建立体内脑缺血/再灌注(I/R)模型和体外OGD/R模型
模拟脑缺血再灌注损伤,确定Rab20在损伤中的表达变化。
对雄性C57BL/6J小鼠进行大脑中动脉阻塞(MCAO)1小时后再灌注;HT22细胞进行氧糖剥夺(OGD)处理不同时间(0-8小时)后复氧24小时。
Ras-related protein Rab-20 inhibition alleviates cerebral ischemia/reperfusion injury by inhibiting mitochondrial fission and dysfunction.
包含体内(小鼠MCAO模型)和体外(HT22细胞OGD/R模型)两个独立证据层级,并通过shRNA/siRNA敲低进行功能验证,通过线粒体分裂、膜电位、ROS、钙和细胞色素c释放等实验进行机制验证,实验完整度高。
小鼠脑缺血/再灌注(I/R)模型 HT22小鼠海马神经元细胞系氧糖剥夺/复氧(OGD/R)模型
小鼠:C57BL/6J雄性,6-8周龄,MCAO闭塞1小时,再灌注3天(72小时) AAV9-shRab20或shNC立体定位注射至右侧脑室(3×10^9基因组拷贝/3μl,注射4周后行MCAO) HT22细胞OGD处理时间(4小时,细胞活力48.0%)及复氧24小时 siRab20转染48小时后进行OGD/R处理 主要检测指标:TUNEL凋亡、Drp-1 Ser637磷酸化、线粒体碎片化、TMRE膜电位、MitoSOX ROS、Fluo-3AM钙、细胞色素c释放
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟脑缺血再灌注损伤,确定Rab20在损伤中的表达变化。
对雄性C57BL/6J小鼠进行大脑中动脉阻塞(MCAO)1小时后再灌注;HT22细胞进行氧糖剥夺(OGD)处理不同时间(0-8小时)后复氧24小时。
分析Rab20在脑I/R后和OGD/R后的表达水平及在脑组织中的细胞类型定位。
采用RT-qPCR和Western blot检测Rab20 mRNA和蛋白水平;通过免疫荧光双标染色观察Rab20在神经元(NeuN)、星形胶质细胞(GFAP)和小胶质细胞(IBA1)中的表达。
验证Rab20敲低对脑I/R损伤后梗死体积、神经功能和神经元凋亡的影响。
通过立体定位注射AAV9-shRab20或shNC至小鼠右侧脑室,4周后行MCAO,再灌注72小时后评估Rab20敲低效果、TTC染色测量梗死体积、神经功能评分和TUNEL染色检测神经元凋亡。
验证Rab20敲低对OGD/R诱导的HT22细胞活力、凋亡和凋亡相关蛋白表达的影响。
使用siRab20或siNC转染HT22细胞48小时,然后进行OGD/R处理,通过CCK-8检测细胞活力、TUNEL染色检测凋亡、Western blot检测Bcl-2和Bax表达。
探究Rab20敲低对OGD/R诱导的线粒体分裂和功能障碍的影响及机制。
使用MitoTracker Deep Red FM染色观察线粒体形态;Western blot检测Drp-1总蛋白、p-Drp1(Ser637)、线粒体和胞浆组分中Drp-1和细胞色素c表达;TMRE染色检测线粒体膜电位;MitoSOX Red和MitoTracker Green染色检测线粒体ROS;Fluo-3AM染色检测细胞内钙水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Lanzhou University Second Hospital | -- |
| AAV9-Syn-GFP-U6-shRab20 | Sunbio Medical Biotechnology | -- | |
| AAV9-Syn-GFP-U6-阴性对照 | Sunbio Medical Biotechnology | -- | |
| 硅胶包被8-0线栓 | -- | -- | |
| 激光多普勒血流仪(PeriFlux System 5000) | Perimed | -- | |
| 脑梗死测量 | 2,3,5-三苯基氯化四氮唑 | Coolaber | -- |
| 免疫荧光 | 抗Rab20抗体 | Proteintech Group, Inc. | 11616-1-AP |
| 抗NeuN抗体 | Proteintech Group, Inc. | 66836-1-Ig | |
| 抗IBA1抗体 | Fujifilm Wako | 011-27991 | |
| 抗GFAP抗体 | Abcam | ab279290 | |
| 驴抗兔Alexa荧光488二抗 | Abcam | ab150073 | |
| 驴抗兔Alexa荧光555二抗 | Thermo Fisher Scientific | A31572 | |
| 驴抗小鼠Alexa荧光Plus 555二抗 | Thermo Fisher Scientific | A32773 | |
| 驴抗山羊Alexa荧光Plus 555二抗 | Thermo Fisher Scientific | A32816 | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | -- | -- | |
| TUNEL染色 | TUNEL溶液 | Roche Diagnostics | -- |
| 驴抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch Inc. | 715-685-150 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 无糖DMEM | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 低氧培养箱 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| 细胞转染 | siRab20 | GenePharma | -- |
| siNC | GenePharma | -- | |
