HucMSC-EVs的分离与鉴定
验证从HucMSC培养上清中分离的细胞外囊泡的形态、大小和标志物。
通过超速离心从HucMSC培养上清中分离EVs,使用透射电镜观察形态,NTA检测粒径分布,Western blot检测EVs标志物(CD9、TSG101)和阴性标志物(Calnexin),并通过PKH67标记验证HK-2细胞摄取。
Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Protect against Renal Ischemia-Reperfusion Injury by Secreting Extracellular Vesicles Loaded with miR-148b-3p That Target Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4 to Inhibit Endoplasmic Reticulum Stress at the Reperfusion Stages.
包含体外细胞实验(HK-2细胞OGD模型)、体内小鼠肾I/R模型、双荧光素酶报告基因、Western blot、流式细胞术、qRT-PCR等,并进行了EVs表征和功能验证。
HK-2人肾小管上皮细胞系 C57BL/6小鼠肾缺血再灌注模型
HK-2细胞缺氧/复氧(OGD)处理:缺氧溶液含antimycin A(5 mM)和2-脱氧-D-葡萄糖(5 mM),处理45分钟 HucMSC-EVs浓度:体内注射5 × 10^10颗粒/100 μL 小鼠肾I/R模型:C57BL/6雄性小鼠,8-10周龄,20-25 g;夹闭肾动脉静脉45分钟 HucMSC-EVs处理时间:再灌注阶段给药,小鼠在I/R前1小时尾静脉注射 细胞凋亡检测:Annexin V-FITC和PI染色,流式细胞术
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证从HucMSC培养上清中分离的细胞外囊泡的形态、大小和标志物。
通过超速离心从HucMSC培养上清中分离EVs,使用透射电镜观察形态,NTA检测粒径分布,Western blot检测EVs标志物(CD9、TSG101)和阴性标志物(Calnexin),并通过PKH67标记验证HK-2细胞摄取。
验证HucMSC-EVs能否抑制I/R诱导的HK-2细胞凋亡。
建立HK-2细胞氧糖剥夺/复氧模型,分为对照组、I/R组、I/R+HucMSCs共培养组、I/R+HucMSC-EVs组、I/R+无EVs条件培养基组;通过流式细胞术检测凋亡率,Western blot检测凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2、cleaved caspase-3。
验证HucMSC-EVs中miR-148b-3p的富集及其对I/R损伤的保护作用。
通过qPCR检测HucMSC-EVs和HK-2细胞中miR-148b-3p水平,以及在I/R不同时间点的变化;在HK-2细胞中转染miR-148b-3p mimics和inhibitor,检测其对凋亡及凋亡相关蛋白的影响。
预测并验证miR-148b-3p的直接靶基因。
使用PITA、PicTar、TargetScan和miRanda预测靶基因,并筛选与凋亡相关的候选基因;通过qPCR检测mRNA水平变化,双荧光素酶报告实验验证miR-148b-3p与PDK4 3'UTR的结合。
验证PDK4是否通过ATF-6通路介导ER应激并加重I/R损伤。
在HK-2细胞中敲低PDK4(siR-PDK4),进行I/R处理,通过Western blot检测ER应激相关蛋白(ATF-6、GRP78/BIP、CHOP)的表达。
验证HucMSC-EVs处理是否抑制I/R诱导的ER应激。
HK-2细胞I/R后分别用无EVs条件培养基、HucMSCs共培养、HucMSC-EVs处理,通过Western blot检测ATF-6、GRP78/BIP、CHOP表达。
评估HucMSC-EVs在体内对肾I/R损伤的保护效果。
建立小鼠肾I/R模型,通过尾静脉注射HucMSC-EVs或PBS,检测肾功能指标(BUN、CREA)、肾组织病理(HE染色)和PDK4、cleaved caspase-3的表达(免疫组化)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Millipore Sigma | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma Aldrich | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| EVs标记 | PKH26 | Millipore Sigma | -- |
| PKH67 | Millipore Sigma | -- | |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒 | Takara | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR PrimeScript RT-PCR试剂盒 | Takara | -- | |
| ABI 7500序列检测系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pmirGLO载体 | Promega | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore Sigma | -- | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664S | |
| 抗Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 3498 | |
| 抗GRP78抗体 | Cell Signaling Technology | 3177 | |
| 抗IRE1-α抗体 | Cell Signaling Technology | 3294 | |
| 抗XBP-1S抗体 | Cell Signaling Technology | 83418 | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 2895 | |
| 抗p-PERK抗体 | Cell Signaling Technology | 3179 | |
| 抗ATF6抗体 | Cell Signaling Technology | 65880 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| 抗PDK4抗体 | ImmunoWay Biotechnology Company | YN5701 | |
| 抗TSG101抗体 | Proteintech Group, Inc. | 28283-1-AP | |
| 抗CD9抗体 | Proteintech Group, Inc. | 20597-1-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EVs分离与鉴定 | 超速离心步骤和条件;EVs标志物(CD9、TSG101)和阴性标志物(Calnexin)的表达;EVs平均粒径 阅读提示:Methods:4.10. Small Extracellular Vesicles Isolation; 4.11. Small Extracellular Vesicles Identification; Figure 1 |
| 细胞培养与OGD模型 | HK-2细胞培养条件(F12培养基,10% FBS,37°C,5% CO2);OGD处理时间(45分钟)及试剂浓度(antimycin A 5 mM,2-脱氧-D-葡萄糖 5 mM) 阅读提示:Methods:4.2. Cell Culture Experiments |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000);转染浓度及时间;miRNA mimics/inhibitor/siRNA序列 阅读提示:Methods:4.3. Cell Transfection |
| 双荧光素酶报告基因 | 载体构建(pmirGLO-PDK4-WT/MUT);293T细胞转染;检测时间(48小时) 阅读提示:Methods:4.6. Dual-Luciferase Reporter Assay |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;缺血时间(45分钟);再灌注时间(24小时);EVs剂量(5 × 10^10颗粒/100 μL)及给药时间(再灌注前1小时) 阅读提示:Methods:4.4. Animal Experiments |
| 凋亡检测 | 流式细胞术的染色步骤(Annexin V-FITC和PI);Western blot检测凋亡蛋白(Bax、Bcl-2、cleaved caspase-3) 阅读提示:Methods:4.15. Flow Cytometric Analysis; 4.16. Western Blotting |