临床样本和细胞系中miR-494-3p表达分析
验证miR-494-3p在胃癌中的表达上调,为靶向该miRNA提供依据。
通过qPCR检测22例胃癌组织及22例正常组织,以及5种胃癌细胞系和正常胃细胞GES-1中的miR-494-3p水平。
Suppression of gastric cancer cell proliferation by miR-494-3p inhibitor-loaded engineered exosomes.
包含体外细胞实验(外泌体表征、内吞、功能验证)和临床组织样本表达分析,但缺乏体内动物模型验证。
人胃癌细胞系HGC27 人正常胃细胞系GES-1 胃癌组织及正常组织样本(各22例)
外泌体分离来源:人骨髓间充质干细胞,使用Umibio试剂盒提取 电穿孔参数:500 nmol inhibitor与500 μL电穿孔缓冲液混合,200 V、100 μF 外泌体与细胞共培养的剂量和时间:PKH26标记外泌体与HGC27共培养,EdU实验中处理至少6小时 细胞分组:PBS组、未负载外泌体组、miR-494-3p抑制剂外泌体组 统计学:三次独立重复,t检验或单因素方差分析,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-494-3p在胃癌中的表达上调,为靶向该miRNA提供依据。
通过qPCR检测22例胃癌组织及22例正常组织,以及5种胃癌细胞系和正常胃细胞GES-1中的miR-494-3p水平。
构建负载miR-494-3p抑制剂的外泌体,并验证其形态、大小、标志物和包封效率。
从人骨髓间充质干细胞提取外泌体,通过电穿孔法负载miR-494-3p抑制剂;用TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blot检测外泌体标志物,qPCR检测miR-494-3p表达量。
确认工程化外泌体能够被胃癌细胞摄取,并有效降低细胞内miR-494-3p水平。
用PKH26标记外泌体,与HGC27细胞共培养,通过共聚焦显微镜可视化内吞;qPCR检测细胞内miR-494-3p水平变化。
评估miR-494-3p抑制剂外泌体对胃癌细胞增殖和凋亡的影响。
通过EdU实验检测细胞增殖;通过流式细胞术检测凋亡率;通过Western blot检测凋亡相关蛋白(Bax、Bcl-2、cleaved-caspase 3/9)表达。
评估miR-494-3p抑制剂外泌体对胃癌细胞迁移和侵袭能力的影响。
通过伤口愈合实验评估细胞迁移;通过Transwell实验评估迁移和侵袭(使用基质胶包被);通过Western blot检测转移相关蛋白(SOX7、MMP2、MMP9)表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F12K培养基 | Biological Industries | -- |
| 青霉素/链霉素 | Yeasen | -- | |
| 胎牛血清 | Royacel | -- | |
| 外泌体提取 | 外泌体提取试剂盒 | Umibio | -- |
| 外泌体表征 | 透射电子显微镜 | FEI | Tecnai |
| ZetaView PMX 110纳米颗粒分析仪 | -- | -- | |
| 外泌体标记 | PKH26染色缓冲液 | Umibio | -- |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| 电穿孔负载 | miR-494-3p抑制剂 | Ribobio | -- |
| 电穿孔缓冲液 | BTX | -- | |
| MicroPulser电穿孔仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取与qPCR | TRIzol缓冲液 | Multi Sciences | -- |
| 逆转录PCR试剂盒 | Yeasen | -- | |
| qPCR | PerfectStart SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-7AAD凋亡检测试剂盒 | -- | -- |
| 流式细胞仪 | BD | Canto | |
| 增殖检测 | EdU试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| Hoechst 33342 | Fcmacs | -- | |
| 荧光显微镜 | Olympus | CKX53 | |
| 迁移/侵袭检测 | Transwell小室 | Merck | 8 |
| 基质胶 | -- | -- | |
| 结晶紫 | Alladin | -- | |
| Western blot | 蛋白提取试剂盒 | Tiangen Biotech | -- |
| 硝酸纤维素膜 | Whatman | -- | |
| Bax一抗 | Arigo | 66247 | |
| Bcl-2一抗 | Arigo | 55188 | |
| Cleaved-caspase3一抗 | Arigo | 57512 | |
| Cleaved-caspase9一抗 | Cell Signaling Technology | 9505 | |
| MMP2一抗 | Arigo | 56426 | |
| MMP9一抗 | Arigo | 54980 | |
| β-actin一抗 | Arigo | 62346 | |
| 抗兔HRP标记IgG二抗 | Arigo | ARG65351 | |
| 抗小鼠二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| Clarity Western ECL试剂盒 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 胃癌组织和正常组织各22例,来源于哈尔滨医科大学附属肿瘤医院,患者未接受术前治疗,年龄18-70岁,组织储存于-80°C 阅读提示:Materials and methods, 2.1 Clinical tissue collection |
| 细胞培养 | 细胞系来源(Procell),培养基F12K添加10%FBS和1%青霉素/链霉素,培养条件37°C、5%CO2 阅读提示:Materials and methods, 2.2 Cell |
| 外泌体提取与表征 | 外泌体提取试剂盒(Umibio),细胞处理16小时4°C,TEM和NTA条件;标志物TSG101、CD63;负载miR-494-3p抑制剂后粒径约100nm 阅读提示:Materials and methods, 2.3-2.6; 图2 |
| 电穿孔负载条件 | 500 nmol miR-494-3p inhibitor与500μL电穿孔缓冲液混合,200V、100μF,0.4cm电极杯;离心去除未负载(4°C、100,000g、70min) 阅读提示:Materials and methods, 2.6 Loading of miR-494-3p inhibitor |
| 细胞功能实验 | HGC27细胞分组(PBS、未负载外泌体、miR-494-3p抑制剂外泌体);EdU实验细胞密度4×10^4/well,处理至少6h;凋亡实验2×10^5细胞,Annexin V-7AAD;迁移侵袭Transwell 2×10^4细胞/300μL,24h孵育;伤口愈合划痕后48h评估 阅读提示:Materials and methods, 2.8-2.11; 图4和图5 |
| 蛋白检测 | 蛋白上样量35μg,10% SDS-PAGE,抗体信息(Bax等),内参β-actin 阅读提示:Materials and methods, 2.12 Western blot |
| 统计分析 | 三次独立重复,数据以平均值±标准差表示;两组比较用t检验,多组用单因素方差分析;显著性P<0.05 阅读提示:Materials and methods, 2.13 Statistical analysis |