| Lipofectamine® 2000试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| SYBR Master Mixture | TAKARA | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | -- | -- | |
| 线粒体分离 | 细胞线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| 线粒体蛋白提取 | 线粒体蛋白提取试剂盒 | KeyGEN Biotech | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗Rab20抗体 | Proteintech Group, Inc. | 11616-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech Group, Inc. | 20536-1-AP | |
| 抗Bcl-2抗体 | Proteintech Group, Inc. | 26593-1-AP | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech Group, Inc. | 60267-1-Ig | |
| 抗COX-4抗体 | Proteintech Group, Inc. | 11242-1-AP | |
| 抗Drp1抗体 | Proteintech Group, Inc. | 12957-1-AP | |
| 抗p-Drp1(ser637)抗体 | Abcam | ab193216 | |
| 抗细胞色素c抗体 | Proteintech Group, Inc. | 10993-1-AP | |
| HRP偶联抗兔二抗 | -- | -- | |
| HRP偶联抗小鼠二抗 | -- | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Pierce Biotech | -- | |
| 线粒体分裂检测 | MitoTracker® Deep Red FM | Yeasen | -- |
| 线粒体膜电位检测 | 四甲基罗丹明乙酯高氯酸盐 | Beyotime | -- |
| 线粒体ROS检测 | MitoTracker® Green FM | Yeasen | -- |
| MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Yeasen | -- | |
| 细胞内钙检测 | Fluo-3AM | Beyotime | -- |
| 数据分析 | SPSS 19.0软件 | IBM Corp. | -- |
| 统计绘图 | GraphPad Prism 5软件 | GraphPad Software Inc. | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
| 显微镜 | 显微镜 | Olympus | -- |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜(LSM 750) | Zeiss | -- |
| 微孔板读数仪 | 自动微孔板读数仪(Bio-Tek M200) | Tecan | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立与Rab20敲低 | 小鼠品系、性别、年龄;MCAO阻塞时间(1小时);AAV注射立体定位坐标、滴度和预处理时间(4周);每组动物数量 阅读提示:Materials and methods: Experimental animals, Construction of middle cerebral artery occlusion and reperfusion models and treatment |
| 神经功能评估与梗死体积测量 | 神经功能评分时间点(再灌注72小时);TTC染色浓度(2%)、孵育时间和温度;梗死体积定量方法 阅读提示:Materials and methods: Neurological score, Brain infarction measurement |
| 体外OGD/R模型 | HT22细胞来源;OGD处理时间(4小时);缺氧气体条件(1% O2, 5% CO2, 94% N2);复氧时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Oxygen-glucose deprivation/reoxygenation model |
| siRNA转染 | siRab20和siNC序列;转染试剂(Lipofectamine 2000);转染时间(48小时);转染后OGD/R处理时间 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection, Table 1 |
| 线粒体功能检测 | MitoTracker Deep Red FM浓度(200nM)、孵育时间;TMRE浓度;MitoSOX Red浓度(5μM)、孵育时间;Fluo-3AM浓度(2.5μM)、孵育时间 阅读提示:Materials and methods: Mitochondrial fission assay, Mitochondrial membrane potential assay, Mitochondrial reactive oxygen species production, Intracellular calcium assay |
| 线粒体蛋白分离与Western blot | 线粒体分离试剂盒;线粒体蛋白提取试剂盒;抗体稀释比例;内参蛋白(β-actin、COX-4) 阅读提示:Materials and methods: Western blot |
| 统计学分析 | 独立重复实验次数(≥3);统计方法(t检验或单因素方差分析);显著性水平(P<0.05) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |