纳米塑料表征
评估PS-NPs在实验溶液中的物理特性,确保其稳定性和分散性。
使用Zetasizer Nano ZS测量NF PS-NPs、GF PS-NPs和PE-NPs在不同溶液系统中的流体动力学尺寸、PDI和zeta电位。
Polystyrene nanoplastic exposure induces excessive mitophagy by activating AMPK/ULK1 pathway in differentiated SH-SY5Y cells and dopaminergic neurons in vivo.
包含体外细胞模型、体内小鼠模型及分子对接模拟三个独立证据层级,并进行了功能验证(细胞活力、ATP)和机制验证(AMPK/ULK1通路、线粒体自噬抑制)。
分化的SH-SY5Y细胞 C57BL/6 J小鼠
SH-SY5Y细胞分化方案:10 μM RA处理3天,随后80 nM PMA处理3天 PS-NP浓度:0, 0.5, 5, 50, 500 μg/mL,处理48小时 3-MA浓度:100 μM;CoC浓度:0.5 μM;褪黑素浓度:16 μM 小鼠分组:对照组、PS-NPs组、褪黑素组、PS-NPs+褪黑素组,每组n=10 小鼠PS-NP剂量:250 mg/kg/d,褪黑素剂量:10 mg/kg/d,持续28天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PS-NPs在实验溶液中的物理特性,确保其稳定性和分散性。
使用Zetasizer Nano ZS测量NF PS-NPs、GF PS-NPs和PE-NPs在不同溶液系统中的流体动力学尺寸、PDI和zeta电位。
确定PS-NPs对分化的SH-SY5Y细胞的毒性作用及其是否依赖ROS。
使用CCK-8试剂盒和PI染色评估细胞活力,DCFH-DA探针检测ROS水平,并用抗氧化剂NAC处理观察对细胞活力的影响。
评估PS-NPs对线粒体形态和功能的影响。
通过TEM观察线粒体形态,JC-1染色检测ΔΨm,ATP检测试剂盒测量ATP水平,Seahorse分析仪测量线粒体呼吸。
预测PS-NPs与线粒体呼吸链复合物的相互作用,并分析其结合机制。
使用MOE软件进行分子对接,GROMACS进行MD模拟,gmx_MMPBSA计算结合自由能。
验证PS-NPs是否诱导线粒体自噬,并探讨其在该过程中的作用。
通过Western blot检测LC3-II、p62、PINK1、Parkin表达,IF染色观察LC3与Mito tracker共定位,TEM观察线粒体自噬体,并使用3-MA抑制自噬评估其影响。
探究PS-NPs是否通过AMPK/ULK1通路激活线粒体自噬。
通过Western blot检测pAMPK、pULK1水平,并使用AMPK抑制剂CoC处理观察其对细胞活力和线粒体自噬的影响。
评估褪黑素对PS-NP诱导的线粒体功能障碍和过度线粒体自噬的改善作用。
在体外用褪黑素(16 μM)处理PS-NP暴露的SH-SY5Y细胞,检测细胞活力、ATP水平、线粒体自噬相关蛋白表达;在体内通过行为学测试、Nissl染色和IF染色评估褪黑素对PS-NP暴露小鼠的保护作用。
在体内验证PS-NPs的神经毒性及褪黑素的保护作用。
C57BL/6 J小鼠随机分为4组,接受PS-NPs和/或褪黑素处理,进行OFT、rotarod和grip strength测试,并通过Nissl染色、IF染色和Western blot检测SNc和纹状体的神经元丢失和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米塑料表征 | Zetasizer Nano ZS | Malvern Panalytical | -- |
| 细胞培养 | MEM/F12培养基 | Procell | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 维A酸 | MedChemExpress | -- | |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | MedChemExpress | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | MedChemExpress | -- | |
| 3-甲基腺嘌呤 | MedChemExpress | -- | |
| Compound C | MedChemExpress | -- | |
| 褪黑素 | MedChemExpress | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA | Beyotime | -- |
| ATP检测 | 增强型ATP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 细胞毒性检测 | 碘化丙啶 | Beyotime | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1 | Beyotime | -- |
| 线粒体染色 | MitoTracker深红 | Thermo Fisher | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测 | BestBio | -- |
| Spark多功能微孔板读数仪 | TECAN | -- | |
| 透射电子显微镜 | JEM1200EX | JEOL | -- |
| Leica EM UC735超薄切片机 | Leica | -- | |
| 荧光显微镜 | Nikon Eclipse C1 | Nikon | -- |
| 线粒体呼吸检测 | Seahorse XF细胞外流量分析仪 | Agilent | -- |
| XF24细胞培养微孔板 | Agilent | -- | |
| 分子模拟 | MOE软件 | -- | -- |
| GROMACS | -- | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Keygen | -- | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Keygen | -- | |
| 高速低温组织匀浆机 | Servicebio | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| ECL | Millipore | -- | |
| Tanon-5200化学发光成像系统 | Tanon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞分化与处理 | SH-SY5Y细胞分化方案、PS-NP浓度、处理时间、抗氧化剂/抑制剂浓度 阅读提示:Methods: Cell culture, Cell viability assay, ROS assay |
| 线粒体功能检测 | JC-1染色浓度、ATP检测方法、Seahorse分析条件(细胞密度、化合物浓度) 阅读提示:Methods: Mitochondrial dysfunction assessment, Mitochondrial stress test |
| 分子模拟 | 蛋白质结构PDB ID、纳米塑料模型、力场、模拟时间 阅读提示:Methods: Molecular docking, MD simulations |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、体重、分组、PS-NP和褪黑素剂量、给药方式、处理时间、行为学测试条件 阅读提示:Methods: Animal experiment design, Behavioral tests |
| 蛋白表达分析 | 抗体信息、蛋白提取方法、Western blot条件 阅读提示:Methods: Protein extraction and western blotting |