检测miR-2113在脓毒症模型中的表达
明确miR-2113在脓毒症相关模型中的表达变化。
用qRT-PCR检测不同浓度LPS诱导的MLE-12细胞、脓毒症患者血清和CLP小鼠肺组织中miR-2113的表达。
MiR-2113 overexpression attenuates sepsis-induced acute pulmonary dysfunction, inflammation and fibrosis by inhibition of HMGB1.
包括细胞模型(LPS诱导MLE-12)和动物模型(CLP小鼠),包含功能验证(CCK-8、流式)和机制验证(双荧光素酶报告基因、rescue实验)。
LPS诱导的MLE-12小鼠肺上皮细胞 盲肠结扎穿孔(CLP)诱导的脓毒症小鼠模型 脓毒症患者血清样本
细胞模型:MLE-12细胞,LPS浓度10 μg/ml处理24 h 动物模型:C57BL/6小鼠,CLP手术,agomir-miR-2113剂量30 mg/kg尾静脉注射 细胞转染:miR-2113 mimic 100 pmol,pcDNA-HMGB1 50 nM,Lipofectamine 3000 样本量:细胞实验至少三次独立重复;小鼠每组n=6 检测终点:miR-2113和HMGB1表达、细胞增殖、凋亡、炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)、纤维化标志物(α-SMA、FN、胶原I)、肺功能参数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确miR-2113在脓毒症相关模型中的表达变化。
用qRT-PCR检测不同浓度LPS诱导的MLE-12细胞、脓毒症患者血清和CLP小鼠肺组织中miR-2113的表达。
评估miR-2113过表达对LPS诱导的MLE-12细胞损伤的影响。
将miR-2113 mimic转染至LPS诱导的MLE-12细胞,检测细胞增殖、凋亡、炎症和纤维化标志物。
验证miR-2113是否靶向HMGB1及其在细胞损伤中的作用。
利用TargetScan预测miR-2113靶基因,双荧光素酶报告基因实验验证结合,Western blot检测HMGB1蛋白水平,并通过HMGB1过表达进行rescue实验。
评估miR-2113过表达对CLP诱导脓毒症小鼠肺损伤的影响。
通过尾静脉注射agomir-miR-2113至CLP小鼠,检测肺组织病理、细胞凋亡、肺功能、BALF中LDH和总蛋白、炎症和纤维化标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F12/DMEM培养基 | BasalMedia | SH30023.01 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 药物处理 | 脂多糖 | G-CLONE | CS0158 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000-015 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Absin | abs60154 |
| qRT-PCR | microRNA逆转录试剂盒 | EZBioscience | EZB-miRT3/EZB-miRT3-L |
| PrimeScript逆转录预混液 | TaKaRa | RR036A | |
| SYBR Green预混液 | TaKaRa | RR820A | |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Absin | abs50003 |
| 流式细胞术 | Annexin V结合缓冲液 | Procell | P-CA-151 |
| Annexin V-FITC/PI细胞凋亡检测试剂盒 | Procell | P-CA-201 | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037c |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0044c | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3063 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Genscript | M01215C | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Mlbio | ml095429 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab124964 | |
| 抗FN抗体 | Abcam | ab2413 | |
| 抗胶原I抗体 | Abcam | ab138492 | |
| 抗HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 | |
| 抗IL-1β抗体 | Abcam | ab254360 | |
| 抗IL-6抗体 | Abcam | ab233706 | |
| 抗TNF-α抗体 | Abcam | ab183218 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 二抗 | Abcam | ab205718 | |
| 免疫荧光实验 | 牛血清白蛋白 | Abcam | ab245930 |
| FITC标记二抗 | Abcam | ab7086 | |
| DAPI染料 | Abcam | ab285390 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pGL3载体 | Promega | -- |
| HE染色 | 伊红 | G-CLONE | CS1703 |
| TUNEL实验 | TUNEL检测试剂盒 | Abcam | ab206386 |
| 肺功能检测 | Buxco肺功能检测系统 | -- | -- |
| LDH检测 | LDH活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K046-M |
| Masson染色 | 天青石蓝染液 | Sbjbio | BP-DL008 |
| 丽春红酸性品红 | G-CLONE | RS1850 | |
| 磷钼酸 | G-CLONE | RS2780 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与药物处理 | MLE-12细胞来源(HyCyte),培养基F12/DMEM(10% FBS),LPS浓度10 μg/ml处理24 h 阅读提示:参见Materials and methods: 2.2 Cell culture and treatment |
| 细胞转染 | miR-2113 mimic 100 pmol,pcDNA-HMGB1 50 nM,Lipofectamine 3000,DNA与转染试剂比例1:1,转染48 h 阅读提示:参见Materials and methods: 2.3 Cell transfection |
| CLP动物模型 | C57BL/6小鼠(6-8周龄,雄性?未明确),CLP手术,agomir-miR-2113剂量30 mg/kg尾静脉注射,每组n=6 阅读提示:参见Materials and methods: 2.4 Construction of sepsis mouse model 和 Figure 4 legend |
| 肺功能检测 | 使用Buxco系统,麻醉后记录气道阻力、肺通气量、肺顺应性、潮气量、呼吸频率;湿干比检测 阅读提示:参见Materials and methods: 2.14 Analysis of acute pulmonary dysfunction in mice |
| BALF收集与检测 | BALF离心条件(400×g, 3 min),LDH检测使用ELISA试剂盒(E-BC-K046-M),总蛋白使用BCA试剂盒 阅读提示:参见Materials and methods: 2.4 和 2.15 |