人脐带间充质干细胞通过分泌携带miR-148b-3p的细胞外囊泡靶向丙酮酸脱氢酶激酶4抑制再灌注阶段的内质网应激,从而保护肾脏免受缺血再灌注损伤

Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Protect against Renal Ischemia-Reperfusion Injury by Secreting Extracellular Vesicles Loaded with miR-148b-3p That Target Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4 to Inhibit Endoplasmic Reticulum Stress at the Reperfusion Stages.

作者信息Wei Shi, Xiang Zhou, Xinyuan Li, Xiang Peng, Guo Chen, Yang Li, Chunlin Zhang, Haitao Yu, Zhenwei Feng, Xin Gou, Jing Fan
PMID37240246
发布时间2023-05-17
DOI10.3390/ijms24108899

实验完整度

包含体外细胞实验(HK-2细胞OGD模型)、体内小鼠肾I/R模型、双荧光素酶报告基因、Western blot、流式细胞术、qRT-PCR等,并进行了EVs表征和功能验证。

主要模型

HK-2人肾小管上皮细胞系 C57BL/6小鼠肾缺血再灌注模型

重点核对

HK-2细胞缺氧/复氧(OGD)处理:缺氧溶液含antimycin A(5 mM)和2-脱氧-D-葡萄糖(5 mM),处理45分钟 HucMSC-EVs浓度:体内注射5 × 10^10颗粒/100 μL 小鼠肾I/R模型:C57BL/6雄性小鼠,8-10周龄,20-25 g;夹闭肾动脉静脉45分钟 HucMSC-EVs处理时间:再灌注阶段给药,小鼠在I/R前1小时尾静脉注射 细胞凋亡检测:Annexin V-FITC和PI染色,流式细胞术

摘要

肾缺血再灌注(I/R)损伤是急性肾损伤(AKI)的主要原因,死亡率高。最近的研究报道,人脐带间充质干细胞(HucMSCs)因其独特的特性在修复器官和组织损伤中发挥重要作用。然而,HucMSC细胞外囊泡(HucMSC-EVs)促进肾小管细胞修复的潜力仍有待探索。本研究发现,来源于HucMSCs的HucMSC-EVs发挥保护作用,并与肾I/R损伤相关。我们发现HucMSC-EVs中的miR-148b-3p对肾I/R损伤具有保护作用。过表达miR-148b-3p的HK-2细胞通过抑制凋亡免受I/R损伤。接下来,在线预测miR-148b-3p的靶mRNA,并通过双荧光素酶鉴定和验证靶mRNA丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)。我们发现I/R损伤显著增加内质网(ER)应激,而siR-PDK4抑制这些效应并保护免受I/R损伤。有趣的是,将HucMSC-EVs给予HK-2细胞后,I/R损伤诱导的PDK4表达和ER应激被显著抑制。HK-2摄取来自HucMSC-EVs的miR-148b-3p,其由I/R损伤诱导的ER应激被显著解除调控。本研究表明,HucMSC-EVs在早期I/R阶段保护肾脏免受I/R损伤。这些结果为HucMSC-EVs治疗AKI提供了一种新机制,并为I/R损伤提供了新的治疗策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
人脐带间充质干细胞来源的细胞外囊泡(HucMSC-EVs)是否通过递送miR-148b-3p靶向PDK4抑制内质网应激,从而保护肾脏免受缺血再灌注损伤?
核心机制
HucMSC-EVs通过递送miR-148b-3p至肾小管上皮细胞,直接靶向并抑制PDK4表达,进而抑制ATF-6通路介导的内质网应激,减少细胞凋亡,从而减轻肾I/R损伤。
主要证据
体外实验显示,HucMSC-EVs可被HK-2细胞摄取,miR-148b-3p在EVs中富集,过表达miR-148b-3p抑制I/R诱导的凋亡,双荧光素酶验证PDK4为直接靶点;体内实验中,尾静脉注射HucMSC-EVs降低血清肌酐和尿素氮,改善肾组织病理损伤,并降低PDK4和cleaved caspase-3表达。
研究意义
本研究首次揭示HucMSC-EVs通过miR-148b-3p/PDK4/ATF-6通路保护肾I/R损伤的机制,为AKI的临床治疗提供了潜在的治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

HucMSC-EVs的分离与鉴定

验证从HucMSC培养上清中分离的细胞外囊泡的形态、大小和标志物。

通过超速离心从HucMSC培养上清中分离EVs,使用透射电镜观察形态,NTA检测粒径分布,Western blot检测EVs标志物(CD9、TSG101)和阴性标志物(Calnexin),并通过PKH67标记验证HK-2细胞摄取。

2

HucMSC-EVs对HK-2细胞I/R损伤的保护作用

验证HucMSC-EVs能否抑制I/R诱导的HK-2细胞凋亡。

建立HK-2细胞氧糖剥夺/复氧模型,分为对照组、I/R组、I/R+HucMSCs共培养组、I/R+HucMSC-EVs组、I/R+无EVs条件培养基组;通过流式细胞术检测凋亡率,Western blot检测凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2、cleaved caspase-3。

