体外细胞增殖与存活检测
评估AJ单独及联合RT对NSCLC细胞存活和增殖的影响。
使用CCK-8检测不同浓度AJ(0-400μg/mL)处理24h和48h后的细胞存活率,并检测AJ(25μg/mL)和RT(8Gy)处理24h后的细胞存活率;使用克隆形成实验检测处理后的细胞增殖能力。
Ampelopsis japonica enhances the effect of radiotherapy in non-small cell lung cancer.
包含体外细胞实验(CCK-8增殖、克隆形成、流式凋亡、Western blot)和体内移植瘤模型,并融合生物信息学分析,多层级验证功能与机制。
HCC827细胞 H1299细胞 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
AJ浓度25μg/mL处理24h RT剂量8Gy处理24h 细胞分组:对照、AJ、RT、RT+AJ 体内AJ给药剂量:低5mg/kg,中10mg/kg,高20mg/kg,口服灌胃,每日一次,共15天 体内RT方案:第10、12、14天给予8Gy,总剂量24Gy
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估AJ单独及联合RT对NSCLC细胞存活和增殖的影响。
使用CCK-8检测不同浓度AJ(0-400μg/mL)处理24h和48h后的细胞存活率,并检测AJ(25μg/mL)和RT(8Gy)处理24h后的细胞存活率;使用克隆形成实验检测处理后的细胞增殖能力。
评估AJ单独及联合RT对NSCLC细胞凋亡的影响。
使用Annexin V-FITC/PI双染流式细胞术检测处理后的细胞凋亡率,并通过Western blot检测凋亡相关蛋白c-caspase-3、Bax和Bcl-2的表达。
识别AJ活性成分,预测调控靶点及信号通路。
利用TCMSP数据库筛选AJ活性成分(OB≥30%,DL≥0.18),DrugBank和GeneCards数据库获取靶点,Venn图获取交集基因(71个),并进行GO和KEGG富集分析。
验证AJ对PI3K-Akt信号通路蛋白表达的影响。
通过Western blot检测NSCLC细胞中p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt、p-NOS3、NOS3蛋白水平,并比较各组表达差异。
在体内评估AJ联合RT对NSCLC肿瘤生长的影响。
使用BALB/c裸鼠皮下注射HCC827细胞建立移植瘤模型,第10天起给予RT和不同剂量AJ处理,定期测量肿瘤体积,第25天取材称重。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 制备AJ提取物 | 白蔹干粉 | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd. | -- |
| 二甲基亚砜 | Beyotime | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Procell | -- | |
| CCK-8检测 | 细胞计数试剂盒-8试剂 | Beyotime | C0037 |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| 克隆形成实验 | 胰蛋白酶(0.25%) | -- | -- |
| 磷酸盐缓冲液 | Beyotime | -- | |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062S |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞仪 | Becton, Dickinson and Company | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 山羊抗兔IgG H&L(HRP) | Abcam | ab6721 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Yeasen | 36208ES60 | |
| 抗c-caspase-3抗体 | HuaBio | ET1602-39 | |
| 抗Bax抗体 | HuaBio | ET1603-34 | |
| 抗Bcl-2抗体 | HuaBio | ET1603-11 | |
| 抗p-PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | #13857 | |
| 抗PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | #4249 | |
| 抗p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #9272 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #9271 | |
| 抗p-NOS抗体 | Cell Signaling Technology | #2977 | |
| 抗NOS抗体 | Cell Signaling Technology | #9575 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 动物实验 | RS 2000pro生物X射线辐照仪 | Rad Source | -- |
| 水合氯醛(4%) | -- | -- | |
| 游标卡尺 | -- | -- | |
| 生物信息学分析 | Image J软件 | National Institutes of Health | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(HCC827、H1299)来源、培养基(RPMI-1640含10%FBS和1%青霉素-链霉素)、CO2浓度(5%)、温度(37°C)、AJ浓度(25μg/mL)、RT剂量(8Gy)、处理时间(24h) 阅读提示:见Materials and methods中的Cell culture and treatment |
| CCK-8检测 | 细胞接种密度(5×10^3细胞/孔)、CCK-8处理时间(1h)、检测波长(450nm) 阅读提示:见Materials and methods中的Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay |
| 克隆形成实验 | 细胞接种密度(1000细胞/孔)、培养时间(14天)、结晶紫染色时间(15min)、4%多聚甲醛固定时间(30min) 阅读提示:见Materials and methods中的Colon formation assay |
| 凋亡检测 | 细胞数量(5×10^4)、离心条件(1000g, 5min)、Annexin V-FITC和PI孵育时间(15min, 25°C)、流式细胞仪型号(BD) 阅读提示:见Materials and methods中的Apoptosis detection |
| Western blot | 一抗稀释比例如c-caspase-3(1:5000)、Bax(1:20000)、Bcl-2(1:5000)、p-PI3K(1:1000)等;二抗(Goat Anti-Rabbit IgG H&L [HRP])稀释比(1:2000);孵育时间:一抗4°C过夜,二抗室温2h 阅读提示:见Materials and methods中的Western blot assay |
| 异种移植瘤模型 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)及体重(20±2g)、细胞植入数(1×10^6 HCC827细胞)、RT方案(第10、12、14天,每次8Gy,总剂量24Gy)、AJ给药剂量(低5mg/kg、中10mg/kg、高20mg/kg)、给药方式(口服灌胃,每日一次,共15天)、肿瘤取材时间(第25天) 阅读提示:见Materials and methods中的Xenograft tumor model |
| 生物信息学分析 | 数据库(TCMSP、DrugBank、GeneCards)、筛选条件(OB≥30%,DL≥0.18) 阅读提示:见Materials and methods中的Bioinformatic analysis |
| 统计分析 | 统计方法(正态分布组间用one-way ANOVA + Tukey检验,非正态用Kruskal-Wallis + Dunn检验)、显著性水平(P<0.05)、独立实验次数(3次,每次三重复) 阅读提示:见Materials and methods中的Statistical analysis |