东亚型幽门螺杆菌CagA对细胞内信号转导更强的失调作用

More powerful dysregulation of Helicobacter pylori East Asian-type CagA on intracellular signalings.

作者信息Xiaofei Ji, Zekun Sun, Hao Wu, Jianhui Zhang, Shuzhen Liu, Xinying Cao, Bin Wang, Feifan Wang, Ying Zhang, Boqing Li, Jiankai Feng, Huilin Zhao
PMID39528935
发布时间2024-11-11
DOI10.1186/s12866-024-03619-4

实验完整度

包含体外细胞感染模型(GES-1)、小鼠胃类器官感染模型、转录组测序及表型验证(IL-8、活力、迁移侵袭)、机制验证(HIF-1α抑制)等两个以上独立证据层级和功能验证。

主要模型

人胃上皮细胞系GES-1 小鼠胃类器官 幽门螺杆菌G27突变菌株(G27CagAE、G27CagAW、G27ΔCagA)

重点核对

感染时间:4小时 感染复数(MOI):100:1 CagA表达和转入水平的一致性(Western blot验证) HIF-1α抑制剂LW6处理(浓度未明确) 转录组测序样本量:每组4-5个独立样本

摘要

背景:表达细胞毒素相关基因A(CagA)的幽门螺杆菌菌株的慢性感染是胃癌最强的危险因素。CagA可分为东亚型和西方型(CagAE和CagAW),其中CagAE与胃癌关系更密切。本研究旨在探讨CagAE对细胞内信号通路的影响,以解释其高致癌性。结果:通过将CagAE/W表达质粒转化至CagA缺失的G27菌株(G27ΔCagA),构建了表达CagAE或CagAW的突变幽门螺杆菌菌株。在人胃上皮细胞(GES-1)感染中,与CagAW相比,CagAE诱导更严重的细胞病变改变,包括更高的白细胞介素-8(IL-8)分泌、细胞活力降低、更明显的“蜂鸟表型”改变以及细胞迁移和侵袭增加。转录组分析显示,CagAE对关键细胞内过程的上调作用更强,包括通过核因子κB(NF-κB)的肿瘤坏死因子-α(TNF-α)信号通路、炎症反应、干扰素-γ(IFN-γ)反应、缺氧、紫外线(UV)反应和Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)信号通路。缺氧相关基因的显著上调是CagAE的一个显著特征。感染CagAE的GES-1细胞表现出比感染CagAW的细胞更严重的细胞内缺氧和更高水平的活性氧(ROS)。抑制缺氧诱导因子-1α(HIF-1α),阻断缺氧信号,减轻了CagAE诱导的细胞迁移,强调了缺氧在介导CagAE效应中的作用。结论:该研究提供了幽门螺杆菌感染期间CagA相关细胞内调控的转录组证据,证明CagAE对细胞内信号传导的作用强于CagAW。这些发现有助于理解CagAE在幽门螺杆菌诱导的胃癌中增强的致癌潜力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
东亚型CagA(CagAE)是否比西方型CagA(CagAW)对胃上皮细胞内的信号通路有更强的调控作用,从而解释其更高的致癌性?
核心机制
CagAE通过上调缺氧信号通路(涉及HIF-1α)以及炎症和免疫相关通路(如TNF-α信号通过NF-κB、炎症反应、IFN-γ反应)来增强其致病性。
主要证据
转录组分析显示CagAE组与CagAW组相比,缺氧通路是唯一显著上调的基因集;在GES-1细胞和胃类器官中qRT-PCR验证了缺氧相关基因(IGFBP3、STC1、EFNA3、EFNA1)以及炎症标志物(INHBA、TNFRSF9、IL-6、SOD2、CXCL8、TRAF1)的表达;HIF-1α抑制剂LW6减少了CagAE诱导的细胞迁移。
研究意义
研究提供了CagAE对细胞内信号通路具有更强调控作用的转录组证据,为理解CagAE在H. pylori相关胃癌中更高的致癌潜力提供了见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

构建CagA突变菌株

获得遗传背景相同、仅CagA亚型不同的H. pylori菌株,用于比较CagAE和CagAW的致病差异。

以H. pylori G27为起始菌株,通过同源重组敲除内源cagA基因(G27ΔCagA),再将CagAE或CagAW表达质粒pCHFHP-CagA转化至G27ΔCagA,获得G27CagAE和G27CagAW菌株。通过Western blot验证了细菌和感染细胞中CagA的表达水平无显著差异。

