YBX3及其调控基因HEIH作为致癌系统的鉴定与验证：结肠癌中的多维分析

新基因YBX3对于调控翻译和RNA分解代谢具有重要意义，并编码一种具有高度保守冷休克结构域的蛋白质。然而，其在多种癌症（如结肠癌）中的致病作用及其调控机制仍不清楚。我们鉴定了YBX3及其调控性长链非编码RNA HEIH在多种癌症中的致病作用，并研究了它们在结肠癌肿瘤进展中的影响。采用RNA pull-down、质谱分析和93例患者的组织芯片、12例不同临床病理分期患者的qPCR以及Western blotting等方法。泛癌分析显示，YBX3表达不仅在癌症类型之间存在显著差异，而且在同一癌症的分子亚型和免疫亚型之间也存在显著差异。此外，其在结肠癌中的表达具有临床意义，HEIH与YBX3之间存在明显的负调控关联。在多种癌症中，尤其是结肠癌，YBX3比HEIH表达更与临床特征和亚组预后相关。受试者工作特征分析显示，HEIH和YBX3在多种癌症中具有相似的预测能力。结肠癌差异表达基因分析显示，它们具有相似的枢纽基因网络，表明这是一个具有高度重叠的致癌系统。结果还表明，YBX3与肿瘤免疫逃逸相关，通过不同癌症类型中T细胞排除的不同机制以及免疫细胞的肿瘤浸润。有趣的是，scRNA-seq显示HEIH抑制了这一现象。我们的结果还表明，YBX3表达与多种癌症的免疫或化疗结果相关，且在免疫检查点阻断亚队列中，YBX3在反应结果和总生存期方面表现出比七种标准化生物标志物中的两种更高的预测能力。在结肠癌细胞系中，lncRNA-HEIH与YBX3结合。质谱分析证实YBX3与HEIH被pull-down，Western blot显示敲低HEIH解除了对YBX3的抑制。这项研究强烈提示lncRNA-HEIH/YBX3是一个泛癌免疫-致癌系统，可作为诊断和预后的生物标志物以及治疗靶点，尤其是在结肠癌中。