基于TCGA和GEO数据集的胰腺腺癌和肝细胞癌糖酵解相关通路鉴定

背景：异常能量代谢是肿瘤细胞的特征之一，也是近年来的研究热点。由于消化系统结构复杂，肿瘤发生频率相对较高。我们的目的是阐明能量代谢在消化系统肿瘤中的预后意义及其潜在机制。方法：使用基因集变异分析（GSVA）R包建立代谢评分，并用该评分代表代谢水平。利用癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合（GEO）数据库探讨消化系统肿瘤代谢与预后的关系。火山图和基因本体论（GO）分析用于显示不同糖酵解水平之间的差异基因和不同功能富集，GSEA用于分析通路富集。基于基因特征和临床参数，使用R包构建列线图。采用qPCR和Western Blot分析基因表达。所有统计分析均使用SPSS、GraphPad Prism 7和R软件进行。所有验证实验均独立进行三次。结果：高糖酵解代谢评分与胰腺腺癌（PAAD）和肝细胞癌（LIHC）的不良预后显著相关。STAT3（信号转导与转录激活因子3）和YAP1（Yes1相关转录调节因子）通路分别是PAAD和LIHC中糖酵解调节最关键的信号通路。有趣的是，升高的糖酵解水平也能分别增强PAAD和LIHC细胞中STAT3和YAP1的活性，形成正反馈回路。结论：我们的结果可能为糖酵解代谢在消化系统肿瘤中的不可或缺作用提供新的见解，并为未来的代谢-信号靶点联合治疗指明方向。