临床样本蛋白质组学分析
筛选OA患者软骨下骨中差异表达蛋白,重点关注Sik1
对30例OA患者软骨下骨样本进行label-free定量蛋白质组学分析,并与对照比较,鉴定差异表达蛋白。
Unveiling the Role of Sik1 in Osteoblast Differentiation: Implications for Osteoarthritis.
包含临床样本蛋白质组学、体外BMSCs成骨分化及Runx2干预、体内DMM模型及药物干预等多层级验证,并进行了功能与机制研究。
BMSCs(小鼠骨髓间充质干细胞) C57BL/6小鼠DMM骨关节炎模型
临床样本分组:负重区为OA组,非负重区为对照组 BMSCs成骨诱导条件:OIM含10mM β-甘油磷酸、100nM地塞米松、50μM抗坏血酸 Sik1过表达慢病毒构建及稳定转染(嘌呤霉素筛选) DMM手术及药物剂量:PA、CA、MDP腹腔注射,每周两次,持续8周 Runx2抑制剂CADD522浓度200μM处理24h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选OA患者软骨下骨中差异表达蛋白,重点关注Sik1
对30例OA患者软骨下骨样本进行label-free定量蛋白质组学分析,并与对照比较,鉴定差异表达蛋白。
验证Sik1在成骨分化过程中的表达变化
从6周龄C57BL/6小鼠提取BMSCs,用OIM诱导成骨分化,检测Sik1和成骨标志物表达及ALP活性。
评估Sik1过表达对BMSCs成骨分化的影响
通过慢病毒转染使BMSCs稳定过表达Sik1,检测成骨标志物表达和ALP活性。
验证Sik1是否通过Runx2调节成骨分化
在BMSCs中过表达Sik1的同时抑制或激活Runx2,检测成骨标志物和ALP活性。
在体内验证Sik1对OA进展的影响及Runx2的介导作用
对C57BL/6小鼠行DMM手术建立OA模型,腹腔注射PA、CA、MDP等药物,8周后通过μ-CT和组织学评估软骨和骨形态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 低糖DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 成骨分化诱导 | β-甘油磷酸 | MilliporeSigma | -- |
| 地塞米松 | MilliporeSigma | -- | |
| 抗坏血酸 | MilliporeSigma | -- | |
| 慢病毒转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000001 |
| 慢病毒包装 | psPAX2 | -- | -- |
| pMD2.G | -- | -- | |
| 慢病毒转染筛选 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| Western blot | 哺乳动物蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Nanjing KeyGen Biotech | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗Sik1抗体 | Abcam | ab217809 | |
| 抗Runx2抗体 | Abcam | ab236639 | |
| 抗OSX抗体 | Abcam | ab209484 | |
| 抗OCN抗体 | Abcam | ab133612 | |
| 抗ALP抗体 | Abcam | ab67228 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| HRP标记二抗 | Abcam | ab175733 | |
| 增强化学发光试剂盒 | ABclonal | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara Bio | -- | |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara Bio | -- | |
| iQ5实时PCR系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| ALP染色 | BCIP/NBT | Beyotime | C3206 |
| ALP活性检测 | ALP活性检测试剂盒 | Beyotime | P0321S |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 药物处理 | CADD522 | MedChemExpress | -- |
| 胞壁酰二肽 | MedChemExpress | -- | |
| Phanginin A | MedChemExpress | -- | |
| 显微CT扫描 | SkyScan 1276 | Bruker Belgium | -- |
| 显微镜 | Olympus DP74显微镜 | Olympus Corporation | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白质组学 | 样本来源、分组(负重区vs非负重区)及混合策略 阅读提示:Materials and Methods: Clinical sample collection and analysis; Tandem mass spectrometry... |
| 细胞培养与成骨诱导 | BMSCs来源、培养条件、成骨诱导培养基成分及诱导时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture |
| 慢病毒转染 | 慢病毒载体、转染方法、筛选浓度及时间 阅读提示:Materials and Methods: Lentiviral transduction |
| Western blot | 抗体稀释比例、蛋白上样量、封闭条件 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting |
| RT-qPCR | 引物序列、反应体系、循环参数 阅读提示:Materials and Methods: Extraction of RNA and RT-qPCR |
| ALP染色及活性 | 染色试剂、孵育时间、检测方法 阅读提示:Materials and Methods: ALP staining |
| CCK-8 | 药物浓度、处理时间 阅读提示:Materials and Methods: CCK-8 assay; Results: Inhibiting Runx2... |
| 动物实验(DMM模型) | 动物品系、性别、年龄、手术细节、给药方案(药物、剂量、频次、时间) 阅读提示:Materials and Methods: Construction of the DMM model and animal experiments; Figure 5 |
| μ-CT | 扫描参数、图像处理软件及骨参数评估 阅读提示:Materials and Methods: μ-computed tomography (CT) analysis |