建立执行者caspase激活报告系统
实现对经历执行者caspase激活的细胞的标记和长期追踪
开发了哺乳动物CasExpress(mCasExpress)报告系统,包含caspase激活的DNA重组酶Flp(Lyn11-NES-DEVD-Flp)和Flp活性报告基因(FRT-STOP-FRT-ZsGreen),并置于多西环素诱导启动子控制下。通过慢病毒感染将报告系统导入HEY和A2780细胞。
Anastasis confers ovarian cancer cells increased malignancy through elevated p38 MAPK activation.
包含体外细胞模型(HEY、A2780)验证表型、体内动物模型(皮下异种移植、腹膜转移)验证功能、转录组学分析及机制验证(p38、caspase依赖性)。
HEY卵巢癌细胞系 A2780卵巢癌细胞系 NCG小鼠皮下异种移植模型 NCG小鼠腹膜转移模型
TRAIL 400 ng/μl或PTX 1 μM处理卵巢癌细胞24小时以诱导凋亡 使用mCasExpress报告系统标记并分选经历caspase激活的存活的ZsGreen+细胞 p38抑制剂SB203580处理以验证p38对表型的影响 使用siRNA敲低MAPK14验证p38α的作用 动物模型使用NCG小鼠,皮下注射1×10^6 HEY或5×10^6 A2780细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
实现对经历执行者caspase激活的细胞的标记和长期追踪
开发了哺乳动物CasExpress(mCasExpress)报告系统,包含caspase激活的DNA重组酶Flp(Lyn11-NES-DEVD-Flp)和Flp活性报告基因(FRT-STOP-FRT-ZsGreen),并置于多西环素诱导启动子控制下。通过慢病毒感染将报告系统导入HEY和A2780细胞。
确认卵巢癌细胞在TRAIL或PTX处理后能存活并经历执行者caspase激活
用TRAIL或PTX处理携带GC3AI或mCasExpress报告系统的HEY和A2780细胞24小时,然后移除药物并允许细胞恢复。通过流式细胞术和活细胞成像监测caspase激活(GC3AI+或ZsGreen+)和细胞存活。
揭示失巢凋亡细胞与未经历caspase激活的细胞之间的转录组差异
对从HEY-PTX-ZsGreen+、HEY-PTX-ZsGreen−和对照细胞中提取的RNA进行RNA测序,并进行PCA、GO和KEGG富集分析。通过RT-qPCR验证迁移和血管生成相关基因的表达。
评估失巢凋亡细胞是否获得增强的迁移和促血管生成功能
通过transwell实验检测细胞迁移能力。收集失巢凋亡细胞的条件培养基,通过ELISA检测分泌的VEGFA、VEGFC、TNF-α和PGE2水平,并通过HUVEC transwell迁移和管形成实验评估对血管内皮细胞的影响。
评估失巢凋亡细胞在体内对肿瘤生长和血管生成的影响
将分选的ZsGreen+、ZsGreen-和对照细胞皮下注射到NCG小鼠中,监测肿瘤体积、重量、Ki67和CD31染色。同时,使用条件培养基进行Matrigel植入实验,评估体内血管生成。
评估失巢凋亡细胞在体内的转移能力是否增强
将表达荧光素酶的ZsGreen+、ZsGreen−和对照细胞腹膜内注射到NCG小鼠中,通过生物发光成像监测肿瘤生长和播散,并分析腹膜结节数量、重量及器官转移情况。
验证p38激活是否为失巢凋亡及其增强的迁移和促血管生成能力所必需
通过Western blot检测不同细胞群体中p38、JNK、ERK、Akt、NFκB的磷酸化水平。使用p38抑制剂SB203580或siRNA敲低MAPK14,评估对促血管生成基因表达、HUVEC管形成、体内血管生成和细胞迁移的影响。同时,验证caspase活性对p38激活和表型的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM(高糖)培养基 | ThermoFisher Scientific | 11995-040 |
| 胎牛血清 | AusgeneX | FBS500-S | |
| 青霉素-链霉素 | Spark Jade | CM0004-100ml | |
| 内皮细胞基础培养基 | Zhongqiaoxinzhou Biotech | 1001 | |
| 胎牛血清 | Zhongqiaoxinzhou Biotech | 0025 | |
| 内皮细胞生长添加物 | ZhongqiaoXinZhou Biotech | 1052 | |
| 青霉素-链霉素 | Zhongqiaoxinzhou Biotech | 0503 | |
| 多西环素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | TRAIL(肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体) | -- | -- |
| 紫杉醇 | -- | -- | |
| Q-VD-OPh(泛caspase抑制剂) | -- | -- | |
| SB203580(p38抑制剂) | -- | -- | |
| 脱氢紫堇碱 | -- | -- | |
| 质粒构建 | pCAG-FlpO质粒 | Addgene | 89574 |
| pCW57-MCS1-P2A-MCS2-hygro质粒 | Addgene | 80922 | |
| pJFRC206-10XUAS-FRT-STOP-FRT-myr:smGFP:V5质粒 | Addgene | 63168 | |
| pLVX-shRNA2-ZsGreen载体 | Clontech | 632179 | |
| pCDH-puro-CMV-GC3AI质粒 | Addgene | 78910 | |
| In-Fusion克隆试剂盒 | TakaraBio | 639650 | |
| 病毒包装与感染 | pCMV-dR8.2 dvpr质粒 | Addgene | 8455 |
| pCMV-VSV-G质粒 | Addgene | 8454 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | 13778150 | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778030 |
| 流式细胞术与分选 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| MoFlo流式分选仪 | Beckman Coulter | -- | |
