临床样本收集与细胞外囊泡表征
分离并验证卵泡液来源的细胞外囊泡,确保后续分析的可靠性。
收集6例PCOS患者和6例对照的卵泡液,通过超速离心提取细胞外囊泡,并使用TEM、NTA和Western blot检测其形态、粒径和标志物。
Follicular fluid-derived extracellular vesicles miR-34a-5p regulates granulosa cell glycolysis in polycystic ovary syndrome by targeting LDHA.
包含临床样本细胞外囊泡表征与测序、体外细胞模型功能验证及靶向验证,但缺乏动物模型或体内验证。
KGN人卵巢颗粒肿瘤细胞系 PCOS患者卵泡液来源细胞外囊泡 健康对照卵泡液来源细胞外囊泡
临床样本:PCOS组与对照组各6例,来源于接受IVF-ET的患者 细胞模型:KGN细胞,400 nM睾酮处理模拟PCOS环境 转染:50 nM miR-34a-5p mimic或100 nM inhibitor 靶向验证:双荧光素酶报告基因,野生型与突变型LDHA 3'UTR 糖酵解检测:乳酸和丙酮酸含量测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分离并验证卵泡液来源的细胞外囊泡,确保后续分析的可靠性。
收集6例PCOS患者和6例对照的卵泡液,通过超速离心提取细胞外囊泡,并使用TEM、NTA和Western blot检测其形态、粒径和标志物。
鉴定PCOS与对照组间差异表达的miRNA,并预测其功能。
对细胞外囊泡进行miRNA测序,鉴定差异表达miRNA,并进行GO和KEGG富集分析;用qPCR验证关键miRNA。
验证miR-34a-5p是否直接靶向LDHA。
使用miRDB和TargetScan预测靶点,构建LDHA 3'UTR野生型和突变型荧光素酶报告载体,共转染至KGN细胞,检测荧光素酶活性。
评估miR-34a-5p对颗粒细胞糖酵解、增殖和凋亡的影响。
用睾酮处理KGN细胞建立PCOS模型,转染miR-34a-5p mimic或抑制剂,检测糖酵解酶表达、乳酸/丙酮酸水平、细胞增殖和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞外囊泡提取 | exoEasy Maxi试剂盒 | Qiagen | -- |
| 细胞外囊泡表征 | CD63抗体 | ZenBio | R23327 |
| CD9抗体 | Abcam | ab92726 | |
| Western blotting | β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 |
| HK2抗体 | ABclonal | A0994 | |
| PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 4053 | |
| LDHA抗体 | Cell Signaling Technology | 3558 | |
| BAX抗体 | Abmart | RT40051 | |
| BCL-2抗体 | Invitrogen | 13-8800 | |
| Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5568 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)二抗 | Protein Tech Group Inc. | SA00001-2 | |
| eECL化学发光底物 | CWBIO | CW0049M | |
| miRNA测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| NEBNext Poly(A) mRNA磁力分离模块 | New England Biolabs | -- | |
| RiboZero磁力金试剂盒(人/小鼠/大鼠) | Epicentre | -- | |
| NEBNext多重小RNA样本制备套装(Illumina) | NEB | E7580 | |
| 安捷伦2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| Illumina NextSeq 500测序仪 | Illumina | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 睾酮 | AbMole BioScience | M6105 | |
| 细胞转染 | riboFECT CP转染试剂盒 | RiboBio | C10511-05 |
| qPCR | miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | MR101-02 |
| miRNA通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | MQ101-02 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | BS350A |
| 流式细胞术 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences Pharmingen | -- |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 代谢物检测 | 乳酸检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A019-2-1 |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | PCOS诊断标准(Rotterdam 2003);排除标准(年龄>35岁等);样本量(每组6例);卵泡液采集时间(hCG注射后36小时) 阅读提示:Materials and methods: Clinical sample collection of FF |
| 细胞外囊泡提取与表征 | 超速离心方法(QiaGen试剂盒);标志物检测(CD63、CD9);粒径范围(100-150 nm) 阅读提示:Materials and methods: Isolation and characterization of FF-derived extracellular vesicles; Figure 1 |
| miRNA测序与分析 | RNA提取方法;差异表达筛选阈值(log2|FC|≥1,p<0.05);qPCR验证的miRNA数量 阅读提示:Materials and methods: Extracellular vesicle miRNA sequencing (miRNA-seq) analysis; Figure 2 |
| 细胞培养与处理 | KGN细胞来源;培养基成分(DMEM/F12, 10%FBS, 400 nM睾酮);转染试剂和浓度(riboFECT, 50 nM mimic, 100 nM inhibitor) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and miRNA mimic/inhibitor transfection; Figure 4 |
| 靶向验证 | 双荧光素酶报告基因载体构建(WT和MUT);共转染浓度(mimic 50 nM, psiCHECK2载体15 mg/L);检测时间(36小时) 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter assay; Figure 3 |
| 代谢物检测 | 乳酸和丙酮酸检测试剂盒型号;检测时间(转染后36小时);波长(乳酸530 nm,丙酮酸505 nm) 阅读提示:Materials and methods: Determination of lactic acid and pyruvic acid content |
| 增殖和凋亡检测 | CCK-8细胞接种密度(5000细胞/孔);孵育时间(24小时);流式检测凋亡(Annexin V) 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation assay, Flow cytometry; Figure 5 |