CAFs对巨噬细胞极化的影响
验证CAFs是否通过分泌EVs影响巨噬细胞极化。
THP-1细胞经PMA诱导分化为M0巨噬细胞,与CAFs共培养,并加入GW4869抑制EV生成,通过流式细胞术和qPCR检测M1和M2标志物。
Extracellular vesicle-packaged miR-4253 secreted by cancer-associated fibroblasts facilitates cell proliferation in gastric cancer by inducing macrophage M2 polarization.
包含细胞共培养、EV分离鉴定、qPCR、流式细胞术、双荧光素酶报告基因、RNA pull-down及细胞增殖实验,但缺乏体内动物模型验证。
THP-1人单核细胞系来源的巨噬细胞 CAFs(胃癌相关成纤维细胞) AGS人胃癌细胞系
CAFs与THP-1来源的巨噬细胞共培养,加入GW4869抑制EV生成 miR-4253 inhibitor或mimic转染CAFs或THP-1细胞 THP-1细胞用PMA诱导分化,再经LPS/IFN-γ或IL-4/IL-13诱导M1或M2极化 sh-IL6R转染THP-1细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CAFs是否通过分泌EVs影响巨噬细胞极化。
THP-1细胞经PMA诱导分化为M0巨噬细胞,与CAFs共培养,并加入GW4869抑制EV生成,通过流式细胞术和qPCR检测M1和M2标志物。
确认从CAFs培养上清中分离到EVs,并被巨噬细胞摄取。
采用超速离心法从CAFs培养上清中分离EVs,通过透射电镜观察形态、NTA检测粒径、免疫印迹检测标志物;用PKH67标记EVs并与巨噬细胞共孵育,观察摄取情况。
探讨EVs是否通过携带miRNA并依赖Dicer调节巨噬细胞极化。
在THP-1细胞中敲低Dicer,收集CAFs的EVs并处理巨噬细胞,检测极化标志物。
筛选在CAF-EVs中高表达并可能参与调控的miRNA。
利用GSE224056数据集进行微阵列分析预测差异表达miRNAs,并通过qPCR验证候选miRNA在CAF-EVs中的表达,选取高表达的miR-4253进行后续研究。
验证EV包裹的miR-4253是否调控巨噬细胞极化。
用miR-4253 inhibitor转染CAFs,收集EVs处理巨噬细胞,检测极化标志物。
验证IL6R是否为miR-4253的直接靶基因。
通过双荧光素酶报告基因实验和RNA pull-down分析验证miR-4253与IL6R的结合关系,并通过qPCR检测miR-4253 inhibitor对IL6R表达的影响。
验证IL6R介导miR-4253对巨噬细胞极化的调控。
在THP-1细胞中敲低IL6R,并联合miR-4253 inhibitor,检测极化标志物。
评估EV包裹的miR-4253通过巨噬细胞极化对胃癌细胞增殖的影响。
将转染miR-4253 inhibitor的CAFs来源EVs处理的巨噬细胞与AGS细胞共培养,通过CCK-8、EdU和集落形成实验检测细胞增殖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| β-巯基乙醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Procell | -- | |
| 细胞处理 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 干扰素-γ | Sigma-Aldrich | -- | |
| 白细胞介素-4 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 白细胞介素-13 | Sigma-Aldrich | -- | |
| EV抑制 | GW4869 | MedChemExpress | -- |
| 免疫荧光 | 抗αSMA抗体 | -- | -- |
| 抗FAP抗体 | -- | -- | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | BestBio | -- | |
| EV标记 | PKH67荧光染料 | BestBio | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-PCR | MightyScript第一链cDNA合成预混液 | Sangon | -- |
| qPCR | SGExcel FastSYBR预混液 | Sangon | -- |
| miDETECT A Track miRNA qRT-PCR起始试剂盒 | RiboBio | -- | |
| 流式细胞术 | FITC标记的抗人CD68抗体 | BioLegend | -- |
| PE标记的抗人CD86抗体 | BioLegend | -- | |
| APC标记的抗人CD206抗体 | BioLegend | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pmiR-GLO载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| RNA pull-down | M-280链霉亲和素磁珠 | Invitrogen | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| EdU实验 | Cell-LightTM EdU Apollo体外试剂盒 | RibiBio | -- |
| 流式细胞术 | BD Fc阻断剂 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAFs与巨噬细胞共培养 | CAFs来源、培养条件、共培养时间、GW4869浓度 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| EV分离 | 超速离心转速和时间、EV鉴定标志物 阅读提示:Methods: EV isolation |
| 巨噬细胞极化诱导 | PMA浓度和诱导时间、M1诱导因子(LPS/IFN-γ)浓度、M2诱导因子(IL-4/IL-13)浓度 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| miR-4253调控实验 | miR-4253 inhibitor/mimic浓度、转染时间、EV处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| 胃癌细胞增殖检测 | AGS细胞与EV处理的巨噬细胞共培养条件、CCK-8检测时间、EdU标记时间、集落形成时间 阅读提示:Methods: Cell counting kit-8, EdU assay, Colony formation assay |