ABCC4表达分析
检测ABCC4在前列腺癌中的表达差异及其与患者预后和CD8+ T细胞浸润的关系
利用TCGA数据库分析多种癌症中ABCC4表达,通过IHC检测人前列腺癌组织中的ABCC4表达,并分析其与CD8+ T细胞浸润及总生存期的关联。
Tumor ABCC4-mediated release of PGE2 induces CD8+ T cell dysfunction and impairs PD-1 blockade in prostate cancer.
包含患者样本、细胞系、小鼠模型、代谢分析、流式、Western blot等多层级实验,明确功能验证(ABCC4敲除)和机制验证(PGE2-EP2/EP4-JAK1-STAT3通路)。
RM1小鼠前列腺癌细胞系 DU145人前列腺癌细胞系 C57BL/6小鼠皮下移植瘤模型 人前列腺癌组织样本
肿瘤细胞ABCC4表达水平 培养基中PGE2浓度 CD8+ T细胞凋亡和细胞毒性功能 JAK1-STAT3通路激活状态 体内CD8+ T细胞缺失对肿瘤生长的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测ABCC4在前列腺癌中的表达差异及其与患者预后和CD8+ T细胞浸润的关系
利用TCGA数据库分析多种癌症中ABCC4表达,通过IHC检测人前列腺癌组织中的ABCC4表达,并分析其与CD8+ T细胞浸润及总生存期的关联。
验证ABCC4敲除对前列腺癌细胞生长和凋亡的影响
在DU145和RM1细胞中敲除ABCC4,检测凋亡和增殖能力;将RM1细胞移植到C57BL/6和Rag1-/-小鼠中观察肿瘤生长。
评估ABCC4敲除对肿瘤浸润免疫细胞,尤其是CD8+ T细胞的影响
通过tSNE分析免疫细胞亚群,流式细胞术检测CD8+ T细胞比例、数量、干细胞性(TCF1、Ki67)和细胞毒性分子(TNF-α、IFN-γ、CD107a)的表达;通过CD8+ T细胞清除实验验证其必要性。
验证ABCC4敲除通过减少PGE2释放恢复CD8+ T细胞功能
将CD8+ T细胞与RM1细胞或其培养基上清共培养,检测凋亡和细胞毒性;测量培养基中PGE2浓度;添加外源性PGE2观察对CD8+ T细胞的抑制作用。
验证PGE2通过EP2/EP4受体抑制CD8+ T细胞功能
在CD8+ T细胞中敲低Ptger2和Ptger4,检测PGE2处理后细胞毒性功能的变化。
探究PGE2处理对CD8+ T细胞代谢和信号通路的影响
用PGE2处理CD8+ T细胞,进行KEGG通路分析、Seahorse代谢测定、透射电镜观察线粒体形态、流式检测线粒体膜电位;Western blot检测JAK1-STAT3通路蛋白;使用STAT3抑制剂和激活剂验证其作用。
评估ABCC4敲除联合PD-1阻断对前列腺癌小鼠的治疗效果
将RM1细胞(WT或ABCC4-/-)移植到C57BL/6小鼠,分组给予对照IgG或抗PD-1抗体,监测肿瘤生长和生存率,流式检测CD8+ T细胞浸润和功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| Glutamax添加剂 | -- | -- | |
| 热灭活胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞分离 | 抗APC磁珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| 抗APC CD8抗体 | Biolegend | -- | |
| Percoll密度梯度分离液 | Biosharp | -- | |
| 细胞裂解液 | Biosharp | -- | |
| 动物实验 | 抗CD8抗体(克隆2.43) | BioXcell | BE0061 |
| 大鼠IgG2b同型对照 | BioXcell | BE0090 | |
| 对照IgG(大鼠IgG2a) | BioXcell | BE0089 | |
| 抗CD279(PD1)抗体 | BEIGENE | -- | |
| 流式分析 | 胶原酶 | Sigma | -- |
| 红细胞裂解液 | Biosharp | -- | |
| Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Multi Sciences | AP105 | |
| Western blot | ABCC4抗体 | ABCLONAL | A2198 |
| β-肌动蛋白抗体 | ABCLONAL | AC004 | |
| Stat3抗体 | ABCLONAL | A16975 | |
| p-Stat3抗体 | ABCLONAL | AP0474 | |
| Jak1抗体 | ABCLONAL | A5534 | |
| p-Jak1抗体 | ABCAM | ab138005 | |
| Stat5抗体 | ZENBIO | 381427 | |
| p-Stat5抗体 | ZENBIO | 381125 | |
| Biorad成像系统 | Biorad | -- | |
| 免疫组化 | 柑橘类透明溶剂 | -- | -- |
| 柠檬酸盐缓冲液(pH 6.0) | Vector Laboratories | -- | |
| Bloxall过氧化物酶封闭液 | -- | -- | |
| Vectastain Elite ABC试剂 | Vector Laboratories | -- | |
| ImPACT DAB EqV试剂1 | -- | -- | |
| ImPACT DAB EqV试剂2 | -- | -- | |
| Cytoseal 60封片剂 | Biosharp | -- | |
| BioTek Cytation 5成像系统 | BioTek | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基组分(RPMI-1640、青霉素、链霉素、Glutamax、血清)、CD8+ T细胞分离方法和刺激条件(anti-CD3/anti-CD28,48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture |
| ABCC4敲除和过表达 | 敲除和过表达方法(文中未详细描述,需查阅补充材料) 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture;Supplementary materials |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6和Rag1-/-)、年龄(6-8周)、细胞注射数量(1.0×10^6)、注射位置(右胁)、肿瘤测量和定义(2000 mm³记为死亡) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft tumor model |
| CD8+ T细胞清除实验 | 抗CD8抗体(clone 2.43)和同型对照(rat IgG2b)的剂量(200μg)、给药频率(每三天)、起始时间(肿瘤接种前1天) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft tumor model |
| PD-1阻断治疗 | 抗PD-1抗体和对照IgG的剂量(200μg)、给药次数和时间(3-5次,间隔3天) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft tumor model |
| 共培养实验 | 共培养比例、细胞浓度(CD8+ T细胞1.0×10^6/mL)、PGE2浓度(0-100ng/ml,关键浓度10ng/ml)、共培养时间(文中未明确说明) 阅读提示:Results: ABCC4-mediated Pge2 release from tumor induces apoptosis and dysfunction of CD8+ T cells |
| PGE2浓度检测 | PGE2检测方法(ELISA试剂盒品牌和货号未在正文中提供,需查阅补充材料) 阅读提示:Materials and methods: Supplementary materials and methods |
| 流式分析 | 肿瘤消化酶(胶原酶2mg/mL,37°C 1小时)、过滤(70μm)、红细胞裂解时间(3分钟)、抗体染色条件、抗体克隆(文中未全部列出) 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry |
| 代谢分析 | Seahorse分析的具体条件、线粒体染色(MitoTracker Green和Deep Red)浓度及孵育时间(文中未明确) 阅读提示:Results: Activation of PGE2-EP2/EP4 axis induces glucose metabolism reprogramming and mitochondrial depolarization;补充材料 |
| Western blot | 蛋白提取方法、抗体浓度(未提供)、封闭和洗涤条件、成像系统(Biorad) 阅读提示:Materials and methods: Western blot |
| 免疫组化 | 抗原修复条件(125°C 30秒,90°C 10秒)、抗体浓度(未提供)、DAB显色时间(未提供) 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry |