PTEN甲基化状态检测
筛选PTEN完全甲基化的T-ALL细胞系用于后续实验
使用MS-PCR检测CCRF-CEM、Molt-4、SUP-B15和Jurkat细胞中PTEN基因启动子区域的甲基化状态,并确定完全甲基化的细胞系。
Effect of 5-Aza-2'-deoxycytidine on T-cell acute lymphoblastic leukemia cell biological behaviors and PTEN expression.
包含细胞模型、MS-PCR甲基化检测、功能实验(增殖、凋亡、周期、侵袭迁移)、Western blot机制验证,以及PTEN沉默和恢复的拯救实验,多层级验证。
T-ALL细胞系CCRF-CEM、Molt-4、SUP-B15、Jurkat Jurkat细胞(用于后续实验)
PTEN完全甲基化的Jurkat细胞 5-Aza-dC处理浓度10 μmol/L 5-Aza-dC处理时间24 h PTEN沉默和恢复的转染序列 DDP浓度梯度(0, 5, 10, 20, 30, 40 μmol/L)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选PTEN完全甲基化的T-ALL细胞系用于后续实验
使用MS-PCR检测CCRF-CEM、Molt-4、SUP-B15和Jurkat细胞中PTEN基因启动子区域的甲基化状态,并确定完全甲基化的细胞系。
确定完全去除PTEN甲基化的最低有效浓度和时间
用不同浓度(0, 1, 2, 5, 10, 15 μmol/L)的5-Aza-dC处理Jurkat细胞24 h,以及用10 μmol/L处理不同时间(0, 12, 24, 48, 72 h),通过MS-PCR检测PTEN甲基化完全去除的条件。
评估5-Aza-dC对T-ALL细胞增殖、活力、凋亡、周期、侵袭和迁移的影响
用10 μmol/L 5-Aza-dC处理Jurkat细胞24 h,采用CCK-8检测增殖、MTT检测活力、流式细胞术检测凋亡和周期、transwell检测侵袭和迁移。
探究5-Aza-dC对PTEN表达及PI3K/AKT信号通路的影响
通过RT-PCR检测PTEN、DNMT1、DNMT3a、MBD2和MeCP2的mRNA表达,通过Western blot检测PTEN、PI3K、AKT和mTOR的蛋白表达。
验证PTEN沉默是否逆转5-Aza-dC的抗肿瘤作用
将Jurkat细胞分为control(sh-NC)、5-Aza-dC+sh-NC、control(sh-PTEN)、5-Aza-dC+sh-PTEN组,通过shRNA转染沉默PTEN,检测细胞生物学行为及相关基因表达。
验证PTEN过表达是否增强5-Aza-dC的抗肿瘤作用
将Jurkat细胞分为control(oe-NC)、5-Aza-dC+oe-NC、control(oe-PTEN)、5-Aza-dC+oe-PTEN组,通过质粒转染过表达PTEN,检测细胞生物学行为及相关基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Pricella | -- |
| 药物处理 | 5-氮杂-2'-脱氧胞苷 | HuicH | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Genomeditech | -- |
| 细胞活力检测 | MTT | Pricella | -- |
| 药物处理 | 顺铂 | Jinan Renyuan Chemical Co., Ltd. | 15663-27-1 |
| 细胞活力检测 | 二甲基亚砜 | Tesco Chemical | 67-68-5 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| PVDF膜 | edwardbiology | 24937-79-9 | |
| PTEN抗体 | Abcam | ab267787 | |
| PI3K抗体 | Abcam | ab302958 | |
| AKT抗体 | Abcam | ab38449 | |
| mTOR抗体 | Abcam | ab134903 | |
| 二抗(兔抗鼠IgG) | Abcam | ab6728 | |
| iBright CL1500凝胶成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | TRIZOL试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 流式细胞术 | 磷酸盐缓冲液 | Solarbio | -- |
| Annexin V-FITC | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 碘化丙啶 | Solarbio | -- | |
| ACEA NovoCyte流式细胞仪 | ACEA Biosciences | -- | |
| 细胞侵袭迁移 | 基质胶 | YUCHI Biology | -- |
| 甲基紫 | aladdin | -- | |
| 奥林巴斯显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型选择 | Jurkat细胞PTEN完全甲基化 阅读提示:Results部分,图1a |
| 药物处理 | 5-Aza-dC浓度10 μmol/L,处理24 h 阅读提示:Results部分,图1b和1c |
| 细胞生物学行为检测 | DDP浓度梯度(0, 5, 10, 20, 30, 40 μmol/L)用于MTT;细胞周期检测时需同步化;transwell中Matrigel浓度1 mg/mL 阅读提示:Methods部分,MTT assay, Flow cytometry, Transwell assay |
| 基因沉默和过表达 | 转染序列和质粒由上海Sagon构建;lipofectamine 2000转染,细胞密度1×10^5 cells/well,融合70-80% 阅读提示:Methods部分,Cell culture and grouping |