FBXO7表达分析与临床关联
验证FBXO7在ECa中的表达水平及其临床相关性。
分析TCGA和CPTAC数据库中FBXO7 mRNA和蛋白表达,进行差异表达、临床分期、预后和ROC分析;通过IHC检测25例正常和117例ECa组织样本中FBXO7蛋白表达。
FBXO7, a tumor suppressor in endometrial carcinoma, suppresses INF2-associated mitochondrial division.
体外细胞模型(HEK-293T、AN3 CA、HEC-1-A、U-2OS)结合临床样本(TCGA、CPTAC、IHC)验证,包含功能验证(增殖、迁移、凋亡)和机制验证(泛素化、线粒体分裂、DRP1磷酸化)。
子宫内膜癌细胞系AN3 CA和HEC-1-A 人胚肾细胞HEK-293T 人骨肉瘤细胞系U-2OS 人子宫内膜正常组织和癌组织样本
FBXO7在ECa中的表达下调(TCGA和CPTAC数据) ECa相关FBXO7突变体(R45Q、E61D、D72G)在UBL结构域,丧失对INF2的降解能力 INF2敲低或DNM1L敲低逆转FBXO7敲除诱导的增殖、迁移和线粒体过度分裂 DRP1抑制剂Mdivi-1(20 μM)逆转FBXO7敲除诱导的细胞表型和线粒体过度分裂 FBXO7敲除增加DRP1 Ser616磷酸化并降低Ser637磷酸化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证FBXO7在ECa中的表达水平及其临床相关性。
分析TCGA和CPTAC数据库中FBXO7 mRNA和蛋白表达,进行差异表达、临床分期、预后和ROC分析;通过IHC检测25例正常和117例ECa组织样本中FBXO7蛋白表达。
验证INF2是否与FBXO7特异性结合并确定结合结构域。
通过AP-MS、co-IP和免疫荧光实验检测FBXO7与INF2的相互作用,生成FBXO7截短突变体以定位结合域,分析亚细胞共定位。
确认INF2是FBXO7的降解底物并确定泛素化类型。
检测FBXO7对INF2蛋白水平的影响,使用蛋白酶体抑制剂和溶酶体抑制剂区分降解途径,进行体内泛素化实验和半衰期分析。
确定ECa相关突变体是否失去对INF2的降解和结合能力。
构建并表达ECa相关的FBXO7突变体(R45Q, E61D, D72G, E288D, R410W)和INF2突变体,通过co-IP、泛素化实验和半衰期分析评估功能。
检验FBXO7是否抑制ECa细胞增殖和迁移,以及是否依赖INF2-DRP1轴。
在AN3 CA和HEC-1-A细胞中敲除FBXO7并过表达FBXO7-WT或D72G,检测增殖、集落形成和迁移;通过INF2或DNM1L敲低和Mdivi-1处理评估对表型的逆转。
验证FBXO7是否通过抑制INF2-DRP1轴抑制线粒体分裂。
在U-2OS细胞中敲除FBXO7并过表达FBXO7-WT或D72G,用Mito-Tracker染色测量线粒体长度,检测DRP1 puncta和DRP1 Ser616/637磷酸化水平,并通过INF2/DNM1L敲低或Mdivi-1处理验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Meilunbio | MA0212-2 |
| MEM培养基 | Meilunbio | MA0217 | |
| McCoy's 5A培养基 | Meilunbio | MA0314 | |
| 胎牛血清 | OriCell | FBSST-01033 | |
| HEK-293T细胞系 | Haixing Biosciences | TCH-C101 | |
| AN3 CA细胞系 | Procell Life Science & Technology | CL-0505 | |
| 转染 | Lipo6000转染试剂 | Beyotime | C0526 |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液(低强度) | Meilunbio | MA0153 |
| 硝酸纤维素膜 | Cytiva | 10600001 | |
| NcmECL超敏化学发光试剂 | New Cell & Molecular Biotech | P10300 | |
| 免疫沉淀 | anti-FLAG M2琼脂糖珠 | Sigma | M8823 |
| Protein A/G免疫沉淀磁珠 | Bimake | B23201 | |
| 蛋白质纯化 | 蛋白酶抑制剂 | Bimake | B14001 |
| anti-FLAG M2琼脂糖珠 | Sigma | M8823 | |
| FLAG多肽 | Sigma | F4799 | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒 | MULTI SCIENCES | AT101 |
| 荧光显微镜 | Mito-Tracker Red线粒体染料 | Thermo Fisher | M7512 |
| 细胞增殖实验 | CCK-8试剂盒 | APExBIO | K1018 |
| 酶标仪 | Bio-Rad | -- | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Solarbio | G1063 |
| 迁移实验 | Transwell小室 | Costar | 3422 |
| 药物处理 | Mdivi-1 | 文中未明确说明 | -- |
| MG132 | 文中未明确说明 | -- | |
| 硼替佐米 | 文中未明确说明 | -- | |
| 氯喹 | 文中未明确说明 | -- | |
| 蛋白质印迹 | 抗HA抗体 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析与IHC | 样本来源、样本量、组织固定和切片条件、抗体及其稀释度、评分标准 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry; Figure 1L和图3A |
| 细胞培养 | 细胞系来源及培养条件(培养基、血清浓度、CO2浓度) 阅读提示:Methods: Cell lines and cell culture |
| 质粒构建与转染 | 质粒构建策略、转染试剂及用量、转染时间 阅读提示:Methods: Plasmid construction and transfections |
| 泛素化实验 | MG132处理时间和浓度、细胞裂解液成分、免疫沉淀抗体和磁珠、洗脱方式 阅读提示:Methods: In vivo ubiquitination assay |
| 蛋白质印迹 | 抗体来源及稀释度、上样量、转膜条件、ECL底物 阅读提示:Methods: Western blotting, 补充表3 |
| 线粒体形态分析 | U-2OS细胞培养条件、Mito-Tracker染色浓度及时间、图像采集参数、定量分析方法 阅读提示:Methods: Immunofluorescence and confocal microscopy |
| 细胞功能实验 | CCK-8检测时间点及细胞数、集落形成实验细胞数和培养时间、Transwell细胞数和迁移时间 阅读提示:Methods: Cell proliferation assay, Colony formation assay, Migration assays |