临床样本及数据库分析
评估CBLC在结直肠癌组织中的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
利用GEPIA和TNMplot数据库分析CBLC表达,并通过qPCR、Western blotting和IHC检测22对新鲜CRC组织及40个石蜡包埋CRC样本中的CBLC表达。
CBLC promotes the development of colorectal cancer by promoting ABI1 degradation to activate the ERK signaling pathway.
研究包含临床样本分析、体外细胞功能实验(CCK-8、集落形成、流式、划痕、Transwell)、体内异种移植模型、Co-IP及泛素化实验等多层级验证,并明确进行了功能验证和机制验证。
HCT116细胞系 LOVO细胞系 BALB/c裸鼠异种移植模型 临床CRC组织样本
HCT116和LOVO细胞系中CBLC过表达和敲低的效率验证 异种移植实验中BALB/c裸鼠的周龄(5周龄)、分组(每组12只)及注射细胞数(2×10^6) CBLC与ABI1的结合及相互作用验证 MG132处理浓度(20µM)和时间(6小时)对ABI1泛素化水平的影响 ABI1过表达对CBLC诱导的细胞增殖、迁移和侵袭表型的逆转效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CBLC在结直肠癌组织中的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
利用GEPIA和TNMplot数据库分析CBLC表达,并通过qPCR、Western blotting和IHC检测22对新鲜CRC组织及40个石蜡包埋CRC样本中的CBLC表达。
验证CBLC对CRC细胞增殖、细胞周期、迁移和侵袭的影响。
在HCT116和LOVO细胞中通过慢病毒感染实现CBLC过表达和敲低,然后进行CCK-8增殖实验、集落形成实验、流式细胞术细胞周期分析、划痕实验和Transwell侵袭实验。
验证CBLC对CRC细胞体内肿瘤生长和肺转移的影响。
将CBLC过表达或敲低的HCT116和LOVO细胞皮下注射或尾静脉注射入BALB/c裸鼠,监测肿瘤生长和肺转移情况,并通过IHC和Western blotting分析肿瘤组织标志物。
验证CBLC是否激活ERK信号通路。
通过Western blotting检测ERK和p-ERK蛋白水平,并通过免疫荧光检测p-ERK的核转位。
验证CBLC是否通过其泛素连接酶活性促进ABI1的泛素化和降解。
通过双重免疫荧光检测CBLC和ABI1的共定位,通过Co-IP验证CBLC和ABI1的结合,并用MG132处理细胞后检测ABI1的泛素化水平。
验证ABI1是否介导CBLC在CRC中的作用。
在CBLC过表达的HCT116细胞中同时过表达ABI1,然后评估细胞增殖、集落形成、细胞周期、迁移、侵袭以及ERK磷酸化水平的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | McCOY's 5A培养基 | Procell | -- |
| F12K培养基 | Servicebio | -- | |
| 胎牛血清 | Tianhang Biotechnology | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK8试剂 | KeyGEN Biotech | -- |
| 集落形成实验 | 瑞氏-吉姆萨复合染色液 | KeyGEN Biotech | -- |
| 细胞周期分析 | PI/RNase A染色液 | KeyGEN Biotech | -- |
| NovoCyte流式细胞仪 | Agilent | -- | |
| Transwell实验 | Matrigel基质胶 | Corning | -- |
| 0.5%结晶紫溶液 | Amresco | -- | |
| 免疫组织化学 | CBLC抗体 | Sigma | SAB2900314 |
| Ki-67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 山羊抗兔IgG-HRP二抗 | ThermoFisher | 31460 | |
| 免疫荧光 | p-ERK抗体 | Abclonal | A18196 |
| 山羊抗兔IgG-Cy3二抗 | Abcam | ab6939 | |
| 免疫荧光双染 | ABI1抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig |
| 山羊抗小鼠IgG-Cy3二抗 | Abcam | ab97035 | |
| 山羊抗兔IgG-FITC二抗 | Abcam | ab6717 | |
| qPCR | TRIpure试剂 | BioTeke Corporation | -- |
| BeyoRT II M-MLV逆转录酶 | Beyotime | -- | |
| SYBR Green qPCR试剂盒 | Solarbio | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Solarbio | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ERK抗体 | Invitrogen | 13-6200 | |
| CDK1抗体 | ABclonal | A22347 | |
| 细胞周期蛋白B抗体 | Proteintech | 55004-1-AP | |
| E-钙粘蛋白抗体 | ABclonal | A20798 | |
| 波形蛋白抗体 | ABclonal | A19607 | |
| 山羊抗兔IgG-HRP二抗 | Solarbio | SE134 | |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP二抗 | Solarbio | SE131 | |
| 增强化学发光试剂 | Solarbio | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Proteintech | -- |
| 泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | CBLC表达与TNM分期的相关性(p=0.0053) 阅读提示:参考Results部分'CBLC expression was upregulated in CRC tissues'及Table 1 |
| 细胞培养 | HCT116细胞使用McCOY's 5A培养基,LOVO细胞使用F12K培养基,均含10% FBS 阅读提示:参考Materials and methods部分'Cell culture' |
| 慢病毒感染 | CBLC shRNA序列及载体pLVX-shRNA1和pLVX-IRES-puro 阅读提示:参考Materials and methods部分'Lentivirus infection' |
| 体外功能实验 | CCK-8实验(5×10^3细胞/孔,48h)、集落形成(300细胞/皿,2周)、细胞周期(5×10^5细胞/孔)、划痕(5×10^5细胞/孔,24h)、Transwell(5×10^4细胞/孔) 阅读提示:参考Materials and methods部分'CCK8 assay'至'Transwell' |
| 体内动物模型 | BALB/c裸鼠(5周龄),每组12只,皮下注射2×10^6细胞,30天;尾静脉注射2×10^6细胞,22天 阅读提示:参考Materials and methods部分'Xenograft tumor model' |
| 机制验证 | Co-IP实验抗体(CBLC和ABI1)、泛素化实验MG132处理(20µM,6h) 阅读提示:参考Materials and methods部分'Co-immunoprecipitation (Co-IP) and ubiquitination assay' |