时间(0.1 µM,48小时) 阅读提示:Methods 细胞培养和转染 |
| CCK-8细胞增殖检测 | 细胞接种密度(5×10^3细胞/孔)、CCK-8孵育时间(1小时)、检测波长(450nm) 阅读提示:Methods CCK-8实验 |
| 流式细胞术凋亡检测 | Annexin V-PE和7-AAD染色量和孵育条件(5 µL和10 µL,4°C避光10分钟) 阅读提示:Methods 流式细胞术 |
| Transwell迁移和侵袭实验 | Transwell孔径(8.0 μm)、上室细胞密度(1×10^6 cells/mL)、孵育时间(24小时)、基质胶预涂量(100 µL) 阅读提示:Methods Transwell实验 |
| 临床样本收集与定义 | 患者纳入排除标准、化疗方案(多西他赛75mg/m2每3周)、外周血收集时间点、化疗反应定义(PSA变化百分比) 阅读提示:Methods 研究参与者 |
| RT-qPCR | RNA提取方法(TRIzol)、内参基因(U6和Cel-miRNA-39)、PCR体系(20 µL)和循环条件(95°C 10min,40循环95°C 15s, 60°C 60s) 阅读提示:Methods 实时定量PCR |