体外细胞活力与增殖检测
评估β-谷甾醇对肝细胞癌细胞活力的影响
使用MTT、CCK-8、集落形成和EdU实验检测不同浓度β-谷甾醇处理后Huh-7和HCCLM3细胞的活力与增殖。
β-Sitosterol alleviates the malignant phenotype of hepatocellular carcinoma cells via inhibiting GSK3B expression.
包含体外细胞功能实验(增殖、凋亡、迁移、侵袭、EMT)及网络药理学和生信分析,但缺乏动物体内实验验证。
人肝细胞癌细胞系Huh-7 人肝细胞癌细胞系HCCLM3 GSE112790数据集 TCGA-LIHC数据库
β-谷甾醇浓度梯度:5, 10, 20 μg/mL 处理时间:24, 48, 72 h GSK3B过表达载体转染,浓度1 μg/ml GSK3B抑制剂CHIR-98014浓度:50 nM,处理48 h 生物学重复次数:N=3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估β-谷甾醇对肝细胞癌细胞活力的影响
使用MTT、CCK-8、集落形成和EdU实验检测不同浓度β-谷甾醇处理后Huh-7和HCCLM3细胞的活力与增殖。
检测β-谷甾醇对细胞周期和凋亡的影响
使用流式细胞术检测细胞周期和凋亡,Western blot检测凋亡相关蛋白表达。
评估β-谷甾醇对细胞迁移和侵袭能力的影响
使用划痕实验和Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力。
评估β-谷甾醇对EMT标志物表达的影响
Western blot检测E-cadherin、N-cadherin、Snail和Vimentin蛋白水平。
筛选β-谷甾醇的靶基因并分析其临床意义
从PubChem获取β-谷甾醇靶基因,并在GSE112790和TCGA-LIHC数据库中分析GSK3B表达、预后和诊断价值。
验证GSK3B是否介导β-谷甾醇的作用
转染GSK3B过表达载体后,检测细胞增殖、周期、凋亡和侵袭变化,并观察β-谷甾醇效应的变化。
比较β-谷甾醇与GSK3B抑制剂的效应及联合作用
使用CHIR-98014和/或β-谷甾醇处理细胞,检测GSK3B蛋白水平、增殖、周期、凋亡和侵袭。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | β-谷甾醇 | Sigma-Aldrich | -- |
| CHIR-98014 | MedChem Express | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| GSK3B过表达质粒 | Oribio | -- | |
| 无缝克隆试剂盒 | Beyotime | -- | |
| MTT实验 | MTT试剂 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| EdU实验 | EdU细胞增殖检测试剂盒 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd | -- |
| 流式细胞术 | PI染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| Annexin V-PI双染试剂盒 | Nanjing Keygen Biotech CO., Ltd | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Merck Millipore | -- | |
| 抗BAX抗体 | -- | -- | |
| 抗BCL2抗体 | -- | -- | |
| 抗cleaved caspase3抗体 | -- | -- | |
| 抗total caspase3抗体 | -- | -- | |
| 抗E-cadherin抗体 | -- | -- | |
| 抗Snail抗体 | -- | -- | |
| 抗Vimentin抗体 | -- | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | -- | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Abcam | ab6721 | |
| 增强化学发光试剂 | New Cell & Molecular Biotech Co., Ltd. | -- | |
| 细胞活力检测 | 多功能酶标仪 | PerkinElmer | -- |
| 集落形成实验 | 光学显微镜 | Nikon | -- |
| EdU实验 | 倒置荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、抗生素浓度 阅读提示:Methods: Cell treatment and transfection |
| 药物处理 | β-谷甾醇浓度、处理时间、溶剂对照 阅读提示:Methods: Cell treatment and transfection; 图1-3图注 |
| GSK3B敲除/过表达 | 转染试剂、质粒浓度、转染时间 阅读提示:Methods: Cell treatment and transfection; 图5图注 |
| 抑制剂处理 | CHIR-98014浓度、处理时间 阅读提示:Methods: Cell treatment and transfection; 图6图注 |
| 流式细胞术 | 细胞周期检测的染色试剂、细胞密度、固定条件;凋亡检测的染色试剂和孵育时间 阅读提示:Methods: Flow cytometry |
| Western blot | 抗体稀释度、孵育时间、内参基因 阅读提示:Methods: Western blot; Table S1 |
| 统计分析 | 统计学方法、显著性水平、重复数 阅读提示:Methods: Statistical analysis |