低葡萄糖代谢物3-磷酸甘油酸将PHGDH从丝氨酸合成转换为p53激活以控制细胞命运

Low glucose metabolite 3-phosphoglycerate switches PHGDH from serine synthesis to p53 activation to control cell fate.

作者信息Yu-Qing Wu, Chen-Song Zhang, Jinye Xiong, Dong-Qi Cai, Chen-Zhe Wang, Yu Wang, Yan-Hui Liu, Yu Wang, Yiming Li, Jian Wu, Jianfeng Wu, Bin Lan, Xuefeng Wang, Siwei Chen, Xianglei Cao, Xiaoyan Wei, Hui-Hui Hu, Huiling Guo, Yaxin Yu, Abdul Ghafoor, Changchuan Xie, Yaying Wu, Zheni Xu, Cixiong Zhang, Mingxia Zhu, Xi Huang, Xiufeng Sun, Shu-Yong Lin, Hai-Long Piao, Jianyin Zhou, Sheng-Cai Lin
PMID37726403
期刊Cell Res
发布时间2023-11
DOI10.1038/s41422-023-00874-4

实验完整度

高

包含体外细胞实验、突变体功能验证、小鼠HCC模型(DEN/CCl4及MYC;Trp53−/−)及体内AAV介导的PHGDH突变体表达研究,并进行了机制和功能验证。

主要模型

HEK293细胞 SK-Hep-1细胞 人原代HCC细胞 DEN/CCl4诱导的小鼠HCC模型

重点核对

葡萄糖浓度:文中未明确说明,但低葡萄糖(低于6mM)诱导p-Ser46,糖饥饿时间2小时 PHGDH突变体T57A和T78A(3-PGA结合缺陷)在无糖条件下诱导p-Ser46和凋亡 PHGDH突变体R135W和V261M(组成性结合3-PGA)在低糖条件下阻断p-Ser46和凋亡 小鼠HCC模型:DEN/CCl4模型(80mg/mL DEN腹腔注射2次,第8周起每周5ml/kg的10% CCl4),AAV尾静脉注射PHGDH突变体 CR处理:从12周龄开始,每日每只给予2.5g标准饮食(70%自由采食量)

摘要

糖酵解中间代谢物如1,6-二磷酸果糖可作为信号,控制能量代谢之外的代谢状态。然而,糖酵解代谢物是否也在控制细胞命运中发挥作用仍未被探索。在这里,我们发现低水平的糖酵解代谢物3-磷酸甘油酸(3-PGA)可以将磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)从分解代谢的丝氨酸合成转换为促凋亡的p53激活。PHGDH是一种p53结合蛋白,当未被3-PGA占据时,与支架蛋白AXIN及其复合物中的激酶HIPK2相互作用,两者也都是p53结合蛋白。这导致形成多价p53结合复合物,使HIPK2能够特异性磷酸化p53-Ser46,从而促进凋亡。此外,我们表明,组成性结合3-PGA的PHGDH突变体(R135W和V261M)即使在低葡萄糖条件下也能消除p53激活,而无法结合3-PGA的突变体(T57A和T78A)即使在存在高葡萄糖的情况下也能在肝细胞癌(HCC)细胞中引起组成性p53激活和凋亡。在体内,PHGDH-T57A诱导凋亡并抑制二乙基亚硝胺诱导的小鼠HCC的生长,而PHGDH-R135W阻止凋亡并促进HCC生长,敲除Trp53可消除上述效应。重要的是,降低全身葡萄糖水平的卡路里限制可以依赖PHGDH阻止HCC生长。总之,这些结果揭示了葡萄糖可用性自主控制p53活性的机制,为代谢底物可用性控制细胞命运提供了新范式。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
低葡萄糖代谢物3-PGA如何调控p53的促凋亡活性并影响细胞命运?
核心机制
低浓度3-PGA下,PHGDH未被3-PGA占据,与AXIN、HIPK2和TIP60形成复合物,使HIPK2磷酸化p53-Ser46,从而诱导凋亡。
主要证据
通过免疫共沉淀和突变体实验证明PHGDH与p53、AXIN相互作用;PHGDH-T57A/T78A(3-PGA结合缺陷)在细胞和体内诱导凋亡并抑制HCC,PHGDH-R135W/V261M(组成性结合3-PGA)抑制凋亡;敲除Trp53消除这些效应。
研究意义
该发现揭示葡萄糖代谢物通过非催化功能控制p53和细胞命运的新机制,为理解营养信号与肿瘤抑制提供了新视角。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

检测低葡萄糖和3-PGA对p53磷酸化的影响

确定低葡萄糖代谢物3-PGA是否调节p53-Ser46磷酸化

通过不同浓度葡萄糖处理HEK293细胞,敲低或抑制己糖激酶、GAPDH、PGK等糖酵解酶,以及补充2-DG和3-PGA,检测p-Ser46水平。

2

筛选3-PGA的传感器PHGDH

鉴定感知3-PGA水平并传递信号至p53的传感器蛋白

通过质谱分析p53互作蛋白,发现PHGDH并验证其与p53结合受3-PGA调节;敲除PHGDH验证其必要性;构建PHGDH突变体(T57A、T78A、R135W、V261M)研究其对p53活性的影响。

3

验证PHGDH与AXIN复合物的形成

研究PHGDH如何与AXIN形成复合物并调控p53-Ser46磷酸化

通过免疫共沉淀检测PHGDH与AXIN的相互作用及复合物形成;使用AXIN截短突变体和PHGDH突变体分析关键结构域。

4

检测PHGDH诱导的凋亡

确定PHGDH介导的低葡萄糖诱导的凋亡是caspase依赖的经典凋亡

在SK-Hep-1细胞中诱导表达PHGDH突变体,检测凋亡标志物和细胞死亡,使用抑制剂区分凋亡、坏死性凋亡、铁死亡和焦亡。

5

评估体内PHGDH突变体对HCC的影响

验证PHGDH通过p53调控HCC生长

通过AAV在DEN/CCl4诱导的HCC小鼠中表达PHGDH突变体,检测p-Ser58、凋亡和肿瘤生长;在MYC;Trp53−/−模型中验证p53依赖性;并在CR条件下观察效应。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
验证细胞功能变化
验证分子表达变化
验证机制链路
评估体内效果

产品清单

实验环节名称品牌货号
兔抗磷酸化p53-Ser46抗体Cell Signaling Technology2521
兔抗AXIN抗体Cell Signaling Technology2074
兔抗PHGDH抗体SigmaHPA021241
3-磷酸甘油酸SigmaP8877
2-脱氧葡萄糖SigmaD8375
氯尼达明SigmaL4900

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养与糖饥饿
细胞系、培养条件、糖饥饿时间和培养基成分
阅读提示:Materials and methods, Cell culture, 葡萄糖饥饿处理
PHGDH突变体实验
PHGDH突变体(T57A、T78A、R135W、V261M)的表达系统和处理条件
阅读提示:Results图2和图4,以及Materials and methods
小鼠HCC模型
DEN/CCl4剂量、注射时间、AAV注射时间和剂量
阅读提示:Materials and methods, Mouse HCC induction