评估HL-60/ADR细胞的耐药性和GANT61的细胞毒性
验证HL-60/ADR细胞对ADR的耐药性,并确定GANT61的抑制浓度
通过CCK-8测定HL-60/WT和HL-60/ADR细胞对ADR和GANT61的IC50,并进行EDU+染色检测细胞增殖
GANT61 surmounts drug resistance of ADR by upregulating lysosome activities and reducing BCL2 expression in HL-60/ADR cells.
该研究包含体外细胞模型(HL-60/ADR等)的功能实验、药物敏感性检测、凋亡分析、Western blot/RT-PCR验证,以及转录组学分析和公共数据库分析,但缺乏动物模型和患者样本的体内验证。
HL-60/ADR细胞系 HL-60/WT细胞系 THP-1细胞系 AML原代细胞
HL-60/ADR细胞对ADR的耐药性(IC50显著高于HL-60/WT) GANT61联合ADR的协同效应(CI=0.639) GANT61处理浓度16µM和时长24小时 HL-60/ADR细胞中BCL2表达下调 溶酶体相关基因(如ASAH1、GNS、NPC2、SLC17A5)表达上调
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HL-60/ADR细胞对ADR的耐药性,并确定GANT61的抑制浓度
通过CCK-8测定HL-60/WT和HL-60/ADR细胞对ADR和GANT61的IC50,并进行EDU+染色检测细胞增殖
评估GANT61与ADR联合是否协同抑制细胞增殖和诱导凋亡
HL-60/ADR细胞用ADR(8µM)和GANT61(16µM)单独或联合处理,通过CCK-8、EDU+染色和流式细胞术检测细胞活力和凋亡
评估GANT61联合ADR对AML原代细胞的杀伤作用,并验证对正常供体细胞毒性
分离健康供体和初诊AML患者的原代细胞,用ADR(1.6µM)和GANT61(20µM)处理,通过CCK-8检测细胞活力
通过转录组分析识别GANT61处理后差异表达基因和相关通路
对HL-60/ADR细胞(对照组和GANT61处理组)进行RNA-seq,用KEGG和GSEA分析差异表达基因,并验证关键凋亡和溶酶体基因的表达
验证GANT61是否通过下调BCL2和上调溶酶体活性来发挥作用,并探索BCL2抑制剂联合治疗的效果
通过Western blot和RT-PCR检测GLI1/OE和HL-60/ADR细胞中BCL2和Bax的表达,进行PPI网络分析和数据库相关性分析,并用BCL2抑制剂venetoclax联合GANT61和ADR处理细胞,检测凋亡和细胞活力
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | GANT61 | APExBIO | A1615 |
| 阿霉素 | MedChemExpress | HY-15142 | |
| 维奈克拉 | MedChemExpress | HY-15531 | |
| 伊达比星 | MedChemExpress | HY-17381A | |
| 阿糖胞苷 | MedChemExpress | HY-13605 | |
| 脂质体米托蒽醌 | Cspc Pharmaceutical Group Limited | H20220001 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries Inc. | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Corning Inc. | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojin Laboratories | -- |
| 细胞增殖检测 | Cell-Light EDU Apollo567体外试剂盒 | Ribobio | -- |
| 凋亡检测 | Annexin-V | Becton Dickinson | -- |
| 7-AAD | Becton Dickinson | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 牛血清白蛋白 | Bio Sharp Sigma | A-4612 | |
| GLI1抗体 | Cell Signaling Technology | 3538 | |
| BCL2抗体 | Wanleibio | WL01556 | |
| Bax抗体 | Wanleibio | WL01637 | |
| PUMA抗体 | ABclonal | A3753 | |
| TP53抗体 | Wanleibio | WL01919 | |
| P21抗体 | Wanleibio | WL0326 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | SA00001-2 | |
| RT-PCR | Trizol试剂 | TaKaRa | -- |
| 两步逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| 实时PCR引物 | Integrated DNA Technologies | -- | |
| ABI StepOnePlus仪器 | Applied Biosystems | -- | |
| 慢病毒感染 | GLI1过表达慢病毒 | GeneChem | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | 分光光度计 | Bio Tek Instruments | -- |
| Western blot | Chei DocTMMP系统 | Bio-Rad | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(HL-60/ADR来自湘雅医学院细胞资源中心,HL-60/WT和THP-1来自Procell),培养基成分(RPMI-1640+10%FBS+1%双抗),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods中的'Cell lines and culture conditions' |
| 药物处理 | GANT61浓度(16µM),ADR浓度(8µM),venetoclax浓度(4µM),处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods中的'Drugs'和Results中图1、图6图注 |
| 细胞活力检测 | 细胞密度5×10^4 cells/ml,CCK-8试剂,孵育时间(3小时),检测波长450nm 阅读提示:Materials and methods中的'Cytotoxicity assay' |
| 凋亡检测 | 细胞数量1×10^6,Annexin-V和7-AAD稀释比例1:20和1:10,孵育条件(冰上避光15分钟),流式细胞仪 阅读提示:Materials and methods中的'Apoptosis assessment' |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比(GLI1 1:1000,BCL2 1:1000等),SDS-PAGE凝胶浓度10%,一抗孵育(4°C过夜),二抗孵育,成像系统(Chei DocTMMP) 阅读提示:Materials and methods中的'Western blot analysis' |
| 基因表达检测 | 细胞数量1×10^6,Trizol提取RNA,两步法逆转录,引物序列,实时PCR仪器(ABI StepOnePlus) 阅读提示:Materials and methods中的'Quantitative RT-PCR' |
| 转录组分析 | 细胞数量1×10^7,GANT61处理24小时,三次重复,测序平台(Heyuan Biotechnology) 阅读提示:Materials and methods中的'RNA-Seq analysis' |