建立CSE诱导的支气管上皮细胞损伤模型
模拟COPD相关的气道炎症和损伤,并确定合适的CSE浓度。
用不同浓度CSE(1%, 2%, 3%, 5%, 10%)处理16-HBE细胞24小时,CCK8检测细胞活力,选择2% CSE用于后续炎症和机制实验,5% CSE用于凋亡实验。
Inhibition of Nur77 expression and translocation by compound B6 reduces ER stress and alleviates cigarette smoke-induced inflammation and injury in bronchial epithelial cells.
包含体外细胞模型、分子结合实验和机制验证,但缺乏动物模型,且机制验证部分仅使用抑制剂和敲低。
16-HBE细胞 BEAS-2B细胞
CSE浓度:2%用于检测炎症和ER stress,5%用于凋亡 B6浓度梯度:1, 2, 3, 5 μM Nur77 siRNA敲低(50 nM) 4-PBA预处理2小时 处理时间:24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟COPD相关的气道炎症和损伤,并确定合适的CSE浓度。
用不同浓度CSE(1%, 2%, 3%, 5%, 10%)处理16-HBE细胞24小时,CCK8检测细胞活力,选择2% CSE用于后续炎症和机制实验,5% CSE用于凋亡实验。
确定Nur77是否介导CSE诱导的炎症和细胞损伤。
使用Nur77 siRNA敲低16-HBE细胞中Nur77表达,然后CSE刺激,检测细胞活力、炎症因子mRNA和分泌水平。
确定ER应激是否介导CSE诱导的炎症和凋亡。
使用ER应激抑制剂4-PBA预处理16-HBE细胞,然后CSE刺激,检测ER应激标志物、炎症因子和凋亡。
验证B6是否直接结合Nur77并评估结合亲和力。
通过SPR和荧光淬灭实验测定B6与Nur77-LBD的结合亲和力;通过分子对接、BPMD和MD模拟分析结合模式和稳定性。
确定B6是否能减轻CSE诱导的炎症和凋亡。
不同浓度B6(1, 2, 3, 5 μM)在CSE刺激后1小时加入16-HBE细胞,共同孵育24小时,检测炎症因子表达和分泌、细胞活力和凋亡。
确定B6是否通过抑制Nur77表达和ER转位来减轻ER应激。
Western blot检测Nur77和ER应激标志物;免疫荧光检测Nur77与ER tracker共定位。在BEAS-2B细胞中验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子对接 | 薛定谔软件套件 | Schrödinger | 2021-2 |
| 分子动力学模拟 | Desmond | Schrödinger | 2021 |
| 分子动力学模拟分析 | PyMOL | Schrödinger | Version 2.3 |
| SPR | BIAcore T200 | GE Healthcare | -- |
| CM5传感芯片 | GE Healthcare | -- | |
| CSE制备 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 96孔Costar板 | Costar | -- | |
| 酶标仪 (Spark®) | Tecan | -- | |
| 0.22 μm滤膜 | Millipore | -- | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Procell Technology | -- |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | Gibco | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Takara Biomedical Technology | -- |
| PrimeScript™ RT Master Mix | Takara Biomedical Technology | -- | |
| TB Green® Premix Ex Taq™ | Takara Biomedical Technology | -- | |
| NanoDrop One | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| SDS-PAGE | Shanghai Epizyme Biomedical Technology | -- | |
| PVDF膜 | Merck KGaA | -- | |
| 抗Nur77抗体 | CST | 3960 | |
| 抗CHOP抗体 | CST | 2895 | |
| 抗BIP抗体 | CST | 3177 | |
| 抗ATF4抗体 | Proteintech | 10835-1-AP | |
| 抗cleaved caspase3抗体 | Immunoway | YC0006 | |
| ChemiDoc化学发光凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ELISA | 人白细胞介素6 ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 人白细胞介素8 ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 免疫荧光 | 14毫米玻璃盖玻片 | NEST | -- |
| IFKine™红色驴抗兔IgG | Abbkine Scientific Co. | -- | |
| 内质网示踪剂 | Beyotime | C1042 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Solarbio | S2100 | |
| 图像显微镜 | Nikon | -- | |
| 流式细胞术 | 六孔板 | Corning | -- |
| Annexin V-FITC | 4A biotech | -- | |
| 碘化丙啶染色液 | 4A biotech | -- | |
| 流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞活力测定 | CCK8溶液 | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CSE制备 | 香烟品牌、抽吸时间、CSE浓度归一化方法 阅读提示:Methods - CSE preparation |
| 细胞培养和处理 | 细胞系、培养基成分、CSE浓度、处理时间、B6浓度和添加时间 阅读提示:Methods - Cell culture and treatment |
| 基因敲低 | siRNA序列、浓度、转染方法、转染后刺激时间 阅读提示:Results - 第一段;Methods 未详细说明 |
| ER应激抑制 | 4-PBA浓度(文中未明确说明)、预处理时间(2小时) 阅读提示:Results - 第二段;Methods 未提及4-PBA |
| 蛋白质检测 | 抗体稀释倍数、封闭条件、孵育时间和温度 阅读提示:Methods - Western blot |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC和PI的使用量、孵育时间、上机条件 阅读提示:Methods - Flow cytometry |
| 统计 | 重复次数(至少三次)、统计方法(one-way ANOVA)、显著性水平 阅读提示:Methods - Statistical analysis |