3

miR-148b-3p的表达及功能验证

验证HucMSC-EVs中miR-148b-3p的富集及其对I/R损伤的保护作用。

通过qPCR检测HucMSC-EVs和HK-2细胞中miR-148b-3p水平,以及在I/R不同时间点的变化;在HK-2细胞中转染miR-148b-3p mimics和inhibitor,检测其对凋亡及凋亡相关蛋白的影响。

4

miR-148b-3p靶基因预测与验证

预测并验证miR-148b-3p的直接靶基因。

使用PITA、PicTar、TargetScan和miRanda预测靶基因,并筛选与凋亡相关的候选基因;通过qPCR检测mRNA水平变化,双荧光素酶报告实验验证miR-148b-3p与PDK4 3'UTR的结合。

5

验证PDK4在ER应激中的作用

验证PDK4是否通过ATF-6通路介导ER应激并加重I/R损伤。

在HK-2细胞中敲低PDK4(siR-PDK4),进行I/R处理,通过Western blot检测ER应激相关蛋白(ATF-6、GRP78/BIP、CHOP)的表达。

6

HucMSC-EVs对ER应激的影响

验证HucMSC-EVs处理是否抑制I/R诱导的ER应激。

HK-2细胞I/R后分别用无EVs条件培养基、HucMSCs共培养、HucMSC-EVs处理,通过Western blot检测ATF-6、GRP78/BIP、CHOP表达。

7

体内验证HucMSC-EVs对肾I/R损伤的保护作用

评估HucMSC-EVs在体内对肾I/R损伤的保护效果。

建立小鼠肾I/R模型,通过尾静脉注射HucMSC-EVs或PBS,检测肾功能指标(BUN、CREA)、肾组织病理(HE染色)和PDK4、cleaved caspase-3的表达(免疫组化)。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
F12培养基----
胎牛血清Millipore Sigma--
青霉素-链霉素----
2-脱氧-D-葡萄糖Sigma Aldrich--
Lipofectamine 2000Thermo Fisher Scientific--
PKH26Millipore Sigma--
PKH67Millipore Sigma--
RNA提取试剂盒Takara--
PrimeScript RT试剂盒Takara--
SYBR PrimeScript RT-PCR试剂盒Takara--
ABI 7500序列检测系统Applied Biosystems--
pmirGLO载体Promega--
RIPA裂解液Beyotime--
BCA蛋白定量试剂盒Beyotime--
PVDF膜Millipore Sigma--
抗cleaved caspase-3抗体Cell Signaling Technology9664S
抗Bcl-2抗体Cell Signaling Technology3498
抗GRP78抗体Cell Signaling Technology3177
抗IRE1-α抗体Cell Signaling Technology3294
抗XBP-1S抗体Cell Signaling Technology83418
抗CHOP抗体Cell Signaling Technology2895
抗p-PERK抗体Cell Signaling Technology3179
抗ATF6抗体Cell Signaling Technology65880
抗β-actin抗体Cell Signaling Technology3700
抗PDK4抗体ImmunoWay Biotechnology CompanyYN5701
抗TSG101抗体Proteintech Group, Inc.28283-1-AP
抗CD9抗体Proteintech Group, Inc.20597-1-AP

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
EVs分离与鉴定
超速离心步骤和条件;EVs标志物(CD9、TSG101)和阴性标志物(Calnexin)的表达;EVs平均粒径
阅读提示:Methods:4.10. Small Extracellular Vesicles Isolation; 4.11. Small Extracellular Vesicles Identification; Figure 1
细胞培养与OGD模型
HK-2细胞培养条件(F12培养基,10% FBS,37°C,5% CO2);OGD处理时间(45分钟)及试剂浓度(antimycin A 5 mM,2-脱氧-D-葡萄糖 5 mM)
阅读提示:Methods:4.2. Cell Culture Experiments
细胞转染
转染试剂(Lipofectamine 2000);转染浓度及时间;miRNA mimics/inhibitor/siRNA序列
阅读提示:Methods:4.3. Cell Transfection
双荧光素酶报告基因
载体构建(pmirGLO-PDK4-WT/MUT);293T细胞转染;检测时间(48小时)
阅读提示:Methods:4.6. Dual-Luciferase Reporter Assay
动物模型
小鼠品系、性别、年龄、体重;缺血时间(45分钟);再灌注时间(24小时);EVs剂量(5 × 10^10颗粒/100 μL)及给药时间(再灌注前1小时)
阅读提示:Methods:4.4. Animal Experiments
凋亡检测
流式细胞术的染色步骤(Annexin V-FITC和PI);Western blot检测凋亡蛋白(Bax、Bcl-2、cleaved caspase-3)
阅读提示:Methods:4.15. Flow Cytometric Analysis; 4.16. Western Blotting