代谢组学分析
评估SCI后能量代谢(特别是糖酵解)的变化
对SCI后7天小鼠脊髓组织进行靶向代谢组学测序,比较糖酵解相关代谢物变化,并通过KEGG和火山图分析差异代谢物。
MCT1-mediated endothelial cell lactate shuttle as a target for promoting axon regeneration after spinal cord injury.
包含体外细胞共培养、微流控轴突再生实验、代谢组学和单细胞转录组分析,以及小鼠SCI模型和AAV介导的MCT1过表达体内验证,证据层级完整。
bEnd.3小鼠脑内皮细胞系 原代小鼠皮质神经元 C57BL/6小鼠脊髓损伤模型 CATH.a小鼠神经细胞系
MCT1在ECs中的表达在SCI后降低(免疫荧光和单细胞数据) AAV-MCT1特异性过表达于脊髓ECs(TIE1p启动子) 乳酸穿梭依赖ECs与神经元的直接接触(FRET传感器和时间序列成像) MCT1抑制(α-CHCA)减少管形成、迁移和神经元乳酸摄取 AAV-MCT1促进SCI小鼠轴突再生和功能恢复(BMS、LSS、电生理、BDA示踪)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SCI后能量代谢(特别是糖酵解)的变化
对SCI后7天小鼠脊髓组织进行靶向代谢组学测序,比较糖酵解相关代谢物变化,并通过KEGG和火山图分析差异代谢物。
验证ECs是否向神经元转运乳酸
使用FRET乳酸传感器Laconic感染神经元,与bEnd.3细胞共培养,通过共聚焦成像和时间序列成像检测神经元内乳酸水平变化。
评估SCI后ECs中MCT1的表达变化
利用公共单细胞数据集(GSE162610和GSE190442)分析MCT1在ECs中的表达,并通过免疫荧光检测SCI小鼠不同时间点MCT1与CD31的共定位。
探讨MCT1对ECs血管生成和迁移的影响
通过管形成实验和细胞横向迁移实验,检测乳酸或α-CHCA处理下bEnd.3细胞的管形成能力和迁移能力,并通过Western blot检测糖酵解酶表达。
验证乳酸对神经元轴突再生的促进作用
使用微流控芯片(SND450)分离神经元胞体和轴突,进行轴突切断后培养,检测不同处理下轴突再生长度。
验证恢复ECs中MCT1表达对SCI小鼠轴突再生和功能恢复的作用
在SCI前两周通过T9脊髓注射AAV-TIE1p-MCT1或对照AAV,建立SCI模型,通过免疫荧光、BDA示踪、电生理及行为学评估轴突再生和功能恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | CORNING | 10-013-CVRV |
| 胎牛血清 | NEWZERUM | FBS-CP500 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Procell | PB180120 | |
| CATH.a细胞专用培养基 | Procell | CM-0665 | |
| 原代神经元分离 | 多聚-L-赖氨酸 | Sigma-Aldrich | P6407 |
| Hank's平衡盐溶液 | BasalMedia | B430KJ | |
| 70 μm细胞筛网 | Saining | 5021100 | |
| 细胞处理 | L-乳酸 | Sigma | L6402 |
| α-氰基-4-羟基肉桂酸 | Selleck | S8612 | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Selleck | S4701 | |
| 共培养实验 | Ibidi 2孔插入式培养皿 | Ibidi | 81176 |
| 共聚焦培养皿 | NEST | 801001 | |
| 质粒构建 | Laconic乳酸传感器 | Addgene | 44238 |
| 病毒转染 | 聚凝胺增强剂 | -- | -- |
| 动物实验 | AAV-TIE1p-MCT1 | Obio Technology | pAAV-TlE1p-mCherry-P2A-Slc16a1-3xFLAG-WPRE |
| 对照AAV | Obio Technology | H28906 | |
| 免疫荧光 | F4/80抗体 | Abcam | ab6640 |
| TUJ1抗体 | CST | 5568 | |
| 神经丝蛋白L | CST | 2837S | |
| GAP43抗体 | CST | 8945S | |
| GFAP抗体 | Invitrogen | 130300 | |
| MCT1抗体 | Proteintech | 20139-1-AP | |
| CD31抗体 | R&D | fab3628G | |
| IBA1抗体 | Wako | 011-27991 | |
| Alexa Fluor 594荧光二抗 | Abcam | -- | |
| Alexa Fluor 488荧光二抗 | Abcam | -- | |
| DAPI染色液 | Genetex | -- | |
| Western blotting | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
| 化学发光试剂 | ShareBio | SB-WB001 | |
| ChemiDoc XRS Plus化学发光成像系统 | Bio Rad | -- | |
| 轴突再生实验 | SND450微流控芯片 | Xona Microfluidics | SND450 |
| 皮质脊髓束示踪 | 生物素化葡聚糖胺 | Molecular Probes | -- |
| 数字立体定位注射器 | Stoelting Co. | 51709 | |
| 电生理 | BL-420F生物功能实验系统 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基成分,bEnd.3使用DMEM+10%FBS+1%青霉素-链霉素,CATH.a使用专用培养基;原代神经元分离需poly-L-lysine包被,种植密度1×10^5 cells/ml。 阅读提示:Methods:Cell Lines;Mouse cortical neurons preparation and culture |
| 乳酸穿梭共培养 | 共培养方式(Ibidi 2-well inserts)及乳酸添加浓度(10mM)和添加侧(bEnd.3侧),共培养时间(24小时)及移除insert后的观察时间(48小时)。 阅读提示:Methods:Cell treatment and co-culture;Figure 2C-D |
| 体外轴突再生 | 微流控芯片型号(SND450),细胞接种密度,轴突切断时间,以及乳酸或α-CHCA的处理浓度和时间。 阅读提示:Methods:The axonal regenerative assay;Figure 5D-G |
| 动物模型与AAV注射 | 小鼠品系、年龄、性别和体重(C57BL/6,8-10周,20-25g),SCI模型为T10严重挤压伤(5秒),AAV注射时间为SCI前两周,注射位点(T9,0.8mm和0.4mm深度),注射体积(0.5μl)和维持时间(5min)。 阅读提示:Methods:SCI models;Spinal injections for AAV |
| 功能评估 | BMS评分和LSS游泳测试的时间点(1、3、7、14、28 dpi)及评估人员数量(至少2名盲法观察者);电生理刺激参数(单脉冲,14V);BDA示踪的注射位点和剂量。 阅读提示:Methods:BMS score evaluation, LSS swimming test;Electrophysiology;Corticospinal tract tracing |