临床样本表达分析
明确STEAP3在LUSC组织和细胞系中的表达水平及其临床意义。
使用TCGA数据库和40对LUSC及癌旁组织进行mRNA和蛋白表达分析,免疫组化检测蛋白表达,并在4种LUSC细胞系和BEAS-2B中检测表达水平。
TFAP2C-mediated transcriptional activation of STEAP3 promotes lung squamous cell carcinoma progression by regulating the β-catenin pathway.
包含临床样本、细胞系、体内移植瘤和转移模型多个证据层级,并通过敲低/过表达、ChIP、荧光素酶报告基因和拯救实验进行功能与机制验证。
LUSC细胞系(SK-MES-1、NCI-H520等) BEAS-2B正常支气管上皮细胞 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 BALB/c裸鼠尾静脉转移模型
STEAP3在LUSC组织和细胞系中的表达水平 STEAP3敲低和过表达对细胞增殖、迁移、侵袭和EMT的影响 TFAP2C对STEAP3的转录调控及结合位点 TFAP2C/STEAP3轴在体内肿瘤生长和转移中的作用 β-catenin通路激活状态及下游靶基因表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确STEAP3在LUSC组织和细胞系中的表达水平及其临床意义。
使用TCGA数据库和40对LUSC及癌旁组织进行mRNA和蛋白表达分析,免疫组化检测蛋白表达,并在4种LUSC细胞系和BEAS-2B中检测表达水平。
验证STEAP3对LUSC细胞增殖、迁移、侵袭和EMT的影响。
在SK-MES-1细胞中敲低STEAP3,在NCI-H520细胞中过表达STEAP3,通过CCK-8、集落形成、流式细胞周期、划痕和Transwell实验检测细胞表型。
探究STEAP3对EMT标志物及β-catenin信号通路的影响。
通过免疫荧光检测E-cadherin和N-cadherin表达,Western blot检测Vimentin、Slug、β-catenin及其下游靶基因c-myc和cyclin D1的表达。
鉴定STEAP3的上游转录因子并验证其调控关系。
使用GEPIA数据库分析TFAP2C与STEAP3的相关性,通过ChIP实验检测TFAP2C与STEAP3启动子的结合,双荧光素酶报告实验验证转录激活作用。
验证TFAP2C通过STEAP3发挥功能。
在SK-MES-1细胞中敲低TFAP2C并同时过表达STEAP3,检测细胞增殖、周期、迁移、侵袭及β-catenin通路变化。
评估STEAP3在体内对LUSC肿瘤生长和转移的影响。
皮下注射稳定转染细胞建立移植瘤模型,监测肿瘤体积和重量;尾静脉注射建立转移模型,通过活体成像和H&E染色评估转移。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | STEAP3抗体 | Proteintech | 28478-1-AP |
| PCNA抗体 | Abcam | ab92552 | |
| Ki-67抗体 | Abcam | ab92742 | |
| TFAP2C抗体 | Proteintech | 14572-1-AP | |
| HRP标记的IgG | Abcam | ab205718 | |
| DAB显色液 | Proteintech | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| MEM培养基 | Gibco | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒(带gDNA Eraser) | TaKaRa | -- |
| qPCR | TB Green Premix Ex Taq II FAST qPCR试剂 | TaKaRa | -- |
| Bio-Rad CFX96系统 | Bio-Rad | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 稳定筛选 | G418 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | CST | -- |
| 抗Vimentin抗体 | CST | 3390 | |
| 抗Slug抗体 | CST | 9585 | |
| 抗c-myc抗体 | Proteintech | 10828-1-AP | |
| 抗cyclin D1抗体 | Abcam | ab16663 | |
| 抗β-catenin抗体 | CST | 37447 | |
| HRP标记的IgG | Proteintech | SA00001-1, | |
| ECL化学发光试剂 | Abcam | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | Dojindo Laboratories | -- |
| 集落形成实验 | 0.5%结晶紫溶液 | Beyotime | -- |
| ChIP实验 | SDS裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 抗TFAP2C抗体 | Abcam | ab218107 | |
| 非特异性IgG | Abcam | ab172730 | |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | -- |
| 免疫荧光 | 抗E-cadherin抗体 | Proteintech | 20874-1-AP |
| 抗N-cadherin抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| Cy3标记的IgG | Proteintech | SA00009-2 | |
| DAPI | MedChemExpress | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织样本采集 | 40对LUSC及癌旁正常组织来自盛京医院;患者未接受术前放化疗。 阅读提示:Materials and methods - Clinical specimens |
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基条件:BEAS-2B用DMEM+10%FBS,SK-MES-1用MEM+10%FBS,NCI-H520、H226、H1703用RPMI-1640+10%FBS,37℃、5%CO2。 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| 稳定转染 | 使用pLKO.1-neo和pcDNA-3.1载体,Lipofectamine 3000转染,G418 (400 µg/mL)筛选超过4周。 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection |
| 细胞功能实验 | CCK-8检测时间点;集落形成培养14天;划痕实验时间点0和24小时;Transwell实验接种1×10^4细胞,孵育24小时。 阅读提示:Materials and methods - CCK-8 assay, Colony formation assay, Wound healing assay, Transwell assays |
| 转录调控实验 | ChIP用anti-TFAP2C (#ab218107)和IgG;荧光素酶报告用pGL3-Basic构建体。 阅读提示:Materials and methods - ChIP assay, Luciferase reporter assay |
| 体内实验 | BALB/c裸鼠,6周龄,20-24g;皮下接种1×10^7细胞,监测35天;尾静脉注射1×10^6细胞,42天。 阅读提示:Materials and methods - In vivo tumor xenograft model, Metastatic HCC model |