DNAJB4表达验证
验证DNAJB4在乳腺癌组织和细胞系中的表达水平及其与预后的关系
通过数据库分析(TIMER2.0、UALCAN、Kaplan-Meier)和免疫组化、qRT-PCR、Western blot检测乳腺癌组织及正常组织、乳腺癌细胞系和正常乳腺细胞系中DNAJB4表达。
DNAJB4 suppresses breast cancer progression and promotes tumor immunity by regulating the Hippo signaling pathway.
包括体外细胞功能实验(CCK-8、集落形成、划痕)、机制验证(Western blot、双荧光素酶)、体内异种移植瘤模型及免疫组化分析,多层级验证。
MCF-7人乳腺癌细胞系 BT-549人乳腺癌细胞系 SKBR3人乳腺癌细胞系 MDA-MB-231人乳腺癌细胞系 MCF-10A正常乳腺上皮细胞系 HEK293T细胞系 4T1小鼠乳腺癌细胞异种移植瘤模型 BALB/c小鼠 乳腺癌患者组织样本
DNAJB4过表达慢病毒转染MCF-7细胞(MOI=40) miR-183-5p mimics浓度(100 nM)处理 LATS-IN-1剂量(10 mg/kg)及给药方式(瘤周注射,每日一次,持续7天) 异种移植瘤模型:4T1细胞接种量(1×10^5)及小鼠周龄(5~6周) 体内分组:每组8只小鼠,每组(Lenti-vector, Lenti-DNAJB4, Lenti-DNAJB4+Lats-IN-1, Lenti-vector+Lats-IN-1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DNAJB4在乳腺癌组织和细胞系中的表达水平及其与预后的关系
通过数据库分析(TIMER2.0、UALCAN、Kaplan-Meier)和免疫组化、qRT-PCR、Western blot检测乳腺癌组织及正常组织、乳腺癌细胞系和正常乳腺细胞系中DNAJB4表达。
评估DNAJB4过表达对MCF-7细胞体外增殖和迁移能力的影响
使用慢病毒在MCF-7细胞中过表达DNAJB4,并通过CCK-8、集落形成、划痕实验检测增殖和迁移能力,Western blot检测EMT标志物(E-cadherin、N-cadherin、vimentin)。
验证DNAJB4过表达是否通过激活Hippo信号通路发挥作用
Western blot检测DNAJB4过表达后p-LATS1/LATS1、p-YAP/YAP比值;使用LATS-IN-1抑制Hippo通路后,检测EMT标志物和细胞增殖、迁移变化。
验证miR-183-5p是否直接靶向DNAJB4并调控其表达
使用starBase数据库预测miRNA,qRT-PCR检测候选miRNA表达;通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-183-5p与DNAJB4 3'UTR结合;在MCF-7细胞中共转染miR-183-5p mimics和DNAJB4过表达质粒,检测DNAJB4表达及Hippo通路和EMT标志物。
评估DNAJB4过表达在体内对肿瘤生长的影响及对肿瘤免疫微环境的作用
建立4T1细胞皮下异种移植瘤模型,分为四组,肿瘤直径达0.5cm时给予LATS-IN-1处理,7天后处死小鼠,测量肿瘤大小和重量,并通过Western blot和免疫组化检测相关蛋白表达(p-LATS1、p-YAP、CD4、CD8、PD-L1)。
分析DNAJB4表达与肿瘤免疫浸润水平的相关性
基于TCGA-BRAC数据,使用GSVA、ESTIMATE和TIMER数据库进行免疫浸润相关性分析;在体内模型中通过免疫组化验证DNAJB4过表达对CD4+ T、CD8+ T细胞浸润和PD-L1表达的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | 文中未明确说明 | -- |
| 胎牛血清 | VivaCell | C0400 | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒 | Vazyme | RC112-01 |
| 逆转录试剂盒 | Vazyme | R323-01, | |
| Western blot | RIPA裂解液 | 文中未明确说明 | -- |
| BCA蛋白定量试剂 | 文中未明确说明 | -- | |
| 抗DNAJB4抗体 | Proteintech | 13064-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 抗磷酸化LATS1抗体 | CST | 8654 | |
| 抗LATS1抗体 | CST | 3477 | |
| 抗YAP抗体 | CST | 14074 | |
| 抗磷酸化YAP抗体 | CST | 13008 | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | CST | 14472 | |
| 抗N-钙黏蛋白抗体 | CST | 13116 | |
| 抗波形蛋白抗体 | CST | 46173 | |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | 72050 |
| 动物实验 | LATS抑制剂 | MCE | HY-138489 |
| 免疫组化 | DNAJB4抗体 | Proteintech | 13064-1-AP |
| PD-L1抗体 | Invitrogen | 14-5982-82 | |
| CD4抗体 | Affinity | DF16080 | |
| CD8抗体 | Affinity | AF5126 | |
| 细胞系 | MCF-7人乳腺癌细胞系 | Procell | -- |
| BT-549人乳腺癌细胞系 | Procell | -- | |
| SKBR3人乳腺癌细胞系 | Procell | -- | |
| MDA-MB-231人乳腺癌细胞系 | Procell | -- | |
| MCF-10A人正常乳腺上皮细胞系 | Procell | -- | |
| 4T1小鼠乳腺癌细胞系 | 文中未明确说明 | -- | |
| HEK293T人胚肾细胞系 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(MCF-7等购自Procell)、培养基组成(DMEM+10%FBS+1%青霉素/链霉素)、培养条件(5%CO2, 37°C) 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture |
| DNAJB4过表达 | 慢病毒转染MOI值(40)、转染试剂(Lipofectamine 3000) 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture |
| 细胞增殖实验 | CCK-8实验细胞数(5000/孔)和检测时间点(0,4,24,48,72h);集落形成实验细胞数(2000/孔)和培养时间(15天) 阅读提示:Materials and Methods - Cell proliferation assay |
| 细胞迁移实验 | 划痕实验细胞数(30000/孔)和检测时间点(6,12,24h) 阅读提示:Materials and Methods - Cell scratch assay |
| 双荧光素酶实验 | 质粒浓度(0.8 µg)、mimics浓度(100 nM)、共转染时间(48h) 阅读提示:Materials and Methods - Luciferase assay |
| 动物实验 | 小鼠品系(雌性BALB/c,5-6周)、细胞接种量(1×10^5)、给药剂量(10 mg/kg)、给药方式(瘤周注射,每日一次,持续7天)、每组动物数(8只) 阅读提示:Materials and Methods - Mouse xenograft assay |
| 免疫组化 | 抗体稀释比例及货号:DNAJB4 (1:100, 13064-1-AP)、PD-L1 (1:100, 14-5982-82)、CD4 (1:100, DF16080)、CD8 (1:100, AF5126) 阅读提示:Materials and Methods - Immunohistochemistry |
| Western blot | 抗体稀释比例:DNAJB4 (1:2000), GAPDH (1:1000), p-LATS1 (1:1000), LATS1 (1:1000), YAP (1:1000), p-YAP (1:1000), E-cadherin (1:1000), N-cadherin (1:1000), Vimentin (1:1000) 阅读提示:Materials and Methods - Western blot |