建立肠I/R模型并观察损伤和铁死亡
确定肠I/R损伤和铁死亡的发生时间及程度。
将小鼠肠系膜动脉关闭60分钟后再灌注,在不同再灌注时间点(15、30、60分钟)检测肠黏膜损伤(HE染色、Chiu评分)、炎症因子(IL6、TNF-α、LDH)、紧密连接蛋白(ZO-1、Occludin)、铁死亡相关蛋白(GPX4、FTH1、ACSL4)及铁、MDA、GSH/GSSG水平。
Resveratrol reduces ROS-induced ferroptosis by activating SIRT3 and compensating the GSH/GPX4 pathway.
包含体内I/R模型、Sirt3基因敲除小鼠、体外Caco-2 H/R模型、SIRT3敲低和FoxO3a敲低细胞,以及Western blot、铁死亡指标检测等多层级验证。
C57BL/6小鼠肠缺血再灌注模型 Sirt3-/-小鼠肠缺血再灌注模型 Caco-2细胞缺氧复氧模型 shSIRT3-Caco-2和siFoxO3a-Caco-2细胞
缺血时间固定60分钟,再灌注时间15、30、60分钟 RSL3浓度:体外诱导铁死亡浓度为16 μM(无H/R)和8 μM(有H/R) 白藜芦醇处理:体内50 mg加入8.34 ml饮用水,每只小鼠灌胃100 μl,持续2周;体外20 μM处理24小时 Caco-2细胞培养条件:MEM培养基,20% FBS,37°C,5% CO2
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定肠I/R损伤和铁死亡的发生时间及程度。
将小鼠肠系膜动脉关闭60分钟后再灌注,在不同再灌注时间点(15、30、60分钟)检测肠黏膜损伤(HE染色、Chiu评分)、炎症因子(IL6、TNF-α、LDH)、紧密连接蛋白(ZO-1、Occludin)、铁死亡相关蛋白(GPX4、FTH1、ACSL4)及铁、MDA、GSH/GSSG水平。
验证缺氧复氧是否影响Caco-2细胞对铁死亡的敏感性。
Caco-2细胞在1% O2、5% CO2、94% N2条件下缺氧12小时,再复氧2小时,并用不同浓度RSL3处理,检测细胞活力、铁死亡相关指标(铁、MDA、GSH/GSSG、LPO)和SIRT3表达。
明确SIRT3缺失对肠I/R损伤和铁死亡的影响。
使用Sirt3-/-小鼠和shSIRT3-Caco-2细胞,检测I/R或RSL3处理后的肠黏膜损伤、铁死亡指标和细胞死亡。
检测白藜芦醇是否通过SIRT3减轻I/R损伤和铁死亡。
在Sirt3+/+和Sirt3-/-小鼠中,给予白藜芦醇(饮水)2周后建立I/R模型,检测肠黏膜损伤、紧密连接蛋白、铁死亡相关蛋白和炎症因子。
确定白藜芦醇抑制铁死亡是否依赖SIRT3激活。
在shNC-Caco-2和shSIRT3-Caco-2细胞中,用白藜芦醇(20 μM)和RSL3(16 μM)处理,检测细胞活力、铁死亡相关蛋白、铁/GSH/GSSG、SIRT3表达和LPO。
阐明白藜芦醇通过SIRT3/FoxO3a通路减少ROS的机制。
在shNC-Caco-2和siFoxO3a-Caco-2细胞中,用白藜芦醇和RSL3处理,检测ROS水平(MitoSOX)、FoxO3a、SOD2和过氧化氢酶的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 白藜芦醇 | GlpBio | GC14553 |
| 细胞实验 | RSL3 | Solarbio | IR1120 |
| 细胞培养 | MEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | 10,091,148 | |
| 嘌呤霉素 | Gibco | A1113803 | |
| 细胞功能检测 | CCK8试剂 | TargetMol | C0005 |
| LIVE/DEAD试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L3224 | |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Sigma | HATF00010 |
| 电化学发光液 | NcmBiotech | P10300 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗Occludin抗体 | Cell Signaling Technology | 91,131 | |
| 抗SIRT3抗体 | Cell Signaling Technology | 5490 | |
| 抗GPX4抗体 | Cell Signaling Technology | 59,735 | |
| 抗FTH1抗体 | Cell Signaling Technology | 4393 | |
| 抗ACSL4抗体 | Abcam | ab155282 | |
| 抗ZO-1抗体 | Cell Signaling Technology | 13,663 | |
| 抗SIRT4抗体 | Cell Signaling Technology | 69,786 | |
| 抗SIRT5抗体 | Cell Signaling Technology | 8782 | |
| 抗SOD2抗体 | Proteintech | 24127-1-AP | |
| 抗过氧化氢酶抗体 | Proteintech | 24127-1-AP | |
| 抗FoxO3a抗体 | Proteintech | 10894-1-AP | |
| 炎症因子检测 | IL6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab100712 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Abcam | ab208348 | |
| LDH ELISA试剂盒 | Abcam | ab102526 | |
| 肠通透性检测 | 异硫氰酸荧光素-右旋糖酐4 | Sigma | 60,842 |
| 肠脂肪酸结合蛋白试剂盒 | abbexa | abx153976 | |
| 铁死亡指标检测 | 铁检测试剂盒 | Abcam | ab83366 |
| 脂质过氧化检测试剂盒 | Abcam | ab118970 | |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY 581/591试剂盒 | Thermo Fisher | D3861 |
| Hoechst染料 | Thermo Fisher | 33,342 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | 15596018 |
| 逆转录 | All-In-One 5X RT预混液 | abm | 592 |
| qPCR | SYBR Green检测 | Thermo Fisher | 25741 |
| ROS检测 | MitoSOX Red试剂盒 | Thermo Fisher | M36008 |
| 线粒体染色 | MitoTracker Red试剂盒 | Invitrogen, Thermo Fisher | M7512 |
| 免疫荧光 | 二抗 | Thermo Fisher | 11,008 |
| DAPI | Thermo Fisher | 36,935 | |
| 抗SIRT3抗体 | Cell Signaling Technology | 5940 | |
| 抗SOD2抗体 | Abcam | 13,534 | |
| 显微镜观察 | HT7700透射电子显微镜 | -- | -- |
| DM IL LED荧光显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、年龄、体重、缺血时间、再灌注时间、麻醉方式、手术操作 阅读提示:详见Materials and methods中的'Animals and drug treatment'和'Model of intestinal I/R'部分 |
| 白藜芦醇给药 | 给药剂量(50 mg/8.34 ml水,每只小鼠100 μl/天)、给药时间(2周)、给药方式(灌胃) 阅读提示:详见Materials and methods中的'Animals and drug treatment'部分 |
| 体外细胞模型 | Caco-2细胞培养条件(MEM+20% FBS)、缺氧时间和复氧时间(12h/2h)、RSL3浓度(16 μM无H/R、8 μM有H/R)、白藜芦醇浓度(20 μM处理24h) 阅读提示:详见Materials and methods中的'Cell culture and an hypoxia-reoxygenation (H/R) model'和'Drug treatment and CCK8 assay'部分 |
| 基因敲除/敲低 | shSIRT3慢病毒感染和嘌呤霉素筛选浓度(3 μg/mL)、siFoxO3a质粒转染 阅读提示:详见Materials and methods中的'Construction of stable shSIRT3 and siFoxO3a cell lines'部分 |