2

体外感染GES-1细胞后的表型检测

评估不同CagA亚型对胃上皮细胞的细胞毒性、炎症反应、形态改变和迁移侵袭能力的影响。

将G27ΔCagA、G27CagAW、G27CagAE以MOI=100:1感染GES-1细胞4小时,检测细胞活力(CCK-8)、IL-8分泌(ELISA)、“蜂鸟表型”比例、迁移和侵袭(Transwell)。

3

转录组测序和GSEA分析

比较感染不同CagA亚型菌株后GES-1细胞的基因表达谱,揭示差异调控的信号通路。

感染4小时后提取RNA进行RNA-seq(NovaSeq 6000平台),通过DESeq2和GSEA分析hallmark基因集的富集。

4

qRT-PCR和类器官验证

验证转录组中差异表达基因在体外和更接近体内的模型中的表达变化。

从测序结果中选取关键基因,在感染GES-1细胞和小鼠胃类器官中通过qRT-PCR验证表达。

5

缺氧和ROS检测及HIF-1α抑制实验

验证CagAE是否诱导更严重的细胞内缺氧和ROS,并检测缺氧信号在CagAE诱导的细胞迁移中的作用。

使用ROS-ID缺氧/氧化应激检测试剂盒检测感染GES-1细胞的缺氧和ROS水平;用HIF-1α抑制剂LW6处理感染细胞,检测细胞迁移变化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
GES-1细胞系Beyotime BiotechnologyC6268
DMEM培养基MacgeneCM10017
胎牛血清GibcoFSS500
磷酸盐缓冲液MeilunbioMA0015
D-PBS缓冲液ProcellPB180329
Advanced DMEM/F12培养基Gibco12634010
基质胶R&D system3533-005-02
Wnt3A蛋白Peprotech315-20
Noggin蛋白R&D system1967-NG
R-Spondin-1蛋白Peprotech315-32
Glutamax-I添加剂Gibco35050061
青霉素/链霉素Gibco15070063
FGF-10蛋白R&D system6224-FG
EGF蛋白R&D system2028-EG
B27添加剂Gibco17504044
胃泌素-1Tocris Bioscience3006
N-乙酰半胱氨酸Tocris Bioscience5619
Y-27632Tocris Bioscience1254
CCK-8试剂盒Meilun Biotechnology Co., Ltd--
SpectraMax Plus384酶标仪Molecular Devices--
Transwell小室Corning--
基质胶Abwbio--
人IL-8 ELISA试剂盒Elabscience Biotechnology Co., Ltd--
ROS-ID缺氧/氧化应激检测试剂盒Enzo Life Sciences--
Zeiss LSM880 Airyscan共聚焦显微镜Zeiss--
Trizol试剂Invitrogen--
DNA-free DNase IAmbion--
Qsep 100Bioptic--
RNA 1000 Nano LabChip试剂盒Agilent--
VAHTS Universal V8 RNA-seq建库试剂盒Vazyme Biotech Co., Ltd--
NovaSeq 6000测序平台Novogene--
ABI Prism 7500检测系统Applied Biosystems--
2×SYBR Green qPCR MixSparkjade--
RIPA裂解液Solarbio--
BCA蛋白定量试剂盒Beyotime--
抗CagA抗体Santa Cruz Biotechnology--
抗GAPDH抗体Proteintech--
抗鼠IgG-HRP二抗Proteintech--
Tanon 5200 Multi化学发光成像系统Tanon--
LW6----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细菌菌株构建
同源重组敲除cagA基因的验证,CagA表达和转入水平的均一性
阅读提示:Materials and methods: Bacterial strains, plasmids and primers, Construction of CagA mutants; Figure 1D-E
细胞感染实验
GES-1细胞培养条件、MOI 100:1、感染时间4小时
阅读提示:Materials and methods: Cell culture and infection; Figure legends
表型检测
CCK-8检测的细胞密度和孵育时间,IL-8 ELISA的样本处理,Transwell实验的细胞密度和培养时间
阅读提示:Materials and methods: Cell vitality assay, Transwell assay, Measurement of IL-8 secretion
转录组测序
RNA质量要求(RQN>7),建库试剂盒,测序平台和样本分组
阅读提示:Materials and methods: RNA extraction and sequence analysis
缺氧和ROS检测
ROS-ID检测试剂盒的使用,荧光信号采集条件(激发420nm,发射600-700nm)
阅读提示:Materials and methods: Hypoxia analysis and intracellular ROS detection
机制验证
HIF-1α抑制剂LW6的浓度和处理时间(文中未明确),细胞迁移检测的条件
阅读提示:Materials and methods: Transwell assay; Results: CagAE caused more severe hypoxia enhancing the migration