HDC成分鉴定与分子对接
鉴定HDC煎剂和含药血清中的主要代谢物,并通过分子对接预测活性代谢物与铁死亡关键蛋白的结合能力。
利用液相色谱-质谱联用技术检测HDC煎剂和含药血清的代谢物,并使用MRM定量AS-IV和SAB;利用AutoDock Vina进行分子对接,计算AS-IV和SAB与GPX4、FSP1、DHODH的结合能。
Combination decoction of Astragalus mongholicus and Salvia miltiorrhiza mitigates pressure-overload cardiac dysfunction by inhibiting multiple ferroptosis pathways.
包含体外细胞模型、体内TAC大鼠模型,以及功能验证(抑制剂干预)和机制验证(蛋白水平和下游指标检测)。
H9c2大鼠心肌细胞 横向主动脉缩窄(TAC)诱导的心力衰竭SD大鼠模型
HDC煎剂浓度:0.938 g/mL(高剂量)和0.469 g/mL(低剂量),大鼠给药体积5 mL/kg AngII诱导浓度4 μM,作用48小时 抑制剂浓度:Era 5 μM,iFSP1 1 μM,BQR 10 μM(体外);体内剂量分别为Era 8.75 μmol/kg,iFSP1 0.875 μmol/kg,BQR 8.75 μmol/kg TAC手术主动脉弓缩窄至1.0 mm,术后8周形成HF模型 动物实验中各抑制剂采用腹腔注射,每两天一次,持续4周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定HDC煎剂和含药血清中的主要代谢物,并通过分子对接预测活性代谢物与铁死亡关键蛋白的结合能力。
利用液相色谱-质谱联用技术检测HDC煎剂和含药血清的代谢物,并使用MRM定量AS-IV和SAB;利用AutoDock Vina进行分子对接,计算AS-IV和SAB与GPX4、FSP1、DHODH的结合能。
确定最佳AngII诱导浓度和时间,建立可靠的体外心肌细胞肥大模型。
使用不同浓度AngII(0-16 μM)处理H9c2细胞24-72小时,通过CCK-8检测细胞活力,并通过显微观察评估细胞大小。
建立压力超负荷所致HF的动物模型,用于评估HDC的体内保护作用。
对SD大鼠进行横向主动脉缩窄术(TAC),术后8周通过超声心动图评估LVEF和NT-proBNP确定HF模型成立。
评估HDC对HF细胞模型和动物模型的功能保护作用,并比较不同剂量的效果。
细胞实验中使用含药血清(10%)干预,动物实验中灌胃给予HDC煎剂(5 mL/kg),同时设置Fer-1和Era作为对照,评估细胞活力、NT-proBNP、心脏大小、LVEF和心肌纤维化等指标。
检测与铁死亡相关的生化和超微结构指标,并评估HDC对铁死亡通路的调节作用。
检测GSH、MDA、Fe2+、CoQ10H2水平,流式细胞术检测JC-1染色评估线粒体膜电位,透射电镜观察线粒体超微结构,Western blot检测GPX4、FSP1、DHODH蛋白水平。
通过使用针对性抑制剂(Era、iFSP1、BQR)确定GPX4、FSP1和DHODH在HDC抑制铁死亡和改善HF中的作用。
在体外和体内分别使用Era、iFSP1和BQR抑制相应通路,观察HDC保护作用的变化,并设计双抑制实验比较三个蛋白的介导强度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物干预 | 血管紧张素II | Yuanye | -- |
| 阳性对照药物 | Ferrostatin-1 | Selleck | -- |
| 抑制剂干预 | Brequinar | MedChemExpress | -- |
| Erastin | Selleck | -- | |
| iFSP1 | Macklin | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Cellverse | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | -- | |
| 二甲基亚砜 | Solarbio | -- | |
| Western blot | 抗GPX4单克隆抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig |
| 抗FSP1单克隆抗体 | Proteintech | 68049-1-Ig | |
| 抗DHODH单克隆抗体 | Proteintech | 67977-1-Ig | |
| 抗GAPDH兔多克隆抗体 | Servicebio | GB11002 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Beyotime | A0208, | |
| SuperSignal ECL化学发光试剂盒 | Beyotime | P0018M | |
| 抗体剥离液 | NCM biotech | WB6200 | |
| 细胞染色 | 结晶紫染色试剂盒 | Beyotime | C0121 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0042 |
| ELISA | 大鼠NT-proBNP ELISA试剂盒 | DreamBio | -- |
| 大鼠CoQ10H2 ELISA试剂盒 | DreamBio | -- | |
| 生化指标检测 | 脂质过氧化(MDA)检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| 组织Fe2+比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K773-M | |
| 细胞Fe2+比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M | |
| 小鼠超声 | 高分辨率超声系统 | VisualSonics | Vevo |
| 组织学染色 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染色液 | Beyotime | C2006 |
| 流式细胞术 | CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 | HITACHI | HT7800 |
| 动物实验 | 注射用青霉素钠 | Shandong Lukang | 42220302 |
| 动物模型 | SD大鼠 | -- | -- |
| 细胞模型 | H9c2细胞 | Procell | CL-0089 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与肥大模型 | 细胞系H9c2(Procell, CL-0089);培养基DMEM(含1.5 g/L NaHCO3)+10% FBS+1%青霉素/链霉素;AngII浓度4 μM,作用48小时;细胞培养条件37°C,5% CO2 阅读提示:见Methods 2.3 和2.6 |
| 动物模型建立 | SD大鼠(雄性,180-200 g);TAC手术主动脉弓缩窄至1.0 mm;术后8周评估LVEF和NT-proBNP确认HF,并进行分组 阅读提示:见Methods 2.7 和Results 3.3 |
| 药物干预 | HDC煎剂制备:AM:SM=2:1,煎煮后浓缩至0.938 g/mL(高剂量),0.469 g/mL(低剂量);灌胃给药5 mL/kg,每日两次,持续7天(制备含药血清用);动物实验灌胃持续4周 阅读提示:见Methods 2.4 和2.7 |
| 抑制剂干预 | 体外:Era 5 μM,iFSP1 1 μM,BQR 10 μM;体内:Era 8.75 μmol/kg,iFSP1 0.875 μmol/kg,BQR 8.75 μmol/kg,腹腔注射,隔天一次,持续4周 阅读提示:见Methods 2.6 和2.7 |
| 铁死亡指标检测 | GSH、MDA、Fe2+、CoQ10H2检测试剂盒及操作步骤;JC-1染色后流式细胞术检测;透射电镜观察线粒体形态 阅读提示:见Methods 2.10-2.15 |