| RNA测序 | Trizol试剂 | ThermoFisher Scientific | 15596-026 |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England Biolabs | 7530 | |
| AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | -- | |
| Illumina Novaseq6000测序仪 | Illumina | -- | |
| RNA提取与qRT-PCR | RNA快速提取试剂盒 | Spark Jade | Ac1001 |
| 实时荧光定量PCR系统 | Vanzyme | Q411-03 | |
| qTOWER荧光定量PCR仪 | Analytikjena | -- | |
| Western Blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Spark Jade | EC0001 | |
| 化学发光底物 | Spark Jade | ED0016 | |
| Tanon 5200多色化学发光成像仪 | Tanon Science & Technology Co. | -- | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Falcon | 353097 |
| Opti-MEM培养基 | ThermoFisher Scientific | 31985-088 | |
| 结晶紫 | Solarbio | G1065 | |
| IX73倒置显微镜 | Olympus | -- | |
| HUVEC管形成实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | 354234 |
| IX73倒置显微镜 | Olympus | -- | |
| Image J软件 | -- | -- | |
| EdU增殖实验 | BeyoClick EdU-594试剂盒 | Beyotime | C0078S |
| BX51显微镜 | Olympus | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | Spark Jade | CT0001 |
| Molecular Devices酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| ELISA | PGE2 ELISA试剂盒 | Meimian | MM0162H2 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Meimian | MM0122H2 | |
| VEGFA ELISA试剂盒 | Meimian | MM-14698H2 | |
| VEGFC ELISA试剂盒 | Meimian | MM-0113H2 | |
| 体内Matrigel植入实验 | Drabkin试剂盒 | Sigma | 5941 |
| 动物实验 | 裸鼠 | GemPharmatech | D000521 |
| NCG小鼠 | GemPharmatech | T001475 | |
| 腹膜转移模型 | IVIS Spectrum小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 免疫组织化学 | 柠檬酸抗原修复缓冲液 | -- | -- |
| BX51显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(HEY、A2780、HUVEC)来源及培养条件,凋亡诱导剂(TRAIL 400 ng/μl、PTX 1 μM)浓度,处理时间24小时,caspase抑制剂qVD浓度50 μM,p38抑制剂SB203580浓度,DOX浓度及处理时间。 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment, 图1图例 |
| mCasExpress报告系统 | DOX浓度(1 μg/ml)和处理时间(6小时),报告系统构建详细信息(质粒、克隆方法),ZsGreen+细胞分选策略。 阅读提示:Methods: Plasmid construction, Results: mCasExpress reporter labels cells section |
| 转录组分析 | RNA-seq平台(Illumina Novaseq6000),建库试剂盒(NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit),差异表达基因筛选阈值,GO和KEGG分析工具。 阅读提示:Methods: RNA sequencing, Results: Anastasis enriches transcriptome section |
| 体外功能验证 | Transwell实验细胞数(HEY或HUVEC 2.5×10^4,A2780 5×10^4),迁移时间(HEY/HUVEC 24小时,A2780 48小时),HUVEC管形成实验细胞数(3×10^4),Matrigel体积(50 μl/孔),ELISA检测因子。 阅读提示:Methods: Transwell assay, HUVEC tube formation assay, ELISA |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(裸鼠、NCG小鼠),周龄(4周龄或5周龄),细胞注射数量(皮下:HEY 1×10^6、A2780 5×10^6;腹腔:HEY 5×10^6、A2780 1×10^7),肿瘤体积测量频率,终点时间,样本量。 阅读提示:Methods: Animals, Subcutaneous xenograft tumor model, Peritoneal metastasis model, figure legends of Figs. 4, 5 |
| p38机制验证 | p38抑制剂SB203580浓度,siRNA序列及转染剂量,Western blot检测的磷酸化蛋白(p38、JNK、ERK、Akt、NFκB),qVD处理时间点,恢复期抑制剂维持。 阅读提示:Methods: siRNA transfection, Western Blot, Results: p38 is activated by caspases and p38 activation sections, figure legends of Figs. 6 and 7 |